慢性消耗病朊病毒原纤维
该数据集包含慢性消耗病朊病毒原纤维的冷冻电镜结构数据,模态为蛋白质三维结构坐标,分辨率达2.8埃,数据来源于鹿的天然朊病毒样本,主要用于研究朊病毒病的分子机制、原纤维组装过程以及神经退行性疾病的病理学基础,为结构生物学和抗朊病毒药物开发提供关键资源。

基本信息
资源简介
慢性消耗病朊病毒原纤维
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Chronic wasting disease prion fibril》。
【数据内容】
源站原始描述:Prion, Chronic Wasting Disease, Deer, Fibril, GPI-anchor, PrP, Infectious, Amyloid, Brain-derived, ex vivo, Prion strain, PROTEIN FIBRIL
【数据结构与技术规格】
数据集 DOI:10.1007/s00401-024-02813-y。
【主题与分类】
主题标签:PROTEIN FIBRIL。
【获取与许可】
源站页面:https://www.rcsb.org/structure/9DMY
规范引用:Cryo-EM structure of a natural prion: chronic wasting disease fibrils from deer. (2024) Acta Neuropathol
下载信息
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数据集获取
源站:https://pdbj.org/mine/summary/9dmy
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集提供了慢性消耗病(CWD)朊病毒原纤维的冷冻电镜结构数据,分辨率达2.8埃。数据包含主要朊蛋白(PrP)的原子坐标和结构信息,来源于鹿的天然朊病毒原纤维样本。该数据集由Caughey、Hoyt等研究人员于2024年通过电子显微镜方法测定并提交至Protein Data Bank Japan(PDBj)。该数据集主要用于研究朊病毒病的分子机制、原纤维形成过程以及慢性消耗病的病理学,为神经退行性疾病的结构生物学和药物设计提供基础。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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