人类系统性AA淀粉样变性(血管变异型)淀粉样蛋白原纤维结构数据集
该数据集提供了人类系统性AA淀粉样变性(血管变异型)的淀粉样蛋白原纤维结构数据,数据模态为通过电子显微镜技术获取的高分辨率(2.56 Å)蛋白质结构数据,主要包含淀粉样蛋白A的分子构象信息,可用于研究淀粉样蛋白的聚集机制、AA型系统性淀粉样变性的病理基础,并为相关疾病的药物研发和诊断方法提供结构生物学依据。

基本信息
资源简介
人类系统性AA淀粉样变性(血管变异型)淀粉样蛋白原纤维结构数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Amyloid fibril from human systemic AA amyloidosis (vascular variant)》。
【数据内容】
源站原始描述:Amyloids, Vascular AA, SAA, Cryo-EM, PROTEIN FIBRIL
【数据结构与技术规格】
数据集 DOI:10.1038/s41467-022-34636-4。
【主题与分类】
主题标签:PROTEIN FIBRIL。
【获取与许可】
源站页面:https://www.rcsb.org/structure/7ZKY
规范引用:Amyloid fibril structure from the vascular variant of systemic AA amyloidosis. (2022) Nat Commun
下载信息
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数据集获取
源站:https://pdbj.org/mine/summary/7zky
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- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集包含人类系统性AA淀粉样变性(血管变异型)的淀粉样蛋白原纤维结构数据。数据来源于人类样本,通过电子显微镜技术(分辨率为2.56 Å)获取,主要包含淀粉样蛋白A的结构信息。该数据集由Banerjee, S, Schmidt, M, Faendrich, M等研究人员于2022年4月13日提交,并于2022年12月7日公开发布。主要研究方向包括淀粉样蛋白的结构解析、AA型系统性淀粉样变性的病理机制研究,以及相关疾病的诊断和治疗靶点探索。相关研究成果已发表于《自然通讯》期刊(2022年,第13卷)。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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