环状RNA hsa_circ_001879和hsa_circ_004104作为冠状动脉疾病新型生物标志物的鉴定

该数据集来自NCBI GEO,采用微阵列对24例冠状动脉疾病(CAD)患者和7例对照的circRNA表达谱进行检测,并利用六种分类器评估候选circRNA生物标志物,随后在大规模队列中用qRT-PCR验证候选circRNA的表达水平,通过逻辑回归分析和受试者工作特征曲线评估诊断价值

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基因组分类Non-coding RNA profiling by arrayGPL221219606
GSE115733: Identification of circular RNA hsa_circ_001879 and hsa_circ_004104 as novel biomarkers for coronary artery disease

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-27

资源简介

环状RNA hsa_circ_001879和hsa_circ_004104作为冠状动脉疾病新型生物标志物的鉴定

Identification of circular RNA hsa_circ_001879 and hsa_circ_004104 as novel biomarkers for coronary artery disease

该数据集来自NCBI GEO,采用微阵列对24例冠状动脉疾病(CAD)患者和7例对照的circRNA表达谱进行检测,并利用六种分类器评估候选circRNA生物标志物,随后在大规模队列中用qRT-PCR验证候选circRNA的表达水平,通过逻辑回归分析和受试者工作特征曲线评估诊断价值。数据覆盖CAD患者与对照的circRNA表达谱,可用于筛选和验证CAD相关的环状RNA生物标志物(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Jun 13 201。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):通过微阵列对24例CAD患者和7例对照的circRNA谱进行检测。使用六种分类器评估潜在的circRNA生物标志物。在大规模队列中通过qRT-PCR进一步验证候选circRNA的表达水平。进行逻辑回归分析和受试者工作特征曲线以评估诊断价值。与对照相比,CAD患者中分别有624个circRNA和171个circRNA显著上调和下调。使用六种不同分类器鉴定出一个四circRNA特征。在这四个circRNA中,发现hsa_circ_001879和hsa_circ_004104在验证队列中显著上调。我们提供了CAD患者中异常表达circRNA的全转录组概览,并且hsa_circ_001879和hsa_circ_004104被重复并鉴定为在C中显著上调

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:Non-coding RNA profiling by array、GPL22121、9606。本站分类:循环系统疾病/其他。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE115733

【使用注意】

· 源站最后修改于 Jul 10 202,引用时请注意版本时效。

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      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

采用微阵列技术对24例CAD患者和7例对照者的circRNA谱进行了检测。使用六种分类器评估潜在的circRNA生物标志物。在大规模队列中通过qRT-PCR进一步验证候选circRNA的表达水平。采用逻辑回归分析和受试者工作特征曲线评估诊断价值。与对照组相比,CAD患者中有624个circRNA显著上调,171个circRNA显著下调。利用六种不同的分类器鉴定出一个由四个circRNA组成的特征谱。在这四个circRNA中,hsa_circ_001879和hsa_circ_004104在验证队列中显著上调。我们提供了CAD患者中异常表达circRNA的全转录组概览,并重复验证了hsa_circ_001879和hsa_circ_004104在CAD患者中显著上调。我们的结果表明,hsa_circ_001879和hsa_circ_004104可能作为CAD的诊断生物标志物。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

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