人正常动脉内膜与晚期动脉粥样硬化斑块的miRNA表达谱
该数据集来自NCBI,包含人正常动脉内膜与晚期动脉粥样硬化斑块的miRNA表达谱数据,通过高通量测序对正常供体及严重动脉斑块患者的动脉样本进行转录组测序,重点量化miRNA

基本信息
资源简介
人正常动脉内膜与晚期动脉粥样硬化斑块的miRNA表达谱
GSE226791 是一个聚焦于人类动脉粥样硬化分子机制的 miRNA 表达谱数据集,由 Ben 与 Li 于 2023 年 3 月 7 日发布,收录于 NCBI 站点。该数据集以高通量测序技术为核心手段,对正常供体动脉内膜与严重动脉粥样硬化斑块患者的动脉样本进行转录组测序,重点完成 miRNA 的定量分析,旨在从非编码 RNA 层面探索动脉斑块形成与发展的原因及其分子机制。数据集归属于心血管系统疾病 / 动脉粥样硬化分类,包含 1 个数据文件,即 GSE226791_series_matrix.txt.gz,适合用于比较正常血管内膜与晚期斑块组织之间 miRNA 表达差异的研究场景。
【数据集背景】
动脉粥样硬化是心血管系统疾病中的重要类型,斑块的形成与进展涉及复杂的分子调控过程。为分析动脉斑块形成与发展的原因,该研究对正常供体与严重动脉斑块患者的动脉组织进行采样,并开展转录组测序,以探索其分子机制。该数据集正是这一研究工作中 miRNA 定量部分的成果,属于非编码 RNA 表达谱分析范畴,主题标签明确指向 Non-coding RNA profiling by high throughput sequencing,物种为人(9606),平台信息标注为 GPL15520。
【数据内容】
数据集提供的是人正常动脉内膜与晚期动脉粥样硬化斑块的 miRNA 表达谱数据。其核心内容为对上述两类动脉样本中 miRNA 的量化结果,覆盖正常供体动脉内膜与严重动脉斑块患者动脉样本的对比信息。数据集文件数量为 1,文件样例为 GSE226791_series_matrix.txt.gz,采用 GZIP 压缩格式封装,属于系列矩阵文件形式,便于集中读取样本层面的表达信息。
【采集与来源】
数据来源于 ncbi.nlm.nih.gov,源站标题为“miRNA expression profiling for human normal arterial intimae and advanced atherosclerotic plaques”。样本采集对象包括正常供体与严重动脉斑块患者的动脉组织,研究对这两类样本进行转录组测序,并在此基础上完成 miRNA 的定量。数据由 Ben 与 Li 发布,发布时间为 2023 年 3 月 7 日。除上述信息外,样本的具体数量、供体临床特征、测序平台运行细节等,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于动脉粥样硬化相关的非编码 RNA 研究,尤其是比较正常动脉内膜与晚期动脉粥样硬化斑块之间 miRNA 表达差异的分析。可用于探索斑块形成与发展的潜在分子机制,筛选与疾病进展相关的 miRNA 候选分子,也可作为高通量测序来源的 miRNA 表达谱资源,用于方法学验证或与其他心血管疾病表达谱数据的对照研究。其分类归属心血管系统疾病 / 动脉粥样硬化,适合心血管分子生物学与转化研究方向的用户使用。
【使用方法】
使用时可先下载数据文件 GSE226791_series_matrix.txt.gz,按 GZIP 压缩包格式进行读取。建议先在小样本上核对字段结构与编码方式,确认无误后再批量接入分析流程。由于该文件为系列矩阵形式,读取后应关注样本分组信息与 miRNA 定量值之间的对应关系,以便开展正常内膜与斑块样本的差异比较。具体的分析流程与统计方法需结合研究目的自行设计,源站未提供配套的分析脚本或参数说明。
【质量与限制】
数据集仅包含 1 个文件,以系列矩阵形式提供,未提供原始测序读段或完整的样本元数据说明。样本数量、测序深度、定量方法的具体版本、归一化处理方式等信息,源站未提供。因此在使用时应注意该数据集的覆盖范围有限,结果解释需结合研究设计与生物学背景谨慎进行。此外,数据仅涉及 miRNA 层面的定量,不包含其他转录本类型的系统信息。
【引用与许可】
数据作者为 Ben 与 Li,发布站点为 NCBI。数据集的许可条款、使用协议及正式引用格式,源站未提供,使用前应向源站核实相关要求。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE226791
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
为分析动脉斑块形成与发展的原因,我们对正常供者和严重动脉斑块患者的动脉进行采样,开展转录组测序,以探究其分子机制。该部分包括miRNA的定量分析。
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