循环脂蛋白脂质与载脂蛋白和冠心病风险关系评估:多变量孟德尔随机化分析

该数据集来自 PLOS Medicine 配套论文,围绕循环脂蛋白脂质与载脂蛋白和冠心病风险的关系,基于 UK Biobank 的脂质性状 GWAS 与 CARDIoGRAMplusC4D 的冠心病数据,采用单变量与多变量孟德尔随机化分析比较不同脂质相关实体的因果作用

google_dataset
2023-05-30 更新
浏览 2
基因组预测lipoprotein lipid traitsUKBBgenome-wide association studyCHDheart diseaseapolipoprotein A-ISNPGWASnon-fasted lipoprotein lipid traitsHDLLDL cholesterolapolipoprotein B
Evaluating the relationship between circulating lipoprotein lipids and apolipoproteins with risk of coronary heart disease: A multivariable Mendelian randomisation analysis

基本信息

模态
基因组
大小
0.002440474 GB
任务类型
预测
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2023-05-30
版本
v1

资源简介

循环脂蛋白脂质与载脂蛋白和冠心病风险关系评估:多变量孟德尔随机化分析

Evaluating the relationship between circulating lipoprotein lipids and apolipoproteins with risk of coronary heart disease: A multivariable Mendelian randomisation analysis

该数据集来自 PLOS Medicine 配套论文,围绕循环脂蛋白脂质与载脂蛋白和冠心病风险的关系,基于 UK Biobank 的脂质性状 GWAS 与 CARDIoGRAMplusC4D 的冠心病数据,采用单变量与多变量孟德尔随机化分析比较不同脂质相关实体的因果作用。数据含 18 个文件,包括补充 PDF 与 XLSX 表格,可用于复现或拓展脂质性状与冠心病因果推断研究(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。

【数据集背景】

配套论文《Evaluating the relationship between circulating lipoprotein lipids and apolipoproteins with risk of coronary heart disease: A multivariable Mendelian randomisation analysis》发表于 PLOS Medicine(2020),DOI:10.1371/journal.pmed.1003062。源站首次发布:2020-03-23。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):背景 循环脂蛋白脂质导致冠心病(CHD)。然而,一种或多种脂蛋白脂质相关实体如何精确解释这种关系仍不清楚。使用通过多变量孟德尔随机化(MR)实施的脂蛋白脂质性状遗传工具,我们试图比较它们在 CHD 病因学中的因果作用。方法与发现 我们在 UK Biobank(UKBB)中对低密度脂蛋白(LDL)胆固醇、甘油三酯和载脂蛋白 B 的循环非空腹脂蛋白脂质性状进行了全基因组关联研究(GWAS),以识别脂质相关单核苷酸多态性(SNP)。使用 CARDIoGRAMplusC4D 的 CHD 数据(包括 60,801 例病例和 123,504 例对照),我们进行了单变量和多变量 MR 分析。对高密度脂蛋白也进行了类似的 GWAS 和 MR 分析。

【数据结构与技术规格】

文件数 18 个,合计 2.44 MB。数据集 DOI:10.1371/journal.pmed.1003062。

【主题与分类】

源站学科分类:Biochemistry、Medicine、Cell Biology、Genetics、Biotechnology、Marine Biology。主题标签:lipoprotein lipid traits、UKBB、genome-wide association study、CHD、heart disease、apolipoprotein A-I、SNP、GWAS、non-fasted lipoprotein lipid traits、HDL。本站分类:循环系统疾病/其他。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Biochemistry、Medicine、Cell Biology、Genetics、Biotechnology、Marine Biology。

【获取与许可】

源站页面:https://plos.figshare.com/articles/dataset/Evaluating_the_relationship_between_circulating_lipoprotein_lipids_and_apolipoproteins_with_risk_of_coronary_heart_disease_A_multivariable_Mendelian_randomisation_analysis/12019170

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Richardson, Tom G.; Sanderson, Eleanor; Palmer, Tom M.; Ala-Korpela, Mika; Ference, Brian A.; Smith, George Davey; et al. (2020). Evaluating the relationship between circulating lipoprotein lipids and apolipoproteins with risk of coronary heart disease: A multivariable Mendelian randomisation analys…

【使用注意】

· 源站最后修改于 2023-05-30,引用时请注意版本时效。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取(Figshare)

