ToF-PVR患者成人心肌表达数据

该数据集来自 NCBI GEO,包含接受肺动脉瓣置换术的法洛四联症成人患者右心室心肌与未使用供体心脏右心室心肌的表达谱芯片数据,共 1 个文件(GSE141955_series_matrix.txt.gz),平台为 GPL17586,物种为 9606

geo
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其他分类Expression profiling by arrayGPL175869606
GSE141955: Expression data from adult myocardium of ToF-PVR patients undergoing pulmonary valve replacement

基本信息

模态
其他
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-27

资源简介

ToF-PVR患者成人心肌表达数据

该数据集为 NCBI GEO 收录的表达谱芯片数据集,英文名称为 GSE141955: Expression data from adult myocardium of ToF-PVR patients undergoing pulmonary valve replacement,主题为接受肺动脉瓣置换术的法洛四联症成人患者心肌表达数据。数据集比较成人法洛四联症患者接受肺动脉瓣置换术后的右心室心肌与未使用供体心脏的右心室心肌,共包含 1 个文件(GSE141955_series_matrix.txt.gz),采用 GPL17586 平台,物种为 9606(人类),作者为 Daniel Brayson,发布时间为 Dec 12 201。该数据集属于循环系统疾病 / 其他分类,可为相关心肌表达谱研究提供数据基础。

【数据集背景】

法洛四联症是最常见的紫绀型先天性心脏病之一,患者在接受根治术后常需长期随访,部分成人患者因肺动脉瓣反流等问题需要接受肺动脉瓣置换术。该数据集聚焦于这一临床情境,旨在提供接受肺动脉瓣置换术的成人法洛四联症患者右心室心肌的表达谱数据,并与未使用供体心脏的右心室心肌进行对照,从而为理解该人群心肌的分子特征提供数据资源。数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov,属于 NCBI GEO 公共数据库中的表达谱芯片数据集。

【数据内容】

该数据集包含 1 个数据文件,文件样例为 GSE141955_series_matrix.txt.gz,格式为 GZIP 压缩包。数据内容为表达谱芯片数据,平台为 GPL17586,物种为 9606。数据集主题标签包括 Expression profiling by array、GPL17586 和 9606。数据覆盖的样本类型为接受肺动脉瓣置换术的成人法洛四联症患者右心室心肌,以及未使用供体心脏的右心室心肌。关于样本数量、分组细节、探针数量及具体表达矩阵内容,源站未提供。

【采集与来源】

数据来源于 NCBI GEO(ncbi.nlm.nih.gov),源站标题为 Expression data from adult myocardium of ToF-PVR patients undergoing pulmonary valve replacement。源站描述指出,该数据集比较接受肺动脉瓣置换术的法洛四联症成人患者右心室与未使用供体心脏的右心室心肌。作者为 Daniel Brayson,发布时间为 Dec 12 201。关于样本采集的具体流程、伦理审批信息、临床特征及实验操作细节,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于研究法洛四联症成人患者在接受肺动脉瓣置换术时右心室心肌的表达谱特征,并可与未使用供体心脏的右心室心肌进行对照分析。潜在用途包括差异表达分析、心肌分子机制探索以及与其他心脏疾病表达谱数据的比较研究。由于数据集仅包含 1 个文件,适合作为特定临床情境下的表达谱数据资源使用。关于该数据集在其他具体研究方向上的适用性,源站未提供。

【使用方法】

使用该数据集时,首先下载数据文件 GSE141955_series_matrix.txt.gz。该文件为 GZIP 压缩包,需按相应格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入分析流程。分析时可结合平台信息 GPL17586 与物种信息 9606 进行注释与解读。关于具体的分析流程、标准化方法及统计方案,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集仅包含 1 个文件,数据规模有限。关于样本量、数据完整性、缺失值情况、批次效应及质量控制指标,源站未提供。使用时应注意数据集仅覆盖接受肺动脉瓣置换术的成人法洛四联症患者右心室心肌与未使用供体心脏右心室心肌的比较,其结论外推至其他人群或其他心脏疾病时需谨慎。关于数据的其他质量相关信息,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集的作者为 Daniel Brayson,发布时间为 Dec 12 201。关于引用方式、许可协议及使用限制,源站未提供。使用者在引用或再利用该数据集时,应遵循 NCBI GEO 的相关规定,并建议查阅源站页面获取最新的引用与许可信息。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE141955

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

我们使用微芯片技术,比较了接受肺动脉瓣置换术的法洛四联症患者成人右心室与未使用供体心脏右心室心肌之间的基因表达,以确定两组间是否存在差异。

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