法洛四联症心脏组织lncRNA与mRNA表达数据
该数据集来自NCBI GEO，包含法洛四联症（TOF）患儿右心室流出道组织与正常胎儿心脏组织的lncRNA和mRNA表达谱数据，共5例TOF患儿和5例正常胎儿样本
基本信息
资源简介
法洛四联症心脏组织lncRNA与mRNA表达数据
GSE146218 是一个来自 NCBI GEO 的基因表达谱数据集，主题为法洛四联症（Tetralogy of Fallot，TOF）相关心脏组织中的长链非编码 RNA（lncRNA）与信使 RNA（mRNA）表达数据。该数据集收录了法洛四联症患儿右心室流出道组织与正常胎儿心脏组织的 lncRNA 和 mRNA 表达谱，样本包括 5 例无其他心内及心外畸形的 TOF 患儿和 5 例正常胎儿。数据集以芯片表达谱分析为主要技术路线，平台编号为 GPL20115，物种为人类（9606）。数据集提供 1 个数据文件，即 GSE146218_series_matrix.txt.gz，以 GZIP 压缩格式分发，可供研究者下载后用于差异表达分析与分子机制探索。
【数据集背景】
法洛四联症是常见的先天性心脏病之一，其分子层面的改变，尤其是非编码 RNA 的调控作用，是理解疾病发生发展机制的重要方向。该数据集所对应的研究目标，是在无其他心内和心外畸形的 TOF 患儿与正常胎儿之间，系统识别右心室流出道组织中 mRNA 与 lncRNA 的全局表达谱差异，从而为后续筛选关键分子、构建调控网络提供数据基础。数据集由 Hongdan Wang 提交，发布时间为 2020 年 3 月 2 日，来源站点为 ncbi.nlm.nih.gov，本站归类于循环系统疾病 / 其他。
【数据内容】
数据集包含 1 个文件，文件名为 GSE146218_series_matrix.txt.gz，为 GZIP 压缩的系列矩阵文件，通常用于承载样本层面的表达值矩阵及样本注释信息。数据覆盖两类 RNA：mRNA 与 lncRNA，均来自心脏组织样本。样本构成明确：5 例 TOF 患儿右心室流出道组织与 5 例正常胎儿心脏组织，合计 10 个样本。主题标签包括 Expression profiling by array、GPL20115 与 9606，表明数据基于芯片表达谱技术、使用 GPL20115 平台、物种为人类。数据集中具体包含多少探针或基因、表达值经过何种归一化处理、样本的详细临床信息等，源站未提供。
【采集与来源】
数据来源于 NCBI GEO 数据库，源站标题为“lncRNA and mRNA expression data in Heart Tissue associated with Tetralogy of Fallot”。研究采集的组织为右心室流出道组织，病例组为 5 例不伴其他心内和心外畸形的 TOF 儿童，对照组为 5 例正常胎儿。样本的采集时间、地点、伦理审批信息、RNA 提取与芯片杂交的具体实验流程等，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于先天性心脏病特别是法洛四联症的转录组层面研究，可用于比较 TOF 与正常心脏组织中 mRNA 和 lncRNA 的表达差异，筛选候选差异表达基因与非编码 RNA，开展 lncRNA-mRNA 共表达或调控网络分析，也可作为相关分子机制研究的验证数据来源。此外，该数据可用于方法学层面的表达谱分析流程测试与教学演示。由于样本量较小，更适合探索性分析而非大样本统计推断。
【使用方法】
使用时可先下载数据文件 GSE146218_series_matrix.txt.gz，按 GZIP 压缩包格式解压并读取。建议先在小样本上核对字段结构、样本分组与编码方式，确认注释信息与表达值对应无误后，再批量接入分析流程。分析时可结合 GPL20115 平台注释信息将探针映射到基因或转录本，并区分 mRNA 与 lncRNA 两类分子开展差异分析。具体的分析参数与软件选择，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集的样本量为 5 例 TOF 患儿与 5 例正常胎儿，属于小样本设计，统计效力有限，结果解释需谨慎。病例组为儿童、对照组为胎儿，两组在发育阶段上存在差异，可能对表达谱比较产生影响。数据仅涉及右心室流出道组织，结论外推到其他心脏部位或其他类型先天性心脏病时需谨慎。数据文件数量为 1，未提供原始芯片数据或其他配套文件。数据是否经过标准化、质控指标如何、是否存在批次效应等，源站未提供。
【引用与许可】
数据集作者为 Hongdan Wang，来源站点为 NCBI GEO，发布时间为 2020 年 3 月 2 日。使用时应引用该数据集及其对应的 GEO 记录。数据的具体许可条款与使用限制，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE146218
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
本研究旨在识别5例无其他心内外畸形的TOF患儿与5例正常胎儿右心室流出道组织样本中的全局信使RNA（mRNA）和长链非编码RNA（lncRNA）表达谱。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失？
依托陕西、四川两大基地，我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系，覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程，为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务？立即联系我们获取专业方案。
