ATTR T60A淀粉样变性患者肾脏淀粉样纤维冷冻电镜结构3

该数据集包含从一名ATTR T60A淀粉样变性患者肾脏中提取的淀粉样纤维的冷冻电镜结构数据,数据模态为三维分子结构,分辨率为3.19埃,主要用于研究淀粉样纤维的病理结构、ATTR淀粉样变性的分子机制以及相关药物靶点的发现。

Protein Data Bank Japan
2025-12-17 更新
浏览 25
淀粉样纤维结构ATTR淀粉样变性病
Cryo-EM structure of amyloid fibril extracted from kidney of a variant ATTR T60A amyloidosis patient 3

基本信息

创建/更新时间
2025-12-17

资源简介

ATTR T60A淀粉样变性患者肾脏淀粉样纤维冷冻电镜结构3

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Cryo-EM structure of amyloid fibril extracted from kidney of a variant ATTR T60A amyloidosis patient 3》。

【数据内容】

源站原始描述:Transthyretin, Amyloidosis, ATTR, Kidney, PROTEIN FIBRIL

【数据结构与技术规格】

数据集 DOI:10.1016/j.str.2025.09.008。

【主题与分类】

主题标签:PROTEIN FIBRIL。

【获取与许可】

源站页面:https://www.rcsb.org/structure/9D27

规范引用:Structural and molecular homogeneity of ATTRv-T60A amyloid fibrils across patients and organs. (2025) Structure

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源站:https://pdbj.org/mine/summary/9d27

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集提供了从一名ATTR T60A淀粉样变性患者肾脏中提取的淀粉样纤维的冷冻电镜结构数据,分辨率为3.19埃。数据由Nguyen, A.B、Fernandez-Ramirez, M.C和Saelices, L.等作者提交,于2024年8月8日存入,2025年8月13日公开发布。该结构是转甲状腺素蛋白(Transthyretin)相关的淀粉样纤维,支持了《Structure》期刊2025年的研究,揭示了ATTRv-T60A淀粉样纤维在患者和器官间的结构和分子同质性。该数据集主要用于研究淀粉样纤维的病理结构、ATTR淀粉样变性的分子机制,以及药物靶点发现。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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