phs000820:CCF AFIB GWAS 研究

该数据集为 dbGaP 收录的 phs000820: CCF AFIB GWAS study,属于心血管系统疾病中心房颤动主题,源站将其标注为 Case Set

dbgap
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基因组分类Case Set
phs000820: CCF AFIB GWAS study

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-07

资源简介

phs000820:CCF AFIB GWAS 研究

phs000820: CCF AFIB GWAS study 是收录于 dbGaP 的一项以心房颤动为研究主题的数据集,归属于心血管系统疾病分类。该数据集在源站被标注为 Case Set,即病例集合,提示其内容围绕心房颤动病例样本展开。心房颤动是临床上常见的持续性心律失常,与卒中、心力衰竭等心血管不良事件风险升高相关,针对其遗传背景的研究有助于理解疾病的发生机制。该数据集以 GWAS 研究形式呈现,来源于 ncbi.nlm.nih.gov,为心血管遗传学研究提供了一个可检索、可利用的公开数据资源。

【数据集背景】

该数据集的全称为 phs000820: CCF AFIB GWAS study,从名称可以看出其研究类型为全基因组关联研究(GWAS),研究对象为心房颤动。心房颤动属于心血管系统疾病范畴,是该数据集在分类体系中的归属主题。源站将其标注为 Case Set,说明该数据集以病例样本集合的形式组织,侧重于心房颤动病例相关数据的汇集。GWAS 研究通常通过比较病例与对照的基因组变异分布,寻找与疾病相关的遗传位点,该数据集即围绕这一研究框架建立。关于该研究的具体立项背景、研究机构、研究目的等更详细信息,源站未提供。

【数据内容】

该数据集的主题标签为 Case Set,表明其内容以心房颤动病例集合为核心。作为一项 GWAS 研究数据集,其内容应涉及与心房颤动相关的遗传变异数据,但具体的样本数量、变异位点数目、表型字段、数据文件格式等细节,源站未提供。数据集所属分类为心血管系统疾病下的心房颤动,这一分类信息明确了其疾病领域归属。除上述已标注的主题与分类信息外,关于数据集中具体包含哪些变量、覆盖哪些基因组区域、是否包含临床协变量等内容,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov,即美国国家生物技术信息中心(NCBI)网站,具体收录于 dbGaP 数据库。dbGaP 是 NCBI 下属的基因型与表型数据库,用于存储和分发大规模遗传学研究数据。源站将该数据集描述为 dbGaP study (Case Set),说明其在 dbGaP 中以研究项目的形式登记,并以病例集合的形式呈现。关于样本采集地点、采集时间、招募方式、伦理审批信息等具体采集细节,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于心血管系统疾病尤其是心房颤动相关的遗传学研究场景。作为一项 GWAS 研究数据,其潜在用途包括:探索心房颤动的遗传易感位点、验证已知候选基因与心房颤动的关联、开展病例集合内的遗传变异频率分析等。由于源站将其标注为 Case Set,该数据集可能更适合用于病例侧遗传特征的描述与分析,或作为更大型病例对照研究的组成部分。关于该数据集是否适用于特定分析流程、是否支持特定软件工具,源站未提供。

【使用方法】

该数据集通过 ncbi.nlm.nih.gov 提供访问,具体获取方式应遵循 dbGaP 数据库的数据访问流程。dbGaP 通常对受控访问数据设有申请与审批机制,使用者需按照源站要求提交数据使用申请。关于该数据集的具体下载格式、访问权限级别、是否需要机构审查委员会批准等操作细节,源站未提供。使用者应以源站发布的访问说明为准。

【质量与限制】

该数据集在源站被标注为 Case Set,这一标注本身提示其样本构成可能以病例为主,在缺乏对照信息的情况下,部分需要对照组的关联分析可能受到限制。关于数据质量评估指标、缺失率、基因型 calling 质量、样本排除标准等具体质量信息,源站未提供。该数据集的具体局限性,如样本量是否充足、人群代表性如何、是否存在批次效应等,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集收录于 dbGaP,编号为 phs000820。使用该数据集时,应按照 dbGaP 及源站的要求进行引用与致谢。关于该数据集的具体许可协议、使用条款、引用格式、数据共享限制等内容,源站未提供。使用者应直接查阅源站发布的相关政策与说明,以确保合规使用。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/study.cgi?study_id=phs000820

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

dbGaP study (Case Set).

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