正常人转甲状腺素蛋白及其致淀粉样变Val30→Met变异体的1.7埃分辨率X射线晶体结构精修
该数据集包含正常人转甲状腺素蛋白及其致淀粉样变Val30→Met变异体的高分辨率三维晶体结构数据,通过X射线衍射技术测定至1.7埃分辨率,数据模态为蛋白质结构坐标与实验元数据,主要用于研究蛋白质错误折叠、淀粉样变性疾病的分子机制以及相关药物靶点的结构基础。

基本信息
资源简介
正常人转甲状腺素蛋白及其致淀粉样变Val30→Met变异体的1.7埃分辨率X射线晶体结构精修
【数据集背景】
本数据集源站标题为《THE X-RAY CRYSTAL STRUCTURE REFINEMENTS OF NORMAL HUMAN TRANSTHYRETIN AND THE AMYLOIDOGENIC VAL 30>MET VARIANT TO 1.7 ANGSTROMS RESOLUTION》。
【数据内容】
源站原始描述:TRANSPORT(THYROXINE)
【主题与分类】
主题标签:TRANSPORT(THYROXINE)。
【获取与许可】
源站页面:https://www.rcsb.org/structure/1ETB
规范引用:The x-ray crystal structure refinements of normal human transthyretin and the amyloidogenic Val-30>Met variant to 1.7-A resolution. (1993) J.Biol.Chem
下载信息
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数据集获取
源站:https://pdbj.org/mine/summary/1etb
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- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集为蛋白质晶体结构数据集,包含正常人转甲状腺素蛋白(TTR)及其致淀粉样变变异体(Val30→Met)的高分辨率三维结构数据。数据通过X射线衍射技术测定,分辨率达1.7埃,包含蛋白质的原子坐标、结构因子及实验元数据。数据集来源于蛋白质数据库(PDB),由Braden、Steinrauf和Hamilton等研究人员于1993年发表,主要应用于结构生物学、蛋白质折叠与聚集机制、淀粉样变性疾病的分子病理机制研究,以及药物靶点发现等领域。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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