GSE134725：参与心脏Kcnh2调控的转录远端增强子的鉴定与表征

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE134725

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

人类ether-a-go-go相关基因KCNH2编码构成IKr的电压门控钾通道，该电流对心脏动作电位的复极阶段至关重要。KCNH2突变导致复极电流减少，可引发与长QT综合征相关的心律失常。本研究探讨了这一关键心脏基因的调控机制，并在Kcnh2基因座中鉴定出多个活性增强子。位于Kcnh2下游约85 kbp的一个增强子在体内以心脏特异性方式与两个Kcnh2异构体的启动子发生物理接触。敲低受该增强子调控的非编码RNA（ncRNA）可在体外导致Kcnh2b及两个邻近mRNA（Nos3和Abcb8）表达降低。从小鼠基因组中删除该增强子（包括ncRNA转录起始位点）可导致心室中Kcnh2a和Kcnh2b的轻度下调。这些发现表明，Kcnh2a和Kcnh2b的调控受一个复杂的调控格局所支配，该格局涉及多个部分冗余发挥作用的增强子。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。