超级增强子驱动的核心转录因子FOXP1通过相分离介导SESN3激活延缓内皮细胞衰老_atac seq
该数据集来自NCBI GEO,标题为超级增强子驱动的核心转录因子FOXP1通过相分离介导SESN3激活延缓内皮细胞衰老的ATAC-seq数据,属于心血管系统疾病/动脉粥样硬化分类

基本信息
资源简介
超级增强子驱动的核心转录因子FOXP1通过相分离介导SESN3激活延缓内皮细胞衰老_atac seq
Super-enhancer-driven core transcription factor FOXP1 delays endothelial cell senescence via phase separation-mediated SESN3 activation_atac seq
该数据集来自NCBI GEO,标题为超级增强子驱动的核心转录因子FOXP1通过相分离介导SESN3激活延缓内皮细胞衰老的ATAC-seq数据,属于心血管系统疾病/动脉粥样硬化分类。数据包含1个文件(GSE303848_series_matrix.txt.gz),主题标签涉及基因组结合/占据谱高通量测序、GPL24676平台及9606物种。数据可用于研究超级增强子在内皮细胞衰老中的表观遗传调控机制,以及FOXP1通过相分离激活SESN3的染色质可及性分析(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Jul 28 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):理由:内皮细胞衰老导致内皮功能障碍,从而促进动脉粥样硬化的进展。超级增强子是关键的表观遗传顺式调控元件,其广泛的重新编程驱动人类疾病中的异常转录。然而,超级增强子在内皮细胞衰老中的潜在机制仍不清楚。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL24676、9606。本站分类:心血管系统疾病/动脉粥样硬化。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE303848
【使用注意】
· 源站最后修改于 Dec 10 202,引用时请注意版本时效。
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
理由:内皮细胞衰老导致内皮功能障碍,从而促进动脉粥样硬化的进展。超级增强子是关键的表观遗传顺式调控元件,其广泛的重新编程驱动人类疾病中的异常转录。然而,超级增强子对内皮细胞衰老的潜在机制仍不清楚。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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