Rivaroxaban 代谢组学分析

本数据集来自 omicsdi.org,聚焦心血管系统疾病中的心房颤动,主题标签为 Proteomics。数据内容为对非瓣膜性心房颤动(NVAF)患者及年龄、性别匹配的对照者,在服用 Rivaroxaban 前与服药后 3 小时的血浆代谢组进行液相色谱串联质谱(LC-MS/MS)分析

omicsdi
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蛋白质分类Proteomics
Metabolomics analysis of Rivaroxaban

基本信息

模态
蛋白质
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-10

资源简介

Rivaroxaban 代谢组学分析

本数据集为“Metabolomics analysis of Rivaroxaban”,来源于 omicsdi.org,归类于心血管系统疾病下的心房颤动方向,主题标签为 Proteomics。其核心内容围绕非瓣膜性心房颤动(NVAF)患者及年龄、性别匹配的对照者展开,分析其在服用 Rivaroxaban 前与服药后 3 小时的血浆代谢组变化。检测手段为液相色谱串联质谱(LC-MS/MS)。该数据集将药物暴露时间点与代谢组学检测相结合,可用于观察 Rivaroxaban 摄入前后血浆代谢物谱的差异,并同时纳入患者与匹配对照,为心血管疾病领域的代谢与蛋白质相关研究提供数据基础。

【数据集背景】

本数据集聚焦心血管系统疾病中的心房颤动,具体研究对象为非瓣膜性心房颤动(NVAF)患者。心房颤动是临床常见的心律失常类型之一,而非瓣膜性心房颤动是其重要亚型。Rivaroxaban 作为一种抗凝药物,在该人群中的使用与代谢变化之间的关系,是本数据集关注的核心问题。数据集主题标签为 Proteomics,结合代谢组学分析,体现了从蛋白质与代谢层面探索药物效应的研究取向。来源站为 omicsdi.org,该站提供多组学数据资源的索引与描述。

【数据内容】

数据内容为血浆代谢组数据。研究对非瓣膜性心房颤动(NVAF)患者以及年龄、性别匹配的对照者,分别在服用 Rivaroxaban 前和服药后 3 小时采集血浆,并进行代谢组分析。检测方法为液相色谱串联质谱(LC-MS/MS)。因此,数据覆盖两个时间点:服药前与服药后 3 小时;覆盖两类人群:NVAF 患者与年龄、性别匹配的对照者。通过比较这些样本的代谢组,可反映 Rivaroxaban 摄入前后血浆代谢物谱的变化。主题标签为 Proteomics,提示该数据集在组学分类上归属于蛋白质组学相关范畴。

【采集与来源】

数据集英文名为“Metabolomics analysis of Rivaroxaban”,来源站为 omicsdi.org。源站描述指出,该研究通过液相色谱串联质谱(LC-MS/MS)分析非瓣膜性心房颤动(NVAF)患者及年龄、性别匹配的对照者在服用 Rivaroxaban 前与服药后 3 小时的血浆代谢组。样本类型为血浆,采集时间点明确为服药前和服药后 3 小时。对照设置采用年龄、性别匹配的方式。除此之外,关于采集地点、采集机构、样本量、受试者招募细节等信息,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于心血管系统疾病中与心房颤动相关的代谢组学研究,尤其是围绕 Rivaroxaban 用药前后代谢变化的分析。由于同时包含 NVAF 患者与年龄、性别匹配的对照者,并设置服药前与服药后 3 小时两个时间点,可用于探索药物暴露相关的血浆代谢物差异,也可用于比较患者与对照之间的代谢组特征。主题标签为 Proteomics,因此也适合与蛋白质组学或更广泛的多组学分析结合使用。具体应用时,应结合源站提供的原始描述与数据文件进行判断。关于该数据集是否适用于其他抗凝药物、其他时间点或其他疾病人群,源站未提供,不应外推。

【使用方法】

使用该数据集时,可依据其设计特征进行分析:以非瓣膜性心房颤动(NVAF)患者和年龄、性别匹配的对照者为两组,以服用 Rivaroxaban 前和服药后 3 小时为两个时间点,对液相色谱串联质谱(LC-MS/MS)产生的血浆代谢组数据进行组内与组间比较。分析目标可包括识别服药前后差异代谢物、比较患者与对照的代谢谱差异,以及结合 Proteomics 标签进行跨组学关联。具体的数据格式、预处理流程、统计方法、软件工具及参数设置,源站未提供,需参考源站数据页面或相关数据文件说明。

【质量与限制】

该数据集基于液相色谱串联质谱(LC-MS/MS)进行血浆代谢组分析,样本来自非瓣膜性心房颤动(NVAF)患者及年龄、性别匹配的对照者,时间点为服药前与服药后 3 小时。关于样本量、缺失值比例、批次效应、质控样本设置、代谢物鉴定置信度、定量方法、数据完整性等质量指标,源站未提供。该数据集仅涉及 Rivaroxaban 在特定人群与特定时间点的代谢组变化,不能直接推广到其他药物、其他时间点或其他心房颤动亚型。主题标签为 Proteomics,但其具体组学层次与代谢组数据之间的关系,源站未提供进一步说明。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式、许可协议、使用限制、数据访问权限及版权信息,源站未提供。使用者在引用或再利用该数据集时,应前往 omicsdi.org 对应页面查阅原始条目及其关联的许可与引用要求。

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源站:https://omicsdi.org/dataset/iprox/PXD032247

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本研究采用液相色谱-串联质谱联用技术(LC-MS/MS),分析了非瓣膜性心房颤动(NVAF)患者及年龄、性别相匹配的对照组在服用利伐沙班前及服药后3小时的血浆代谢组。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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