人血管平滑肌细胞硬度敏感转录组及lncRNA硬度调控因子挖掘

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE100081

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

血管细胞外基质(ECM)硬化是主动脉和冠状动脉疾病的危险因素。基质硬化如何调控人主动脉(Ao)和冠状动脉(Co)血管平滑肌细胞(VSMCs)的转录组谱尚不清楚。此外，长链非编码RNA(lncRNAs)在细胞对硬化反应中的作用从未被探索过。本研究表征了人Ao和Co VSMCs的硬度敏感性转录组，并鉴定了硬度依赖性VSMC功能的潜在关键lncRNA调控因子。Ao和Co VSMCs在模拟生理和病理ECM硬度的水凝胶基质上培养。进行总RNA-seq以比较Ao和Co VSMCs的硬度敏感性转录组谱。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。