主动脉瓣狭窄患者血流动力学预测训练数据

该数据集源自基于计算机断层扫描的人体主动脉 CFD 仿真,针对主动脉瓣狭窄患者,共包含 309 个病例,基于 103 位患者,每位患者以三种不同流量进行模拟,_01 为基线流量,_02 和 _03 为基线的 ±25%

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2022-08-02 更新
浏览 29
基因组预测Computational fluid dynamicshemodynamics dataaortic stenosisArtificial Neural Network
Training Data for Predicting Hemodynamics in Aortic Stenosis Patients

基本信息

模态
基因组
大小
0.005399608 GB
任务类型
预测
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2022-08-02
版本
v1

资源简介

主动脉瓣狭窄患者血流动力学预测训练数据

Training Data for Predicting Hemodynamics in Aortic Stenosis Patients

该数据集源自基于计算机断层扫描的人体主动脉 CFD 仿真,针对主动脉瓣狭窄患者,共包含 309 个病例,基于 103 位患者,每位患者以三种不同流量进行模拟,_01 为基线流量,_02 和 _03 为基线的 ±25%。数据文件包含沿主动脉中心线的静态压力和壁面剪切应力(输出序列),以及中心线坐标、横截面积/形状和流量(输入序列)。该数据可用于训练人工神经网络,从主动脉瓣狭窄患者的几何数据预测压力和壁面剪切应力。共提供两个文件:一个包含输入和输出序列,另一个包含 MATLAB cell 格式的横截面,每个 cell 保存一个图像堆栈(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。

【数据集背景】

项目资助方:Collaborative project: AI (Artificial Intelligence) -based digital therapy support for cardiology (ArtiCardio) - Subproject: Image-based modeling of hemodynamics in cardiovascular diseases。源站首次发布:2022-08-02。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):该数据集源自基于计算机断层扫描的人体主动脉 CFD 仿真,针对主动脉瓣狭窄患者。共呈现 309 个病例,基于 103 位患者。每位患者以三种不同流量进行模拟(例如 case23_01、cas23_02、case_03)。_01 为基线流量,_02 和 _03 为基线流量的 ±25%。数据文件包含沿主动脉中心线的静态压力和壁面剪切应力(输出序列),以及中心线坐标、横截面积/形状和流量(输入序列)。该数据可用于训练人工神经网络,从主动脉瓣狭窄患者的几何数据预测压力和壁面剪切应力。提供两个文件:一个包含输入和输出序列,另一个包含 MATLAB cell 格式的横截面。每个 cell 保存一个图像堆栈,每个图像

【数据结构与技术规格】

文件数 2 个,合计 5.40 MB。数据集 DOI:10.6084/m9.figshare.19478117.v1。

【主题与分类】

源站学科分类:Computational methods in fluid flow, heat and mass transfer (incl. computational fluid dynamics)、Artificial intelligence not elsewhere classified。主题标签:Computational fluid dynamics、hemodynamics data、aortic stenosis、Artificial Neural Network、Computational Fluid Dynamics。本站分类:心血管系统疾病/主动脉瓣狭窄。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Computational methods in fluid flow, heat and mass transfer (incl. computational fluid dynamics)、Artificial intelligence not elsewhere classified。

【获取与许可】

源站页面:https://figshare.com/articles/dataset/Training_Data_for_Predicting_Hemodynamics_in_Aortic_Stenosis_Patients/19478117

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Yevtushenko, Pavlo; Goubergrits, Leonid; Schafstedde, Marie (2022). Training Data for Predicting Hemodynamics in Aortic Stenosis Patients. figshare. Dataset

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源站:https://doi.org/10.6084/m9.figshare.19478117.v1

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 5.4 MB。

数据说明

该数据集源自基于计算机断层扫描的主动脉瓣狭窄患者人体主动脉计算流体力学模拟。共呈现309个案例,基于103名患者。每位患者均在三种不同流速下进行模拟(例如case23_01、case23_02、case_03)。其中_01代表基线流速,_02和_03分别为基线流速的±25%。数据文件包含沿主动脉中心线的静态压力和壁面剪切应力(输出序列),以及中心线坐标、横截面积/形状和流速(输入序列)。这些数据可用于训练人工神经网络,以根据主动脉狭窄患者的几何数据预测压力和壁面剪切应力。提供两个文件:一个包含输入和输出序列;另一个以MATLAB单元格式存储横截面。每个单元包含一个图像堆栈,其中每幅图像代表该案例的一个横截面。文件中的每个单元对应序列文件中的案例。例如,MATLAB文件中的第22个单元包含案例case22_01、case22_02和22_03的横截面。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

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