冠状动脉疾病患者外周血细胞基因表达谱
该数据集为冠状动脉疾病患者外周血细胞的基因表达谱数据,来源于NCBI GEO(GSE10195),包含1个系列矩阵文件。数据基于芯片表达谱平台(GPL1708),物种为人类(9606),样本为心脏导管术前采集的外周血单核细胞

基本信息
资源简介
冠状动脉疾病患者外周血细胞基因表达谱
GSE10195 是一项针对冠状动脉疾病患者外周血细胞基因表达谱的公开数据集,来源于 NCBI GEO 数据库,标题为“Peripheral Blood Cell Gene Expression Profiling in Patients with Coronary Artery Disease (Homo sapiens)”。该数据集以人类为研究对象,采用芯片表达谱技术,对心脏导管术前采集的外周血单核细胞进行表达谱分析,共包含 1 个系列矩阵文件,适合用于循环系统疾病相关基因表达研究的数据获取与二次分析。
【数据集背景】
冠状动脉疾病是循环系统疾病的重要类型,其发生发展涉及外周血细胞中多种基因表达的改变。该数据集聚焦于接受心脏导管术前的患者人群,通过外周血单核细胞的基因表达谱刻画,为探索冠状动脉疾病相关的分子特征提供数据基础。数据集在分类上归入循环系统疾病 / 其他类别,主题标签涉及芯片表达谱、GPL1708 平台以及人类物种编号 9606,体现了其在疾病分子机制研究中的定位。
【数据内容】
该数据集的核心内容为外周血细胞的基因表达谱数据,以系列矩阵文件形式组织,文件样例为 GSE10195_series_matrix.txt.gz。数据集共包含 1 个文件,采用 GZIP 压缩格式存储。表达谱基于芯片平台 GPL1708 产生,物种为人类(9606)。系列矩阵文件通常整合了样本层面的表达测量值及相关注释信息,便于使用者直接读取和开展分析。数据覆盖的对象为冠状动脉疾病患者的心脏导管术前外周血单核细胞样本。
【采集与来源】
数据来源于 ncbi.nlm.nih.gov,即 NCBI GEO 数据库,数据集编号为 GSE10195。源站描述指出,该表达谱分析针对的是在接受心脏导管术之前从患者体内分离的外周血单核细胞。数据作者为 James A Wingrove,发布时间为 Jan 17 200。样本采集时点明确为心脏导管术前,这一时间点信息对于理解数据的临床背景具有意义。
【适用场景】
该数据集适用于循环系统疾病特别是冠状动脉疾病相关的基因表达研究,可用于外周血单核细胞表达谱的特征分析、候选基因筛选以及与其他表达谱数据集的比较研究。由于数据基于芯片平台且物种为人类,适合在人类疾病分子机制探索、生物标志物发现等方向作为公开数据资源使用。使用者亦可将其作为方法学验证或分析流程测试的数据来源。
【使用方法】
使用该数据集时,首先下载数据文件 GSE10195_series_matrix.txt.gz,按 GZIP 压缩包格式进行读取。建议先在小样本上核对字段结构与编码方式,确认无误后再进行批量接入与分析。系列矩阵文件可直接用于表达值的提取与后续统计处理,具体分析流程需结合研究目的自行设计。
【质量与限制】
该数据集仅包含 1 个系列矩阵文件,数据规模与样本构成信息在现有描述中未充分展开。源站未提供关于样本量、分组设计、质量控制指标及平台探针注释的详细说明。此外,发布时间标注为 Jan 17 200,年份信息不完整。使用者在分析前应自行核查数据完整性与平台注释情况。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用规范与许可条款信息。使用时应遵循 NCBI GEO 数据库的相关使用政策,并建议在发表成果时注明数据集编号 GSE10195 及作者 James A Wingrove。
下载信息
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暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
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使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE10195
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Expression profiling of peripheral blood mononuclear cells isolated from patients piror to undergoing cardiac catheterization Disease: NonStenotic: 17-0711, 17-0889, 17-0920, 17-0810, 17-0985, 17-0948, 17-0933, 17-0929, 17-0828, 17-0813, 17-1068, 17-0842, 17-0967, 17-0750 Disease: Stentotic: 17-0736, 17-0727, 17-0915, 17-0913, 17-0866, 17-1043, 17-1037, 17-0994, 17-0924, 17-0921, 17-0917, 17-0916, 17-0808, 17-0758, 17-0963, 17-0958, 17-0951, 17-0822, 17-0815, 17-1089, 17-1083, 17-1077, 17-0954, 17-1086, 17-1057, 17-0748, 17-0722 biological repeat: 17-0711, 17-0889, 17-0920, 17-0810, 17-0985, 17-0948, 17-0933, 17-0929, 17-0828, 17-0813, 17-1068, 17-0842, 17-0967, 17-0750 biological repeat: 17-0736, 17-0727, 17-0915, 17-0913, 17-0866, 17-1043, 17-1037, 17-0994, 17-0924, 17-0921, 17-0917, 17-0916, 17-0808, 17-0758, 17-0963, 17-0958, 17-0951, 17-0822, 17-0815, 17-1089, 17-1083, 17-1077, 17-0954, 17-1086, 17-1057, 17-0748, 17-0722 Keywords: disease state analysis
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