动脉粥样硬化中内皮细胞性别二态性转分化 I

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE337648

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
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     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

目的：动脉粥样硬化的性别差异在临床上已被充分认识，但其潜在机制仍未被完全阐明。鉴于内皮细胞（EC）功能障碍在动脉粥样硬化形成中的关键作用，本研究旨在描绘并比较雄性与雌性中EC的命运轨迹，并揭示驱动动脉粥样硬化进展的转录网络。方法与结果：研究构建了两性的EC特异性谱系追踪小鼠（Apoe−/−/Cdh5-CreERT2/Rosa26-mTmG）。在他莫昔芬诱导Cre重组后，给小鼠喂食高脂饮食（HFD）以诱导高胆固醇血症和动脉粥样硬化。对携带斑块的主动脉进行单核RNA测序（snRNA-seq），鉴定并验证了九个不同的EC亚群。使用miloR进行的差异丰度分析显示，雌性主动脉富集表达Sox17、Myh11、Mki67或Ly6a的毛细血管和淋巴管EC，而雄性主动脉富集表达Col8a1和Fmo2的EC。

GeneTrajectory命运推断和单细胞谱系追踪表明，约四分之一的GFP⁺内皮细胞（ECs）转分化为脂肪细胞样细胞、平滑肌细胞（SMC）样细胞和成纤维细胞样细胞。雌性ECs表现出更强的EC向SMC样转化倾向，而雄性ECs则表现出更强的EC向脂肪细胞样转化倾向。使用pySCENIC进行的调控网络分析确定Klf2和Creb5是调控动脉粥样硬化中EC命运决定的关键转录因子。结论：内皮细胞在动脉粥样硬化进展过程中表现出性别特异性的转分化轨迹，导致男性和女性斑块中不同的血管表型，并揭示了精准治疗的潜在靶点。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。