心电图、超声心动图、心肌细胞缩短及组织学数据

数据集获取（Figshare）

• 源站标题：Electrocardiography, echocardiography, myocyte shortening and histological data
• DOI：10.6084/m9.figshare.8072519.v4
• 发布日期：2020-08-05
• 文件数：5 个
• 文件总体积：174.20 KB
• 源站页面：https://figshare.com/articles/dataset/ECG_Data_xlsx/8072519

命令行下载

curl -L -o "ECG_Data.xlsx" "https://ndownloader.figshare.com/files/24106823"
curl -L -o "ECO_Data.xlsx" "https://ndownloader.figshare.com/files/24106826"
curl -L -o "Interstitium fibrosis.xls" "https://ndownloader.figshare.com/files/24106829"
curl -L -o "Perivascular fibrosis.xlsx" "https://ndownloader.figshare.com/files/24106832"
curl -L -o "Myocyte_Shortening_Data.xlsx" "https://ndownloader.figshare.com/files/24155387"

文件清单

• ECG_Data.xlsx（12.90 KB）
• ECO_Data.xlsx（27.75 KB）
• Interstitium fibrosis.xls（102.91 KB）
• Perivascular fibrosis.xlsx（16.53 KB）
• Myocyte_Shortening_Data.xlsx（14.11 KB）

文件总体积 174.20 KB（源站 API 实测）。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据说明

心电图检查

采用Bioamp（ADInstruments，新西兰达尼丁）在糖尿病诱导后3周获取糖尿病大鼠及年龄匹配对照大鼠的心电图数据。

超声心动图检查

糖尿病诱导后2周，使用配备40 MHz换能器的VEVO 2100（Visual Sonics，加拿大安大略省多伦多）对糖尿病大鼠及年龄匹配对照大鼠进行经胸超声心动图检查。

---

心肌细胞缩短

将心肌细胞置于灌流槽中，灌流槽安装在倒置显微镜（Eclipse TS100；Nikon，日本东京）的载物台上，显微镜配备模拟相机（Myocam；IonOptix，美国马萨诸塞州米尔顿）。仅选择边缘清晰且无自发性收缩的杆状心肌细胞进行分析。细胞维持在37°C，并使用置于灌流槽两侧的铂电极进行场刺激（MyoPacer；IonOptix），采用5 ms双相脉冲，频率为1 Hz。使用商业软件（IonWizard；IonOptix）记录无负荷心肌细胞的收缩信号，并利用快速傅里叶变换算法（Sarclen Algorithm；IonOptix）根据肌节横纹图案计算肌节间距的变化。获得以下参数：静息肌节长度；缩短幅度（以静息肌节长度的百分比表示）；缩短和舒张速度以及达到收缩峰值的时间间隔（TPC）；最大缩短速度（TMS）；最大舒张速度（TMR）和50%静息肌节长度（THALF）。这些参数通过平均至少5次连续收缩来计算。

组织学

对于组织学数据，制备好的切片在显微镜下观察（Leica Application suite）。放大倍数设定为×400。使用Image J软件，通过计算切片中红色染色面积的百分比，利用显微照片来计算心肌间质中的胶原含量。每组每只动物平均分析15-20张图像。为评估心室壁内小动脉的血管周围纤维化，选择直径在100-200微米之间的小动脉。

许可

CC BY 4.0

引用

学术使用请引用 DOI 10.6084/m9.figshare.8072519.v4（source: https://figshare.com/articles/dataset/ECG_Data_xlsx/8072519）。