心血管疾病患者循环单核细胞细胞因子信号通路性别差异的CTMM数据
主题标签：循环系统疾病、单核细胞、细胞因子信号通路、性别差异、基因表达、冠状动脉疾病、CTMM。本站分类：循环系统疾病/其他
基本信息
资源简介
心血管疾病患者循环单核细胞细胞因子信号通路性别差异的CTMM数据
该数据集围绕心血管疾病患者循环单核细胞中细胞因子信号通路的性别差异展开，来源于相关研究论文所配套发布的数据。数据集英文名称为“CTMM Data for: 'Sex-specific differences in cytokine signaling pathways in circulating monocytes of cardiovascular disease patients'”，由 Lu, Chang 与 Biessen, Erik 提交，存放于 Zenodo，发布时间为 2024 年，采用 Creative Commons Attribution 4.0 International 许可。数据聚焦冠状动脉疾病（CAD）患者外周循环单核细胞的基因表达，通过比较男性与女性样本，生成具有性别偏向性的基因表达特征，为研究心血管疾病中免疫细胞信号传导的性别特异性机制提供数据基础。数据集在分类上归属于循环系统疾病 / 其他，主题涉及循环系统疾病、单核细胞、细胞因子信号通路、性别差异、基因表达、冠状动脉疾病以及 CTMM 等关键词。
【数据集背景】
心血管疾病存在明显的性别差异，而单核细胞作为先天免疫的重要组成部分，其细胞因子信号通路的性别特异性调控在疾病进程中可能发挥关键作用。该数据集对应发表于 Atherosclerosis 的研究“Sex-specific differences in cytokine signaling pathways in circulating monocytes of cardiovascular disease patients”（DOI: 10.1016/j.atherosclerosis.2023.04.005），旨在通过转录组层面的比较，揭示男性和女性冠状动脉疾病患者单核细胞中基因表达的差异特征。数据来自 Center for Translational Molecular Medicine-Circulating Cells Cohort（CTMM 循环细胞队列），该队列为研究提供了患者层面的样本与临床信息基础。
【数据内容】
数据集包含三个数据框。第一个为 clin_cvd，记录患者信息，可用于样本分组、性别比较及与基因表达数据的关联分析。第二个为 geneexprs_hgnc，提供经过批次校正后的基因表达数据，基因标识采用 HGNC 命名体系，适合开展跨样本的表达比较与差异分析。第三个为 GES_cvdmf_HGNC，为基于 limma 的差异分析结果，比较方向为男性对女性，可用于直接获取性别相关的差异表达基因及其统计结果。三个数据框相互配合，覆盖了从临床信息、表达矩阵到差异分析结果的完整链条。
【采集与来源】
数据来源于 Center for Translational Molecular Medicine-Circulating Cells Cohort 中冠状动脉疾病患者的外周循环单核细胞，研究共纳入 450 例 CAD 患者（n = 450）。表达数据经过批次校正处理，并以 HGNC 基因命名体系进行统一标识。数据通过 doi.org 来源站发布，存放于 Zenodo 平台，作者为 Lu, Chang 与 Biessen, Erik，发布时间为 2024 年。源站描述中给出了配套论文的 DOI 链接，便于追溯研究背景与方法细节。
【适用场景】
该数据集适用于心血管疾病免疫机制研究，尤其是探索单核细胞中细胞因子信号通路性别差异的分析；可用于差异表达基因的验证、性别分层下的通路富集分析、候选生物标志物筛选，以及作为同类转录组研究的对照或整合资源。对于关注冠状动脉疾病性别特异性免疫特征的研究者，该数据提供了可直接使用的表达矩阵与差异分析结果。
【使用方法】
研究者可结合 clin_cvd 中的患者信息对样本进行性别分组与临床特征分层，利用 geneexprs_hgnc 的批次校正表达数据进行重新分析或可视化，并参考 GES_cvdmf_HGNC 中的 limma 结果快速定位男性与女性之间的差异表达基因。使用时应遵循 HGNC 基因标识进行注释匹配，并注意差异分析的方向为男性对女性。
【质量与限制】
数据经过批次校正，并以 HGNC 统一基因命名，具备较好的规范性与可复用性。样本量为 450 例 CAD 患者，来源为单一队列（CTMM-Circulating Cells Cohort），研究结论的外推需谨慎。源站未提供关于测序平台、具体校正方法参数、临床变量完整列表及缺失值处理等更详细的技术信息。
【引用与许可】
使用该数据集时应引用配套论文“Sex-specific differences in cytokine signaling pathways in circulating monocytes of cardiovascular disease patients”（DOI: 10.1016/j.atherosclerosis.2023.04.005），并注明数据作者 Lu, Chang 与 Biessen, Erik 及存放平台 Zenodo。数据采用 Creative Commons Attribution 4.0 International 许可，允许在署名前提下使用、共享与改编。
下载信息
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需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://doi.org/10.5281/zenodo.11125300
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
来自出版物《心血管疾病患者循环单核细胞中细胞因子信号通路的性别特异性差异》的数据 https://doi.org/10.1016/j.atherosclerosis.2023.04.005 我们通过比较来自转化分子医学中心-循环细胞队列的冠状动脉疾病（CAD）患者（n = 450）的男性与女性单核细胞，生成了性别偏倚的基因表达特征。数据包括3个数据框：clin_cvd：患者信息 geneexprs_hgnc：批次校正后的基因表达 GES_cvdmf_HGNC：limma结果（男性 vs 女性）
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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