胎儿智能导航超声心动图(FINE)或5D heart新高级特征数据

该数据集包含45例真实三维超声心动图容积数据,分别采集于舒张末期(ED)和收缩末期(ES)两个心动相位,并提供左心室分割的金标准掩膜

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2026-03-02 更新
浏览 2
医学影像图像分割task_categories:image-segmentationlicense:cc-by-nc-sa-4.0size_categories:n<1Klibrary:datasetslibrary:mlcroissantregion:usmedical-imagingechocardiography3d-ultrasoundcardiacsegmentation
Data from: New and advanced features of fetal intelligent navigation echocardiography (FINE) or 5D heart

基本信息

模态
医学影像
大小
2.709762812 GB
任务类型
图像分割
许可
cc-by-nc-sa-4.0
创建/更新时间
2026-03-02

资源简介

胎儿智能导航超声心动图(FINE)或5D heart新高级特征数据

该数据集英文名为 Data from: New and advanced features of fetal intelligent navigation echocardiography (FINE) or 5D heart,在来源站点的标题为 phamtrongthang/CETUS,本站归类为循环系统疾病 / 其他,来源站为 huggingface.co。数据集包含 45 例真实三维超声心动图容积数据,分别采集于舒张末期(ED)和收缩末期(ES)两个心动相位,并提供左心室分割的金标准掩膜。数据以 NIfTI(.nii.gz)格式组织,按患者分目录存放,共 186 个文件,合计约 1.35 GB,采用 cc-by-nc-sa-4.0 许可发布,发布时间为 2026-03-01。主题标签涵盖图像分割任务、医学影像、超声心动图、三维超声、心脏与分割等方向,适合用于心脏三维超声的分割研究与算法验证。

【数据集背景】

该数据集面向三维超声心动图(3D echocardiography)图像分析,核心任务是左心室分割。源站描述将其定位为心脏超声训练与超声分割用途的数据集合(CETUS,即 Cardiac Echo Training and Ultrasound Segmentation)。数据集提供真实采集的三维超声容积以及与之配套的左心室分割金标准掩膜,可用于训练和评估三维医学图像分割方法。本站将其归入循环系统疾病 / 其他分类,主题标签中包含 image-segmentation、medical-imaging、echocardiography、3d-ultrasound、cardiac、segmentation 等,说明其应用方向集中在心脏影像的自动分割。

【数据内容】

数据集共包含 45 例患者的三维超声心动图容积,每位患者提供两个心动相位的图像:舒张末期(ED)与收缩末期(ES)。对应文件命名规则为 patientXX_ED.nii.gz 与 patientXX_ES.nii.gz,金标准左心室分割掩膜则以 patientXX_ED_gt.nii.gz 和 patientXX_ES_gt.nii.gz 命名。数据按患者分目录组织,例如 dataset/patient01/ 下存放该患者的 ED、ES 图像及其对应的 gt 掩膜,依次至 patient45。除患者数据外,数据集还包含 LICENSE_TERMS.md、MANDATORY_CITATION.md、jupyter/script_cetus.ipynb 以及 Resources.zip 等辅助文件。全部文件数量为 186 个,合计约 1.35 GB。文件格式包括 ZIP 压缩包、MD 文档、GZIP 压缩包与 IPYNB 笔记本;容积数据为 NIfTI 格式,典型形状因患者而异,具体可参见 NIfTI 头文件中的元数据。

【采集与来源】

数据来源站为 huggingface.co,源站标题为 phamtrongthang/CETUS。数据集英文名称为 Data from: New and advanced features of fetal intelligent navigation echocardiography (FINE) or 5D heart。源站描述说明这些数据为真实采集的三维超声心动图容积,覆盖舒张末期与收缩末期两个 cardiac phase。关于采集设备、采集机构、采集时间、患者人群特征及伦理审批等信息,源站未提供。

【适用场景】

依据主题标签与数据结构,该数据集适用于三维超声心动图图像分割任务,尤其是左心室在 ED 与 ES 两个相位上的分割模型训练与评估;也可用于多相位心脏影像的配准、形状分析及分割算法鲁棒性比较等研究。由于提供金标准掩膜,可直接作为监督学习的训练与测试数据。源站未提供更具体的基准任务或评价指标说明。

【使用方法】

使用时可先下载全部数据文件(共 186 个,合计约 1.35 GB),包括 Resources.zip、dataset/LICENSE_TERMS.md、dataset/MANDATORY_CITATION.md 以及各患者目录下的 NIfTI 文件。读取方面,源站示例使用 SimpleITK 的 ReadImage 函数加载 .nii.gz 容积,例如 sitk.ReadImage("dataset/patient01/patient0...")。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入。数据按 patientXX 目录组织,ED 与 ES 图像及对应 gt 掩膜成对存放,便于按患者划分训练集与验证集。源站另提供 jupyter/script_cetus.ipynb 脚本,可作为数据读取与处理的起点。

【质量与限制】

数据集为真实采集的三维超声容积,容积形状因患者而异,使用前需检查各 NIfTI 头文件中的尺寸与空间信息。数据集规模为 45 例患者、两个心动相位,属于 n<1K 的小规模数据类别。源站未提供图像质量评分、标注一致性评估、采集参数或缺失情况说明;关于数据是否存在伪影、噪声水平及分割掩膜的标注流程,源站未提供。

【引用与许可】

数据集采用 cc-by-nc-sa-4.0 许可,即署名—非商业性使用—相同方式共享,使用时需遵守非商业用途与相同方式共享的要求。数据集中包含 MANDATORY_CITATION.md 文件,表明使用该数据需要进行强制引用,具体引用格式见该文件;源站未提供其他引用信息。使用前应同时阅读 LICENSE_TERMS.md 中的许可条款。

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取与加载(Hugging Face datasets)

# 前置依赖: pip install datasets
from datasets import load_dataset

ds = load_dataset("phamtrongthang/CETUS")
print(ds)  # 查看 splits 与字段结构
# 国内网络可先设镜像: import os; os.environ["HF_ENDPOINT"]="https://hf-mirror.com"
git lfs install && git clone https://hf-mirror.com/datasets/phamtrongthang/CETUS

数据集大小约 2.71 GB。

仓库文件结构

  • .gitattributes
  • README.md
  • Resources.zip

数据说明

Trong-Thang Pham, CETUS [Dataset]. https://huggingface.co/datasets/phamtrongthang/CETUS

完整数据卡:huggingface.co/datasets/phamtrongthang/CETUS

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