心肌梗死患者与健康人表达数据

该数据集来自 NCBI GEO,包含心肌梗死患者与健康人的基因表达谱数据,采用芯片表达谱技术,涉及 GPL17586 平台与人类样本(9606)

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时间序列分类Expression profiling by arrayGPL175869606
GSE141512: Expression data for patients with myocardial infarction (MI) vs healthy patients

基本信息

模态
时间序列
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-27

资源简介

心肌梗死患者与健康人表达数据

Expression data for patients with myocardial infarction (MI) vs healthy patients

该数据集来自 NCBI GEO,包含心肌梗死患者与健康人的基因表达谱数据,采用芯片表达谱技术,涉及 GPL17586 平台与人类样本(9606)。源站描述指出,冠状动脉疾病的核心病理是慢性血管炎症,但 T、B、NK 淋巴细胞及单核细胞等免疫细胞在 CAD 与 MI 过程中的变化机制尚不清楚,细胞内信号通路失调可能是致病机制之一。数据可用于比较 MI 与健康样本的表达差异,探索免疫细胞相关信号通路变化,并支撑分类建模等分析(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Dec 05 201。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):心肌梗死(MI)是冠状动脉疾病(CAD)最严重的表现之一,也是全球非传染性疾病致死的主要原因。已知 CAD 发病机制的核心组成部分是慢性血管炎症。然而,在 CAD 和 MI 过程中,T、B 和 NK 淋巴细胞、单核细胞及其他免疫细胞所发生变化背后的机制仍知之甚少。其中一种致病机制可能是免疫细胞内信号通路的失调。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:Expression profiling by array、GPL17586、9606。本站分类:循环系统疾病/其他。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE141512

【使用注意】

· 源站最后修改于 Jun 16 202,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

心肌梗死(MI)是冠状动脉疾病(CAD)最严重的表现形式之一,也是全球非传染性疾病致死的主要原因。已知CAD发病机制的核心环节是慢性血管炎症。然而,CAD和MI期间T淋巴细胞、B淋巴细胞、NK淋巴细胞、单核细胞及其他免疫细胞所发生变化的潜在机制仍知之甚少。其中一种可能的致病机制是免疫细胞内信号通路的失调。在本研究中,我们对MI患者和健康个体的外周血单个核细胞进行了转录组分析。随后采用机器学习算法寻找MI相关特征,这些特征可反映细胞内信号通路的失调,并有助于MI的诊断和/或预后判断。ADAP2、KLRC1、MIR21、PDGFD和CD14基因被确定为具有L1范数惩罚函数的分类模型中最重要的特征。在测试数据上,该分类器的输出质量经受试者工作特征指标评估为0.911。

这些结果在两个独立的公开GEO数据集上得到了验证。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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