ATTR T60A淀粉样变性患者肾脏淀粉样纤维冷冻电镜结构3
该数据集包含从一名ATTR T60A淀粉样变性患者肾脏中提取的淀粉样纤维的冷冻电镜结构数据,数据模态为三维分子结构,分辨率为3.19埃,主要用于研究淀粉样纤维的病理结构、ATTR淀粉样变性的分子机制以及相关药物靶点的发现。

基本信息
资源简介
ATTR T60A淀粉样变性患者肾脏淀粉样纤维冷冻电镜结构3
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Cryo-EM structure of amyloid fibril extracted from kidney of a variant ATTR T60A amyloidosis patient 3》。
【数据内容】
源站原始描述:Transthyretin, Amyloidosis, ATTR, Kidney, PROTEIN FIBRIL
【数据结构与技术规格】
数据集 DOI:10.1016/j.str.2025.09.008。
【主题与分类】
主题标签:PROTEIN FIBRIL。
【获取与许可】
源站页面:https://www.rcsb.org/structure/9D27
规范引用:Structural and molecular homogeneity of ATTRv-T60A amyloid fibrils across patients and organs. (2025) Structure
下载信息
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数据集获取
源站:https://pdbj.org/mine/summary/9d27
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集提供了从一名ATTR T60A淀粉样变性患者肾脏中提取的淀粉样纤维的冷冻电镜结构数据,分辨率为3.19埃。数据由Nguyen, A.B、Fernandez-Ramirez, M.C和Saelices, L.等作者提交,于2024年8月8日存入,2025年8月13日公开发布。该结构是转甲状腺素蛋白(Transthyretin)相关的淀粉样纤维,支持了《Structure》期刊2025年的研究,揭示了ATTRv-T60A淀粉样纤维在患者和器官间的结构和分子同质性。该数据集主要用于研究淀粉样纤维的病理结构、ATTR淀粉样变性的分子机制,以及药物靶点发现。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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