子痫前期中滋养层转变紊乱关联胎儿至母体综合征进展
该数据集来自omicsdi.org,聚焦子痫前期(PE)这一妊娠期最严重的高血压疾病。研究对人类PE胎盘与健康对照进行时空多组学分析,采用单核RNA-seq结合空间蛋白质组学和转录组学及体外信号机制分析,并在纵向临床队列中验证早孕期候选标志物

基本信息
资源简介
子痫前期中滋养层转变紊乱关联胎儿至母体综合征进展
该数据集英文名为 Disturbed trophoblast transition links early fetal to maternal syndrome progression in pre-eclampsia,来源于 omicsdi.org,主题标签为 Genomics,在本站归入循环系统疾病 / 其他类别。数据集聚焦子痫前期(PE)这一妊娠期最严重的高血压疾病:PE 是一种累及多器官系统的综合征,常导致早产、母婴患病与死亡以及终身并发症,目前缺乏有效的筛查工具和早期治疗手段。为研究早发型 PE 的初始阶段并识别候选标志物与通路,研究团队对人类 PE 胎盘与健康对照开展了时空多组学分析,采用单核 RNA-seq 结合空间蛋白质组学、空间转录组学以及体外信号机制分析,并在纵向临床队列中验证早孕期候选标志物。研究发现滋养细胞转变过程中的一处关键破坏,该破坏由转录共激活因子 p300 升高驱动,并最终以衰老相关分泌表型收尾。
【数据集背景】
子痫前期是影响多器官系统的综合征,也是妊娠期最严重的高血压疾病,常导致早产、母婴患病和死亡以及终身并发症。目前缺乏高效的筛查工具和早期治疗手段。为研究早发型 PE 的初始阶段、识别候选标志物和通路,研究团队对人类 PE 胎盘与健康对照进行了时空多组学分析,并在纵向临床队列中验证早孕期候选标志物。
【数据内容】
数据集围绕人类 PE 胎盘与健康对照的时空多组学分析展开。研究采用单核 RNA-seq 方法,并结合空间蛋白质组学和空间转录组学,以及机制性体外信号分析。研究发现了滋养细胞转变过程中的一处关键破坏,该破坏由转录共激活因子 p300 的升高驱动,并最终以衰老相关分泌表型收尾。主题标签为 Genomics。具体的样本数量、组学数据文件类型与规模,源站未提供。
【采集与来源】
数据集来源站为 omicsdi.org。研究材料为人类 PE 胎盘与健康对照,并在纵向临床队列中验证早孕期候选标志物。采样时间跨度、队列规模、纳入与排除标准等细节,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于子痫前期早期发生机制研究,尤其是滋养细胞转变、转录共激活因子 p300 相关调控以及衰老相关分泌表型方向;也可用于早发型 PE 候选标志物与通路的发现和早孕期验证研究,以及胎盘时空多组学分析方法的参考。具体分析流程与参数,源站未提供。
【使用方法】
源站未提供数据下载方式、文件组织说明、预处理步骤与使用协议等具体使用指引。
【质量与限制】
源站未提供数据质量评估、批次效应处理、样本量说明及研究局限性等信息。
【引用与许可】
源站未提供引用格式与许可条款信息。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
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提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
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使用方式
数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAS00001005681
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
子痫前期(PE)是一种累及多器官系统的综合征,是妊娠期最严重的高血压性疾病。它常导致早产、母胎发病率和死亡率升高以及终身并发症。我们目前缺乏有效的筛查工具和早期治疗手段来应对PE。为研究早发型PE的初始阶段并识别候选标志物和通路,我们对人类PE胎盘和健康对照进行了时空多组学分析,并在纵向临床队列中验证了妊娠早期的靶点。我们采用单核RNA测序方法,结合空间蛋白质组学和转录组学以及体外机制性信号分析。我们发现滋养层细胞转换过程中存在一个关键性中断,该中断由转录辅激活因子p300的增加所驱动,最终导致滋养层细胞出现衰老相关分泌表型(SASP)。我们发现,在子痫前期孕妇妊娠早期的母体血清中,衰老标志物Activin-A显著升高,且出现在临床症状发生之前,这表明胎儿综合征向母体侧发生了转化。
我们的研究确定了该疾病早期诊断的潜在新生物标志物以及可能的干预靶点,这将是保护母婴免受妊娠期死亡和发病以及晚年心血管疾病风险增加的关键步骤。本研究包括来自胎儿部分的早期胎盘样本(绒毛;n=10)、母体部分(蜕膜;n=3)、来自健康妊娠的晚期胎盘样本,绒毛(n=6)、蜕膜(n=4),以及来自早发型子痫前期妊娠的晚期胎盘样本,绒毛(n=5)和蜕膜(n=5)。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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