环状RNA hsa_circ_001879和hsa_circ_004104作为冠状动脉疾病新型生物标志物的鉴定
该数据集来自NCBI GEO,采用微阵列对24例冠状动脉疾病(CAD)患者和7例对照的circRNA表达谱进行检测,并利用六种分类器评估候选circRNA生物标志物,随后在大规模队列中用qRT-PCR验证候选circRNA的表达水平,通过逻辑回归分析和受试者工作特征曲线评估诊断价值

基本信息
资源简介
环状RNA hsa_circ_001879和hsa_circ_004104作为冠状动脉疾病新型生物标志物的鉴定
Identification of circular RNA hsa_circ_001879 and hsa_circ_004104 as novel biomarkers for coronary artery disease
该数据集来自NCBI GEO,采用微阵列对24例冠状动脉疾病(CAD)患者和7例对照的circRNA表达谱进行检测,并利用六种分类器评估候选circRNA生物标志物,随后在大规模队列中用qRT-PCR验证候选circRNA的表达水平,通过逻辑回归分析和受试者工作特征曲线评估诊断价值。数据覆盖CAD患者与对照的circRNA表达谱,可用于筛选和验证CAD相关的环状RNA生物标志物(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Jun 13 201。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):通过微阵列对24例CAD患者和7例对照的circRNA谱进行检测。使用六种分类器评估潜在的circRNA生物标志物。在大规模队列中通过qRT-PCR进一步验证候选circRNA的表达水平。进行逻辑回归分析和受试者工作特征曲线以评估诊断价值。与对照相比,CAD患者中分别有624个circRNA和171个circRNA显著上调和下调。使用六种不同分类器鉴定出一个四circRNA特征。在这四个circRNA中,发现hsa_circ_001879和hsa_circ_004104在验证队列中显著上调。我们提供了CAD患者中异常表达circRNA的全转录组概览,并且hsa_circ_001879和hsa_circ_004104被重复并鉴定为在C中显著上调
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:Non-coding RNA profiling by array、GPL22121、9606。本站分类:循环系统疾病/其他。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE115733
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jul 10 202,引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
采用微阵列技术对24例CAD患者和7例对照者的circRNA谱进行了检测。使用六种分类器评估潜在的circRNA生物标志物。在大规模队列中通过qRT-PCR进一步验证候选circRNA的表达水平。采用逻辑回归分析和受试者工作特征曲线评估诊断价值。与对照组相比,CAD患者中有624个circRNA显著上调,171个circRNA显著下调。利用六种不同的分类器鉴定出一个由四个circRNA组成的特征谱。在这四个circRNA中,hsa_circ_001879和hsa_circ_004104在验证队列中显著上调。我们提供了CAD患者中异常表达circRNA的全转录组概览,并重复验证了hsa_circ_001879和hsa_circ_004104在CAD患者中显著上调。我们的结果表明,hsa_circ_001879和hsa_circ_004104可能作为CAD的诊断生物标志物。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托三甲直采网络,提供合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




