TTR CZE FPPHR 片段筛选命中数据
本数据集包含针对转甲状腺素蛋白(TTR)的毛细管区带电泳(CZE)片段筛选数据,采用游离探针峰高恢复(FPPHR)方法,涵盖129个片段的筛选结果、12个共结晶命中结构及后续类似物的实验数据,数据模态包括化学结构、晶体学坐标、热力学参数和生物化学测定结果,主要用于淀粉样变性病药物研发中的片段筛选和先导化合物发现,支持TTR靶点的新型抑制剂设计与优化研究。

基本信息
资源简介
该数据集基于毛细管区带电泳(CZE)片段筛选方法,针对人血浆蛋白转甲状腺素蛋白(TTR)开发。TTR在正常情况下可溶,但可能发生错误折叠和聚集,导致淀粉样变性病。该方法称为游离探针峰高恢复(FPPHR),通过监测已知结合TTR的探针配体在竞争性片段存在下的水平变化来筛选片段。共筛选了129个片段,初始命中16个,其中12个(命中率12.4%)与TTR共结晶,11个(确认率92%)在结合位点被验证。后续类似物筛选发现了一种新型TTR结合支架4-(3H-吡唑-4-基)喹啉,其衍生物通过晶体学、圆二色谱(CD)、等温滴定量热法(ITC)及在纯血浆中的放射性125I-甲状腺素置换实验进一步研究。两个先导分子表现出与Tafamidis相似的ITC Kd和125I-甲状腺素置换IC50值,为转甲状腺素蛋白淀粉样变性病提供了新的潜在药物研发路径。该方法具有可重复性、操作简单、可自动化、无标记、无需靶标固定、非荧光依赖、位点特异性及低假阳性率等特点,适用于多种药物靶点的片段筛选。
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数据集获取(Figshare)
源站:https://figshare.com/articles/dataset/TTR_CZE_FPPHR_Fragment_Hits_/29078413
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数据说明
该数据集基于毛细管区带电泳(CZE)片段筛选方法,针对人血浆蛋白转甲状腺素蛋白(TTR)开发。TTR在正常情况下可溶,但可能发生错误折叠和聚集,导致淀粉样变性病。该方法称为游离探针峰高恢复(FPPHR),通过监测已知结合TTR的探针配体在竞争性片段存在下的水平变化来筛选片段。共筛选了129个片段,初始命中16个,其中12个(命中率12.4%)与TTR共结晶,11个(确认率92%)在结合位点被验证。后续类似物筛选发现了一种新型TTR结合支架4-(3H-吡唑-4-基)喹啉,其衍生物通过晶体学、圆二色谱(CD)、等温滴定量热法(ITC)及在纯血浆中的放射性125I-甲状腺素置换实验进一步研究。两个先导分子表现出与Tafamidis相似的ITC Kd和125I-甲状腺素置换IC50值,为转甲状腺素蛋白淀粉样变性病提供了新的潜在药物研发路径。该方法具有可重复性、操作简单、可自动化、无标记、无需靶标固定、非荧光依赖、位点特异性及低假阳性率等特点,适用于多种药物靶点的片段筛选。
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