命令行下载

curl -L -o "pmed.1003062.s001.pdf" "https://ndownloader.figshare.com/files/22083531"
curl -L -o "pmed.1003062.s002.pdf" "https://ndownloader.figshare.com/files/22083534"
curl -L -o "pmed.1003062.s003.pdf" "https://ndownloader.figshare.com/files/22083537"
curl -L -o "pmed.1003062.s004.xlsx" "https://ndownloader.figshare.com/files/22083540"
curl -L -o "pmed.1003062.s005.xlsx" "https://ndownloader.figshare.com/files/22083543"
curl -L -o "pmed.1003062.s006.xlsx" "https://ndownloader.figshare.com/files/22083546"
curl -L -o "pmed.1003062.s007.xlsx" "https://ndownloader.figshare.com/files/22083549"
curl -L -o "pmed.1003062.s008.xlsx" "https://ndownloader.figshare.com/files/22083552"

文件清单

  • pmed.1003062.s001.pdf(431.41 KB)
  • pmed.1003062.s002.pdf(837.30 KB)
  • pmed.1003062.s003.pdf(58.84 KB)
  • pmed.1003062.s004.xlsx(67.92 KB)
  • pmed.1003062.s005.xlsx(90.82 KB)
  • pmed.1003062.s006.xlsx(115.88 KB)
  • pmed.1003062.s007.xlsx(93.96 KB)
  • pmed.1003062.s008.xlsx(125.84 KB)
  • pmed.1003062.s009.xlsx(114.72 KB)
  • pmed.1003062.s010.xlsx(59.22 KB)
  • pmed.1003062.s011.xlsx(47.56 KB)
  • pmed.1003062.s012.xlsx(47.97 KB)
  • pmed.1003062.s013.xlsx(53.51 KB)
  • pmed.1003062.s014.xlsx(54.57 KB)
  • pmed.1003062.s015.xlsx(50.37 KB)
  • pmed.1003062.s016.xlsx(51.49 KB)
  • pmed.1003062.s017.xlsx(59.73 KB)
  • pmed.1003062.s018.docx(79.36 KB)

文件总体积 2.44 MB(源站 API 实测)。

数据说明

背景
循环脂蛋白脂质会导致冠心病(CHD)。然而,一种或多种脂蛋白脂质相关实体如何精确地解释这种关系仍不清楚。利用通过多变量孟德尔随机化(MR)实施的脂蛋白脂质特征遗传工具,我们试图比较它们在CHD病因学中的因果作用。方法与发现
我们在英国生物银行(UKBB)中对循环非空腹脂蛋白脂质特征进行了全基因组关联研究(GWAS),包括低密度脂蛋白(LDL)胆固醇、甘油三酯和载脂蛋白B,以识别与脂质相关的单核苷酸多态性(SNPs)。利用CARDIoGRAMplusC4D中CHD的数据(包括60,801例病例和123,504例对照),我们进行了单变量和多变量MR分析。对高密度脂蛋白(HDL)胆固醇和载脂蛋白A-I进行了类似的GWAS和MR分析。UKBB中脂质和载脂蛋白的GWAS包括393,193至441,016名个体,平均年龄为56.9岁(范围39-73岁),其中54.2%为女性。

血脂浓度的均值(标准差)为:LDL胆固醇3.57(0.87)mmol/L,HDL胆固醇1.45(0.38)mmol/L,甘油三酯中位数为1.50(IQR=1.11)mmol/L。载脂蛋白B和A-I的均值(标准差)分别为1.03(0.24)g/L和1.54(0.27)g/L。GWAS鉴定出多个独立SNP与以下指标在P −8水平相关:LDL胆固醇(220个)、载脂蛋白B(n=255)、甘油三酯(440个)、HDL胆固醇(534个)和载脂蛋白A-I(440个)。每种血脂性状所鉴定的SNP中,有56%–93%此前未在大规模GWAS中报道过。这些SNP中近一半(46%)在P −8水平与一个以上血脂相关性状相关。采用MR单独评估时,LDL胆固醇(每升高1个标准差,比值比[OR]为1.66;95% CI:1.49–1.86;P P P P P=0.44)发生逆转,甘油三酯的效应(OR 1.12;95% CI:1.02–1.23;P=0.01)减弱。个体MR分析显示,HDL胆固醇每升高1个标准差(OR 0.80;95% CI:0.75–0.86;P P 结论

许可

CC BY 4.0

引用

学术使用请引用 DOI 10.1371/journal.pmed.1003062(source: https://plos.figshare.com/articles/dataset/Evaluating_the_relationship_between_circulating_lipoprotein_lipids_and_apolipoproteins_with_risk_of_coronary_heart_disease_A_multivariable_Mendelian_randomisation_analysis/12019170)。

数据缺失?

依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。

⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。

获取专属数据定制方案