内皮细胞中由Rbfox2部分介导的可变RNA剪接调控动脉对低血流的反应
该数据集来自NCBI GEO,包含小鼠动脉内皮在低血流与扰动血流条件下的基因表达与可变剪接高通量测序数据,聚焦Rbfox2介导的剪接程序及血小板、巨噬细胞募集的影响

基本信息
资源简介
内皮细胞中由Rbfox2部分介导的可变RNA剪接调控动脉对低血流的反应
Alternative RNA Splicing in the Endothelium Mediated in Part by Rbfox2 Regulates the Arterial Response to Low Flow
该数据集来自NCBI GEO,包含小鼠动脉内皮在低血流与扰动血流条件下的基因表达与可变剪接高通量测序数据,聚焦Rbfox2介导的剪接程序及血小板、巨噬细胞募集的影响。数据可用于研究血流激活的内皮转录与剪接调控机制,探索动脉疾病如动脉粥样硬化和动脉瘤的分子基础,并支持剪接事件识别与调控通路预测分析(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Jul 24 201。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):低血流和扰动血流驱动包括动脉粥样硬化和动脉瘤在内的动脉疾病进展。内皮对血流的反应及其与募集的血小板和白细胞的相互作用决定疾病进展。在此,我们报告了体内血流激活的小鼠动脉内皮中前体mRNA可变剪接的广泛变化。在低血流和扰动血流下,募集到动脉内皮的血小板和巨噬细胞的耗竭抑制了可变剪接。Rbfox家族的结合基序在许多受调控外显子附近富集。Rbfox2是动脉内皮中唯一表达的家族成员,其内皮缺失抑制了低血流诱导的转录和RNA剪接变化的一部分。我们的数据揭示了在内皮中由Rbfox2在血小板募集时激活的可变剪接程序
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL13112、10090。本站分类:心血管系统疾病/动脉瘤。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE101826
【使用注意】
· 源站最后修改于 May 15 201,引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
低而紊乱的血流驱动包括动脉粥样硬化和动脉瘤在内的动脉疾病的进展。内皮对血流的反应及其与募集的血小板和白细胞的相互作用决定了疾病的进展。在此,我们报道了在体内血流激活的小鼠动脉内皮中前体mRNA选择性剪接的广泛变化。在低而紊乱的血流下,通过清除募集到动脉内皮的血小板和巨噬细胞,选择性剪接受到抑制。Rbfox家族的结合基序在许多受调控外显子邻近区域富集。Rbfox2是动脉内皮中唯一表达的家族成员,其内皮特异性缺失抑制了低血流诱导的转录和RNA剪接变化的一部分。我们的数据揭示了在内皮中由Rbfox2在血小板和巨噬细胞募集时激活的选择性剪接程序,并证明了其在血流驱动的血管炎症期间转录反应中的相关性。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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