基本信息

模态

基因组

创建/更新时间

2026-10-27

资源简介

成年小鼠全心脏Tbx20（GFP标签）全基因组结合位点图谱

该数据集为成年小鼠全心脏中GFP标签Tbx20的基因组结合位点定位数据，来源于omicsdi.org，归类于循环系统疾病/其他方向，主题标签为基因组学。Tbx20是心脏发育过程中的重要转录因子，为评估其在成年心脏中的作用，研究者采用染色质免疫沉淀技术，对融合GFP标签的Tbx20进行捕获，在8周龄小鼠全心脏组织中定位其基因组结合位点。数据由1例Tbx20-GFP ChIP样本与全心脏input样本对照分析构成，可用于在全基因组范围识别该转录因子的调控区域、靶基因及相关通路，为理解Tbx20在成年心脏中的调控功能提供基础数据支持。

【数据集背景】

Tbx20是一种对心脏发育具有重要作用的转录因子。为评估该转录因子在成年心脏中的作用，需要识别其调控区域、基因靶点及所调控的通路。基于此研究目的，产生了本数据集，通过在成年小鼠全心脏组织中定位Tbx20的结合位点，为后续解析其在成年心脏中的调控功能提供数据基础。该数据集所属方向为循环系统疾病/其他，主题标签为基因组学。

【数据内容】

本数据集的核心内容为成年小鼠全心脏中GFP标签Tbx20的染色质免疫沉淀数据，用于在全基因组范围定位该转录因子的结合位点。数据构成包括1例Tbx20-GFP ChIP样本，并以全心脏input样本作为对照进行分析。样本取材于8周龄小鼠全心脏组织。数据可用于识别Tbx20的调控区域、基因靶点及受其调控的通路。数据集的英文名称为Genome-wide mapping of Tbx20 (GFP-tagged) in adult mouse whole heart。

【采集与来源】

数据来源于omicsdi.org。实验采用染色质免疫沉淀（ChIP）技术，针对融合GFP标签的Tbx20进行捕获，所用组织为8周龄小鼠全心脏组织。分析方式为将1例Tbx20-GFP ChIP样本与全心脏input样本进行对照。除上述信息外，源站未提供更详细的采集流程、实验批次或测序平台等信息。

【适用场景】

该数据集适用于在全基因组范围研究成年小鼠心脏中Tbx20转录因子结合位点的相关分析，可用于识别该转录因子的调控区域、候选基因靶点以及受其调控的通路，进而支持对Tbx20在成年心脏中作用的研究。其主题归属为基因组学，亦可作为循环系统相关研究中转录因子调控分析的参考数据。

【使用方法】

源站未提供具体的使用方法说明。使用时可依据ChIP样本与全心脏input样本的对照设计进行结合位点分析，具体分析流程、参数设置及推荐工具源站未提供。

【质量与限制】

本数据集仅包含1例Tbx20-GFP ChIP样本，并以全心脏input样本作为对照，样本量有限。数据仅针对8周龄小鼠全心脏组织，未涵盖其他年龄或组织类型。其余关于数据质量评估、重复性及验证情况的信息源站未提供。

【引用与许可】

源站未提供引用方式与许可信息。

原始链接

https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-29636

访问原始数据

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付，我们提供全链路闭环服务，让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持？联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-29636

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Tbx20是一种对心脏发育重要的转录因子。为评估Tbx20在成体心脏中的作用，我们试图识别受该转录因子调控的调控区域、靶基因和通路。为此，我们利用与GFP融合的Tbx20进行染色质免疫沉淀（ChIP），以定位8周龄小鼠全心脏组织基因组中的结合位点。分析成体小鼠全心脏的1份Tbx20-GFP ChIP样本，对照全心脏input样本

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别