PRJNA1261837：平滑肌细胞内源性CSE/H₂S调控腹主动脉瘤的新型表观遗传机制研究 [ChIP-Seq]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1261837

标准获取流程：

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2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本研究采用ChIP-seq技术探究CSE对血管平滑肌细胞(VSMCs)表观遗传修饰的影响，并揭示其对全基因组DNA结合的影响。我们对CSE敲除小鼠和野生型(WT)小鼠的原代平滑肌细胞在Ang II刺激24小时后，针对H3K9me3、H3K9ac和H3K4me3进行了ChIP-seq实验。我们的研究结果表明，平滑肌中的内源性CSE/H₂S通过表观遗传修饰调控细胞外基质的表达，并参与腹主动脉瘤(AAA)的发生与发展。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。