加速的RNA聚合酶II延伸驱动内皮转变与斑块易损性:超级延伸复合物的药理学靶向

该数据集来自NCBI GEO,属于心血管系统疾病/动脉粥样硬化方向,主题为加速的RNA聚合酶II延伸驱动内皮转变与斑块易损性,并涉及超级延伸复合物的药理学靶向

geo
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基因组OtherGPL242479606
GSE330230: Accelerated RNA polymerase II elongation drives endothelial transition and plaque vulnerability: pharmacological targeting of the super elongation complex

基本信息

模态
基因组
创建/更新时间
2026-10-21

资源简介

加速的RNA聚合酶II延伸驱动内皮转变与斑块易损性:超级延伸复合物的药理学靶向

GSE330230 是一个来自 NCBI GEO 的基因表达数据集,归入心血管系统疾病 / 动脉粥样硬化方向。其主题聚焦于加速的 RNA 聚合酶 II 延伸如何驱动内皮转变与斑块易损性,并涉及超级延伸复合物的药理学靶向。该数据集以 SuperSeries 形式组织,由若干 SubSeries 组成,当前可获取的文件为一个 GZIP 压缩的 series matrix 文件。数据集由 Jes-Niels Boeckel 提交,发布时间为 202 年 5 月 7 日,主题标签涉及 Other、GPL24247 与 9606。整体而言,该数据集面向动脉粥样硬化中内皮细胞状态转变与斑块不稳定性的转录调控机制研究,适合作为相关转录组分析的数据来源。

【数据集背景】

该数据集围绕动脉粥样硬化的病理机制展开,核心科学问题是 RNA 聚合酶 II 延伸速率的加快如何推动内皮转变,并进而影响斑块的易损性。研究主题还包含对超级延伸复合物进行药理学靶向的思路,意味着数据可能服务于干预该转录延伸环节的实验设计。数据集被归类于心血管系统疾病 / 动脉粥样硬化,说明其应用背景集中在心血管病理与血管内皮生物学领域。源站标题与数据集英文名一致,均指向“加速的 RNA 聚合酶 II 延伸驱动内皮转变与斑块易损性:超级延伸复合物的药理学靶向”这一研究方向。

【数据内容】

该数据集以 SuperSeries 形式发布,源站描述说明其由下方列出的 SubSeries 组成。当前可获取的文件数量为 1,文件样例为 GSE330230_series_matrix.txt.gz,即一个 GZIP 压缩包形式的 series matrix 文件。主题标签包括 Other、GPL24247 与 9606,其中 GPL24247 为平台标识,9606 对应人类物种标识。数据集的具体样本数量、分组设计、检测指标与差异分析结果等细节,源站未提供。

【采集与来源】

数据来源于 ncbi.nlm.nih.gov,即 NCBI GEO 数据库。提交者为 Jes-Niels Boeckel,发布时间为 May 07 202。数据集的源站标题与英文名一致,均描述 RNA 聚合酶 II 延伸加速与内皮转变、斑块易损性之间的关系,以及超级延伸复合物的药理学靶向。除上述来源信息外,样本采集地点、实验平台的具体型号、建库与测序策略等,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于心血管系统疾病尤其是动脉粥样硬化方向的转录组研究,可用于探讨 RNA 聚合酶 II 延伸调控与内皮细胞状态转变之间的关联,也可为超级延伸复合物作为药理学靶点的相关分析提供数据基础。由于数据集以 SuperSeries 形式组织,适合在 SubSeries 层面开展针对性的表达谱分析。具体可支持的统计比较与验证场景,需依据实际数据内容确定,源站未提供更细化的适用说明。

【使用方法】

使用时可下载数据文件 GSE330230_series_matrix.txt.gz,按 GZIP 压缩包格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入分析流程。由于该数据集为 SuperSeries,实际分析时还需关注其下属 SubSeries 的组织方式。关于具体的读取工具、标准化步骤与下游分析参数,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集当前仅提供一个 series matrix 压缩文件,文件数量有限,且源站描述仅说明其为 SuperSeries 的组成关系,未提供样本量、数据完整性或质控指标等信息。数据的具体质量评估结果、批次效应情况以及潜在的技术偏差,源站未提供。使用时应注意 SuperSeries 与 SubSeries 之间的层级关系,避免重复或遗漏分析。

【引用与许可】

该数据集的提交者为 Jes-Niels Boeckel,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,发布时间为 May 07 202。关于数据集的引用格式、使用许可与再分发条款,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE330230

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

This SuperSeries is composed of the SubSeries listed below.

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