基于GWAS的U.S. CHARGE联盟测序研究(CHARGE-S):ARIC

该数据集为dbGaP收录的CHARGE-S研究中的ARIC部分,属于病例-队列与队列设计,分类为心血管系统疾病/动脉粥样硬化

dbgap
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基因组分类Case-Cohort, Cohort
phs000668: Building on GWAS: the U.S. CHARGE consortium - Sequencing (CHARGE-S): ARIC

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-24

资源简介

基于GWAS的U.S. CHARGE联盟测序研究(CHARGE-S):ARIC

phs000668 对应的是 CHARGE-S 研究中属于 ARIC 的部分,全称为“Building on GWAS: the U.S. CHARGE consortium - Sequencing (CHARGE-S): ARIC”。该数据集由 NCBI 的 dbGaP 收录,源站将其标注为病例-队列(Case-Cohort)与队列(Cohort)研究。按照本站分类,它归入心血管系统疾病 / 动脉粥样硬化方向,主题标签同样为 Case-Cohort 与 Cohort。整体来看,这一数据集是 CHARGE 联盟在既有 GWAS 工作基础上开展测序研究的组成部分,聚焦于 ARIC 研究人群,面向心血管系统疾病特别是动脉粥样硬化相关的研究需求,为相关遗传学与流行病学分析提供数据资源。

【数据集背景】

该数据集建立在 GWAS 研究的基础之上,属于美国 CHARGE 联盟(CHARGE consortium)测序工作(CHARGE-S)中的 ARIC 部分。CHARGE-S 的定位是在已有全基因组关联研究的基础上进一步开展测序,以深化对相关性状与疾病的理解。ARIC 作为该联盟研究中的组成部分,被单独组织为 phs000668 这一 dbGaP 研究条目。数据集的疾病分类指向心血管系统疾病 / 动脉粥样硬化,说明其研究关注点落在心血管系统相关疾病方向上。

【数据内容】

源站将该研究描述为 dbGaP study,研究设计标注为 Case-Cohort 与 Cohort,主题标签亦为 Case-Cohort、Cohort。这表明数据集按照病例-队列与队列两种设计组织样本与研究人群。关于具体的样本数量、测序覆盖范围、变量字段、表型种类与文件格式等细节,源站未提供。

【采集与来源】

数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov,由 dbGaP 收录,条目编号为 phs000668。其英文全称标明该数据属于 CHARGE-S 研究中的 ARIC 部分。关于样本采集地点、采集时间、随访安排、测序平台与数据处理流程等具体信息,源站未提供。

【适用场景】

依据其疾病分类与主题标签,该数据集适用于心血管系统疾病、动脉粥样硬化相关的遗传学研究,尤其适合在 GWAS 基础上结合测序数据开展的分析工作;其病例-队列与队列设计也适合需要以队列框架组织样本的研究场景。关于具体的分析类型、可支持的统计模型或已验证的应用案例,源站未提供。

【使用方法】

该数据集通过 dbGaP 平台发布,使用时应遵循 dbGaP 的数据访问与申请流程。关于本数据集的具体下载方式、访问权限层级、配套文档与分析指南,源站未提供。

【质量与限制】

源站仅给出研究设计与分类信息,未提供样本量、数据完整性、质控指标或已知偏倚等质量相关信息,因此这些方面的具体情况源站未提供。使用时应结合 dbGaP 条目页面的最新说明确认数据范围与限制。

【引用与许可】

该数据集来自 dbGaP,引用与许可应遵循 dbGaP 的相关规定及数据访问协议。关于本数据集的具体引用文献、致谢要求与许可条款,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/study.cgi?study_id=phs000668

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

dbGaP study (Case-Cohort, Cohort).

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