肥厚型心肌病患者四腔心网格模型
该数据集提供肥厚型心肌病(HCM)患者的四腔心网格模型,涵盖左心室、右心室、左心房、右心房、主动脉、肺动脉及四组瓣膜、肺静脉平面、左心耳平面、上腔静脉等结构标签,网格以微米为单位

基本信息
资源简介
肥厚型心肌病患者四腔心网格模型
该数据集收录了肥厚型心肌病(HCM)患者的四腔心网格模型,属于循环系统疾病领域的其他类资源,来源站为 doi.org。数据集以有限元网格形式刻画心脏解剖几何,覆盖左心室、右心室、左心房、右心房、主动脉、肺动脉,以及二尖瓣、三尖瓣、主动脉瓣、肺动脉瓣四组瓣膜结构,并包含左前、左后、右前、右后肺静脉平面、左心耳平面和上腔静脉等标签。网格尺寸以微米为单位提供。数据集按 HCM1 至 HCM5 区分不同表型,分别对应中至心尖部左心室肥厚、左心室流出道梗阻、孤立性基底段左心室肥厚、较轻微的非对称性左心室肥厚以及未分化型。该数据集面向患者特异性建模、心脏数字孪生与计算心脏病学等研究方向,为心脏电机械耦合等仿真分析提供几何基础。
【数据集背景】
肥厚型心肌病是一种以心肌肥厚为特征的心脏疾病,其形态学表现具有明显的异质性。该数据集来源于 Rodero 等人的研究工作,相关成果发表于 Journal of Molecular and Cellular Cardiology(2026),标题为“Computational models show that functional remodeling, not anatomy, reshapes physiological determinants of cardiac performance in hypertrophic cardiomyopathy”。该研究关注功能重构与解剖结构在影响心脏性能生理决定因素中的作用,本数据集即为该研究所使用的四腔心网格模型资源,用于支撑计算模型对肥厚型心肌病心脏的几何描述。
【数据内容】
数据集提供肥厚型心肌病患者的四腔心网格,涵盖心脏的主要腔室与大血管结构。具体标签包括:左心室、右心室、左心房、右心房、主动脉、肺动脉、二尖瓣、三尖瓣、主动脉瓣、肺动脉瓣、左前肺静脉平面、左后肺静脉平面、右前肺静脉平面、右后肺静脉平面、左心耳平面以及上腔静脉。网格以微米为单位给出,属于有限元网格类型,可用于心脏解剖与几何的数字化表达。数据集按表型划分为五类:HCM1 对应中至心尖部左心室肥厚表型,HCM2 对应左心室流出道梗阻,HCM3 对应孤立性基底段左心室肥厚,HCM4 对应较轻微的非对称性左心室肥厚,HCM5 对应未分化型。主题标签涉及 HCM、四腔心模型、心脏网格、心脏有限元网格、心脏解剖、心脏几何、患者特异性建模、心脏数字孪生、计算心脏病学以及心脏电机械等方向。
【采集与来源】
该数据集来源于 doi.org,源站提供了数据集的引用说明。若使用该数据集,需同时引用数据集本身以及 Rodero 等人的原始出版物,该出版物发表于 Journal of Molecular and Cellular Cardiology(2026),DOI 为 https://doi.org/10.1016/j.yjmcc.2026.08.002。关于数据的具体采集方式、成像设备、患者招募流程、伦理审批信息以及数据处理步骤,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于患者特异性心脏建模、心脏数字孪生构建、计算心脏病学研究以及心脏电机械仿真等场景。由于网格包含四腔心结构及主要瓣膜、肺静脉平面、左心耳平面和上腔静脉等解剖标签,可用于有限元分析中的几何建模与网格划分,支持对肥厚型心肌病不同表型的心脏解剖形态进行数值模拟研究。其微米级单位设定便于在计算模型中保持一致的尺度表达。
【使用方法】
使用该数据集时,应遵循源站的引用要求,在成果中同时标注数据集与 Rodero 等人的原始论文。网格文件以微米为单位,导入有限元或计算流体/固体力学软件时需注意单位换算与一致性。数据集按 HCM1 至 HCM5 的表型分类组织,使用者可根据研究目的选择相应表型的网格。关于文件格式、软件兼容性、具体读取方式及预处理步骤,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集基于肥厚型心肌病患者构建,表型覆盖五种不同模式,具有一定的形态学代表性。网格以微米为单位,属于有限元网格类型。关于网格的精度、单元数量、节点规模、验证方法、数据完整性以及潜在的偏差或局限性,源站未提供。
【引用与许可】
使用该数据集时,需引用数据集本身以及 Rodero 等人的原始出版物:“Computational models show that functional remodeling, not anatomy, reshapes physiological determinants of cardiac performance in hypertrophic cardiomyopathy”,Journal of Molecular and Cellular Cardiology(2026),DOI:https://doi.org/10.1016/j.yjmcc.2026.08.002。关于具体的许可协议类型、使用限制、再分发条件及商业使用规定,源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://doi.org/10.5281/zenodo.21282274
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
如果您使用了本数据集,请将其与Rodero等人的原始论文一并引用:“Computational models show that functional remodeling, not anatomy, reshapes physiological determinants of cardiac performance in hypertrophic cardiomyopathy”,Journal of Molecular and Cellular Cardiology (2026)。https://doi.org/10.1016/j.yjmcc.2026.08.002 HCM1对应中至心尖部LVH表型,HCM2对应LVOTO,HCM3对应孤立性基底段LVH,HCM4对应较轻的非对称性LVH,HCM5对应未分化型。网格以微米为单位提供。
标签如下:左心室 右心室 左心房 右心房 主动脉 肺动脉 二尖瓣 三尖瓣 主动脉瓣 肺动脉瓣 左前肺静脉平面 左后肺静脉平面 右前肺静脉平面 右后肺静脉平面 左心耳平面 上腔静脉平面 下腔静脉平面 左前肺静脉环 左后肺静脉环 右前肺静脉环 右后肺静脉环 左心耳环 上腔静脉环 下腔静脉环 我们还提供了使用CARP进行电机械模拟所需的文件。每个文件夹包含:myocardium_AV_FEC_BB_lvrv.vtk:包含额外标签的网格:25:左心室快速心内膜传导层 26:巴赫曼束 27:隔离房室平面 28:右心室快速心内膜传导层 29:间隔快速传导层 这些网格是使用CEMRG HeartBuilder流程生成的,可在https://github.com/OpenHeartDevelopers/cemrg-heartbuilder获取。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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