法洛四联症相关心脏组织表达数据
该数据集为NCBI GEO来源的GSE146220,标题为法洛四联症相关心脏组织表达数据,属于循环系统疾病分类。该SuperSeries由若干SubSeries组成,可用于法洛四联症心脏组织的基因表达分析,支持疾病相关表达模式比较与分类研究(来源 NCBI)

基本信息
资源简介
法洛四联症相关心脏组织表达数据
GSE146220 是来自 NCBI GEO 的一个基因表达数据集,标题为“Expression data in Heart Tissue associated with Tetralogy of Fallot”,即与法洛四联症相关的心脏组织表达数据。该数据集在分类上归属于循环系统疾病下的“其他”类别,主题涉及芯片表达谱分析,物种标注为人类(9606),平台编号为 GPL20115。数据集以 SuperSeries 形式组织,由若干 SubSeries 组成,共提供 1 个文件,样例文件为 GSE146220_series_matrix.txt.gz。该数据集可用于法洛四联症心脏组织的基因表达分析,支持疾病相关表达模式的比较与分类研究,数据来源为 NCBI。
【数据集背景】
法洛四联症是一种先天性心脏畸形,涉及心脏结构与功能的多种异常。该数据集聚焦于法洛四联症患者心脏组织的基因表达情况,旨在通过表达谱数据刻画疾病状态下心脏组织的转录特征。数据集标题明确指向“Heart Tissue”(心脏组织)与“Tetralogy of Fallot”(法洛四联症)的关联,说明其设计目标是为该疾病的心脏组织表达研究提供数据基础。数据集以 SuperSeries 形式发布,源站描述指出该 SuperSeries 由下列 SubSeries 组成,表明其内容是对多个子系列数据的整合组织,便于研究者从整体层面获取与法洛四联症相关的表达数据资源。
【数据内容】
该数据集提供的文件数量为 1,文件样例为 GSE146220_series_matrix.txt.gz,即一个 GZIP 压缩格式的系列矩阵文件。系列矩阵文件通常承载样本层面的表达数据及其相关注释信息,是本数据集可直接获取的数据载体。主题标签显示其属于“Expression profiling by array”(芯片表达谱分析),平台编号为 GPL20115,物种为 9606(人类)。数据集作者为 Lin、Liu,发布时间标注为 Mar 02 202。除上述信息外,样本数量、分组构成、具体基因数量等细节源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 NCBI GEO(ncbi.nlm.nih.gov),源站标题与数据集英文名一致,均为“Expression data in Heart Tissue associated with Tetralogy of Fallot”。数据以 SuperSeries 形式组织,源站描述说明其由若干 SubSeries 组成。数据集的作者信息为 Lin、Liu,发布时间为 Mar 02 202。关于样本采集的具体地点、时间跨度、临床信息以及实验操作的详细流程,源站未提供。
【适用场景】
基于其主题与数据类型,该数据集适用于法洛四联症心脏组织的基因表达分析,可用于疾病相关表达模式的比较与分类研究。研究者可以借助芯片表达谱数据,考察法洛四联症心脏组织中基因表达的整体特征,并在此基础上开展不同样本或分组之间的表达模式对比。由于数据集以 SuperSeries 形式整合了若干 SubSeries,其组织方式也便于按子系列进行分层分析或整体汇总分析。需要说明的是,具体的研究设计细节与可支持的统计比较方式,需以实际数据文件内容为准,源站未提供进一步的说明。
【使用方法】
使用该数据集时,首先应下载数据文件 GSE146220_series_matrix.txt.gz。该文件为 GZIP 压缩包,需按相应格式解压并读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认数据读取无误、字段含义清晰之后,再进行批量接入与后续分析。由于系列矩阵文件通常包含样本信息与表达值等内容,读取时应关注行列表头的组织方式以及注释信息的对应关系。关于具体的分析流程、标准化方法与统计模型,源站未提供,需由使用者根据研究目的自行确定。
【质量与限制】
该数据集仅提供 1 个文件,即系列矩阵压缩文件,数据规模与样本构成的具体信息源站未提供。数据集以 SuperSeries 形式发布,由若干 SubSeries 组成,使用者在使用时需注意子系列与整体数据之间的层次关系。关于数据质量评估、缺失值情况、批次效应以及平台 GPL20115 的具体技术参数,源站未提供。发布时间标注为 Mar 02 202,其余时间相关信息源站未提供。使用者在开展分析前应自行核查数据完整性与适用性。
【引用与许可】
该数据集来源于 NCBI GEO,作者为 Lin、Liu,发布时间为 Mar 02 202。关于数据集的引用格式、使用许可条款以及再分发要求,源站未提供。使用者在引用或再利用该数据集时,应遵循来源站 NCBI 的相关规定,并以源站页面信息为准。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE146220
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
This SuperSeries is composed of the SubSeries listed below.
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