C57Bl/6小鼠4月龄主动脉易感与抵抗区域平滑肌细胞数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE13835

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本研究比较了C57Bl/6小鼠主动脉中易发生动脉粥样硬化区域与抵抗动脉粥样硬化区域平滑肌细胞（SMCs）的基因表达。在一项平行实验中，对年轻、无斑块的载脂蛋白E缺陷（apoE-/-）小鼠的这两个区域进行了比较。分离了3只雄性和3只雌性C57Bl6小鼠的主动脉，用Triton X-100灌注以去除内皮细胞，并分为易发生动脉粥样硬化区域（AA：升主动脉、主动脉弓及胸主动脉近端2 mm）和抵抗动脉粥样硬化区域（TA：胸主动脉中段，即距胸主动脉近端2 mm以远6 mm处）。对混合总RNA进行微阵列分析（VIB-MAF），显示70个基因存在差异表达（差异>2倍）。在AA中分别观察到33个基因上调和37个基因下调。使用实时PCR确认了3个基因的差异表达（ATPase, Na+/K+ transporting, beta 1 polypeptide、sarcolipin和homeo box B7）。25个基因仅在C57BL6小鼠中显示独家差异表达。仅7个基因可与特定过程相关联：发育（4个）和细胞生长（3个）。

其他18个基因均参与不同的过程。在C57Bl/6及apoE-/-小鼠中显示差异表达的45个基因里，大多数与发育（13个）、细胞生长（8个）和转录（10个）相关。这些结果表明，在C57Bl/6主动脉易患动脉粥样硬化部位的平滑肌细胞中，转录组发生了改变。这与在动脉粥样硬化易发区域内皮细胞中的发现相一致。这可能归因于生物力学差异，例如血管壁张力或剪切应力的不同，或是AA和TA中平滑肌细胞胚胎起源的差异。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。