异常昼夜节律通过降低心室机械强度加重扩张型心肌病

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/geo/GSE270258

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
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数据说明

扩张型心肌病（DCM）在病因学和病理生理学上具有异质性。异常昼夜节律（ACR）与动物模型中DCM的发生发展相关，但基于临床样本的探索尚缺乏。睡眠呼吸暂停（SA）是与ACR相关的最常见疾病，我们选择SA作为研究对象来探究ACR-DCM。我们纳入了一个DCM队列，并将其分为SA组（n=76）和无SA组（n=29）。采用RT-qPCR测定节律基因表达模式的变化。我们使用单核RNA测序（snRNA-seq）探究ACR组的异常转录模式，并通过病理染色、原子力显微镜（AFM）和Rev-erbα/β敲除（KO）小鼠分析对发现进行验证。合并SA的DCM患者节律基因表达振幅降低。SA组显示左心腔扩张更为严重。snRNA-seq结果显示，ACR-DCM丧失了晨间转录模式，具体表现为心肌细胞（CMs）的肌动蛋白细胞骨架组织紊乱、肥大加重，以及活化成纤维细胞（Fibs）比例随纤维化面积比降低而减少。

病理染色、力学实验以及Rev-erbα/β基因敲除小鼠的转录特征结果均支持上述发现。伴有SA的DCM患者左心室壁严重扩张与结构强度下降相关，心肌细胞和成纤维细胞的表型变化参与了这一过程。ACR-DCM的组织病理学特征为心室壁蓬松。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。