IDR idr0127-baer-phenotypicheterogeneity 实验C 数据集

主题标签:心血管系统疾病、Brugada综合征、细胞组织成像、表型异质性、IDR、OME/EMBL-EBI。本站分类:心血管系统疾病/Brugada综合征

idr
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医学影像心血管系统疾病Brugada综合征细胞组织成像表型异质性IDROME/EMBL-EBI
IDR idr0127-baer-phenotypicheterogeneity (experimentC)

基本信息

模态
医学影像
创建/更新时间
2026-10-17

资源简介

IDR idr0127-baer-phenotypicheterogeneity 实验C 数据集

IDR idr0127-baer-phenotypicheterogeneity(experimentC)是 Image Data Resource(IDR)中一项以心血管系统疾病为背景的细胞/组织成像研究,主题聚焦于 Brugada 综合征与表型异质性。该数据集在本站归类为心血管系统疾病 / Brugada 综合征,来源站为 idr.openmicroscopy.org,属于 OME/EMBL-EBI 体系下经过策管的成像研究资源。源站将其描述为 IDR 研究 idr0127-baer-phenotypicheterogeneity 的 experimentC 部分,包含 1 幅图像。整体而言,该数据集以细胞与组织层面的显微成像为呈现形式,围绕 Brugada 综合征相关表型异质性这一研究主题组织数据,适合作为该方向成像数据的检索与参考入口。

【数据集背景】

该数据集所属研究的名称为 idr0127-baer-phenotypicheterogeneity,其主题指向表型异质性,并结合 Brugada 综合征这一心血管系统疾病方向。Brugada 综合征属于心血管系统疾病范畴,本站据此将其归入“心血管系统疾病 / Brugada 综合征”分类之下。数据集名称中的 experimentC 表明它是该研究中的一个实验分组或实验部分。源站说明该资源为 Image Data Resource 中经过策管的细胞/组织成像研究,归属于 OME/EMBL-EBI 体系。关于该研究的具体科学假设、样本构成与实验设计细节,源站未提供。

【数据内容】

依据源站描述,该数据集包含 1 幅图像,属于细胞/组织成像数据。其主题标签涵盖心血管系统疾病、Brugada 综合征、细胞组织成像、表型异质性、IDR 以及 OME/EMBL-EBI。除图像数量为 1 之外,源站未提供关于图像尺寸、通道数、像素分辨率、成像模态、染色标记或样本类型的具体信息。关于该图像所记录的具体生物学对象与观察指标,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 idr.openmicroscopy.org,即 Image Data Resource,属于 OME/EMBL-EBI 体系下经过策管的细胞/组织成像研究资源。数据集英文名称为 IDR idr0127-baer-phenotypicheterogeneity (experimentC),对应 IDR 研究 idr0127-baer-phenotypicheterogeneity 中的 experimentC 部分。关于样本采集地点、采集时间、仪器设备、成像参数以及原始数据提交者等信息,源站未提供。

【适用场景】

该数据集可用于心血管系统疾病尤其是 Brugada 综合征方向的细胞/组织成像数据检索与参考,也可作为表型异质性相关成像研究的资源入口。由于其归属于经过策管的 IDR 资源,适合在需要定位特定 IDR 研究实验分组的场景中作为索引使用。关于该数据集是否适用于特定分析流程、再分析或方法学验证,源站未提供相应说明。

【使用方法】

该数据集通过 IDR 平台(idr.openmicroscopy.org)提供访问,可依据研究标识 idr0127-baer-phenotypicheterogeneity 及实验标识 experimentC 进行定位。关于具体的下载方式、文件格式、访问权限设置以及配套的元数据字段,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为 IDR 中经过策管的成像研究资源,其来源体系为 OME/EMBL-EBI。当前可确认的数据规模为 1 幅图像,样本量较为有限。关于图像质量评估、数据完整性校验、是否存在缺失或排除样本等信息,源站未提供。使用时应以源站实际提供的内容为准。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式、作者列表、发表文献以及许可条款,源站未提供。使用或再分发前应向源站核实相关要求。

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使用方式

数据集获取

源站:https://idr.openmicroscopy.org/webclient?show=project-2255

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

IDR study idr0127-baer-phenotypicheterogeneity. Experiment: experimentC. Images: 1. Image Data Resource: curated cell/tissue imaging study (OME/EMBL-EBI).

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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