野生型ATTR淀粉样变性患者心脏淀粉样原纤维数据集
该数据集包含通过冷冻电镜技术解析的野生型ATTR淀粉样变性患者心脏淀粉样原纤维的三维结构数据，数据模态为分子结构坐标文件，主要应用于心脏淀粉样变性的分子病理学研究，为理解转甲状腺素蛋白原纤维的组装机制和疾病病理过程提供结构基础。
基本信息
资源简介
野生型ATTR淀粉样变性患者心脏淀粉样原纤维数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Cardiac amyloid fibrils extracted from a wild-type ATTR amyloidosis patient》。
【数据内容】
源站原始描述：Transthyretin, Amyloidosis, Systemic amyloidosis, ATTR, Cardiac, PROTEIN FIBRIL
【数据结构与技术规格】
数据集 DOI：10.1038/s42003-024-06588-6。
【主题与分类】
主题标签：PROTEIN FIBRIL。
【获取与许可】
源站页面：https://www.rcsb.org/structure/8GBR
规范引用：Cryo-EM confirms a common fibril fold in the heart of four patients with ATTRwt amyloidosis. (2024) Commun Biol
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站：https://pdbj.org/mine/summary/8gbr
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集包含从野生型ATTR淀粉样变性患者心脏组织中提取的淀粉样原纤维结构数据。数据集的核心内容是通过冷冻电镜技术（分辨率为3.4埃）解析的转甲状腺素蛋白原纤维的三维结构。数据来源于真实患者的病理样本，由Nguyen, B.A和Saelices, L.等研究人员采集并提交至日本蛋白质数据库。该数据集主要用于研究心脏淀粉样变性的分子病理机制，特别是野生型ATTR淀粉样变性中原纤维的组装模式和结构特征，为疾病诊断、药物靶点发现和病理机制研究提供结构生物学依据。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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