颅内动脉瘤全基因组关联研究汇总统计2020

该数据集为颅内动脉瘤全基因组关联研究的汇总统计,包含10,754例病例与306,882例对照,分两阶段(欧洲 ancestry 及欧洲与东亚 ancestry)并附东亚子集、动脉瘤性蛛网膜下腔出血、未破裂颅内动脉瘤及排除UK Biobank等额外关联统计文件,共11个文件

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2021-08-16 更新
浏览 4
基因组回归IAintracranial aneurysmSAHsubarachnoid hemorrhagestrokegeneticsgwasisgcsummary statisticsNeurogenetics
Safety and Efficacy of Endovascular Treatment of Unruptured Intracranial Aneurysms in the Prevention of Aneurysmal Haemorrhages: A Randomized Comparison With Indefinite Deferral of Treatment in 2002 Patients Followed for 10 Years

基本信息

模态
基因组
大小
0.800487823 GB
任务类型
回归
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2021-08-16
版本
v3

资源简介

颅内动脉瘤全基因组关联研究汇总统计2020

Intracranial aneurysm genome-wide association study summary statistics 2020

该数据集为颅内动脉瘤全基因组关联研究的汇总统计,包含10,754例病例与306,882例对照,分两阶段(欧洲 ancestry 及欧洲与东亚 ancestry)并附东亚子集、动脉瘤性蛛网膜下腔出血、未破裂颅内动脉瘤及排除UK Biobank等额外关联统计文件,共11个文件。数据可用于探索颅内动脉瘤的遗传风险位点、与临床风险因素的遗传重叠,以及开展遗传关联分析与验证(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。

【数据集背景】

源站首次发布:2021-08-16。

【数据结构与技术规格】

文件数 11 个,合计 800.49 MB。数据集 DOI:10.6084/m9.figshare.11303372.v3。

【主题与分类】

源站学科分类:Genetics not elsewhere classified、Neurogenetics。主题标签:IA、intracranial aneurysm、SAH、subarachnoid hemorrhage、stroke、genetics、gwas、isgc、summary statistics、Genetics。本站分类:心血管系统疾病/动脉瘤。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Genetics not elsewhere classified、Neurogenetics。

【获取与许可】

源站页面:https://figshare.com/articles/dataset/Intracranial_aneurysm_genome-wide_association_study_summary_statistics_2020/11303372

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Bakker, Mark K.; Veldink, Jan; Ruigrok, Ynte (2020). Intracranial aneurysm genome-wide association study summary statistics 2020. figshare. Dataset

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命令行下载

curl -L -o "README.txt" "https://ndownloader.figshare.com/files/29146545"
curl -L -o "ISGC Intracranial Aneurysm Working Group Data Access Policy_v2.docx" "https://ndownloader.figshare.com/files/23235875"
curl -L -o "IA.GWAS.BakkerMK.2020.sumstats.Stage_1.txt.gz" "https://ndownloader.figshare.com/files/23235470"
curl -L -o "IA.GWAS.BakkerMK.2020.sumstats.Stage_2.txt.gz" "https://ndownloader.figshare.com/files/23235473"
curl -L -o "IA.GWAS.BakkerMK.2020.sumstats.SAH-only.txt.gz" "https://ndownloader.figshare.com/files/23235467"
curl -L -o "IA.GWAS.BakkerMK.2020.sumstats.uIA-only.txt.gz" "https://ndownloader.figshare.com/files/23235476"
curl -L -o "IA.GWAS.BakkerMK.2020.sumstats.EastAsianSubset.txt.gz" "https://ndownloader.figshare.com/files/23235911"
curl -L -o "IA.GWAS.BakkerMK.2020.sumstats.Stage_1_excludingUKBB.txt.gz" "https://ndownloader.figshare.com/files/29146428"

文件清单

  • README.txt(4.00 KB)
  • ISGC Intracranial Aneurysm Working Group Data Access Policy_v2.docx(15.86 KB)
  • IA.GWAS.BakkerMK.2020.sumstats.Stage_1.txt.gz(94.97 MB)
  • IA.GWAS.BakkerMK.2020.sumstats.Stage_2.txt.gz(75.59 MB)
  • IA.GWAS.BakkerMK.2020.sumstats.SAH-only.txt.gz(95.14 MB)
  • IA.GWAS.BakkerMK.2020.sumstats.uIA-only.txt.gz(94.47 MB)
  • IA.GWAS.BakkerMK.2020.sumstats.EastAsianSubset.txt.gz(126.28 MB)
  • IA.GWAS.BakkerMK.2020.sumstats.Stage_1_excludingUKBB.txt.gz(95.64 MB)
  • IA.GWAS.BakkerMK.2020.sumstats.Stage_2_excludingUKBB.txt.gz(48.18 MB)
  • IA.GWAS.BakkerMK.2020.sumstats.SAH-only_CrossAncestry_excludingUKBB.txt.gz(95.93 MB)
  • IA.GWAS.BakkerMK.2020.sumstats.SAH-only_European_excludingUKBB.txt.gz(74.27 MB)

文件总体积 800.49 MB(源站 API 实测)。

数据说明

10,754例颅内动脉瘤病例与306,882例对照的全基因组关联研究汇总统计。

数据集描述于:
《颅内动脉瘤全基因组关联研究识别出17个风险位点及其与临床危险因素的遗传重叠》
Bakker, M.K. 等
《自然·遗传学》,2020年11月16日
doi: 10.1038/s41588-020-00725-7
https://www.nature.com/articles/s41588-020-00725-7

该研究包括2个阶段。第1阶段:仅欧洲血统。第2阶段:欧洲和东亚血统。

额外文件:

  • 仅东亚子集的关联统计。
  • 仅动脉瘤性蛛网膜下腔出血与对照的关联统计
  • 仅未破裂颅内动脉瘤与对照的关联统计
  • 排除UK Biobank的关联统计(4个文件):排除UK Biobank的第1阶段、排除UK Biobank的第2阶段、排除UK Biobank的仅欧洲血统aSAH-only,以及排除UK Biobank的跨血统aSAH-only。

请查阅数据访问政策,以获取有关数据使用、访问及额外分析选项的更多信息。

许可

CC BY 4.0

引用

学术使用请引用 DOI 10.6084/m9.figshare.11303372.v3(source: https://figshare.com/articles/dataset/Intracranial_aneurysm_genome-wide_association_study_summary_statistics_2020/11303372)。

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