小鼠腹主动脉瘤mRNA与长链非编码RNA表达谱数据集

资源简介

小鼠腹主动脉瘤mRNA与长链非编码RNA表达谱数据集

GSE63396 是一个来自 NCBI GEO 的基因表达谱数据集，主题为小鼠腹主动脉瘤（AAA）组织中 mRNA 与长链非编码 RNA 的表达情况。该数据集比较了发生腹主动脉瘤与未发生腹主动脉瘤的小鼠腹主动脉组织，采用表达谱芯片平台（GPL15691）进行检测，物种为小鼠（10090）。数据集归属于心血管系统疾病中的腹主动脉瘤方向，由 Q，Cui 提交，发布时间为 2014 年 11 月 18 日。数据集共包含 1 个文件，样例文件为 GSE63396_series_matrix.txt.gz，可为研究腹主动脉瘤相关转录本表达变化提供原始表达谱资源。

【数据集背景】

腹主动脉瘤是心血管系统疾病中的一种重要血管病变，其发生发展涉及血管壁组织在基因表达层面的复杂改变。除蛋白质编码基因外，长链非编码 RNA 也被认为可能参与血管病理过程的调控。该数据集正是围绕这一背景，对小鼠腹主动脉瘤模型与非腹主动脉瘤对照的腹主动脉组织同时进行 mRNA 和长链非编码 RNA 的表达谱检测，以支持对腹主动脉瘤相关转录本的系统性观察与比较。

【数据内容】

数据集提供的是小鼠腹主动脉瘤组织与无腹主动脉瘤的腹主动脉组织中 mRNA 和长链非编码 RNA 的表达谱数据。数据以表达谱芯片结果的形式组织，最终以系列矩阵文件 GSE63396_series_matrix.txt.gz 的形式提供，该文件为 GZIP 压缩格式。数据覆盖的物种为小鼠（10090），检测平台为 GPL15691，主题标签表明其属于 expression profiling by array 类型。数据集文件总数为 1 个。

【采集与来源】

该数据集来源于 NCBI GEO，源站标题为“Expression profiling of mRNAs and long noncoding RNAs in mouse Abdominal Aortic Aneurysm (AAA)”，源站描述指出其内容为伴有腹主动脉瘤与不伴腹主动脉瘤的小鼠腹主动脉中 mRNA 和长链非编码 RNA 的谱图。数据由 Q，Cui 提交，发布时间为 2014 年 11 月 18 日。数据集的分类归属为心血管系统疾病 / 腹主动脉瘤。

【适用场景】

该数据集适用于腹主动脉瘤相关的转录组层面研究，例如比较腹主动脉瘤组织与对照腹主动脉组织之间 mRNA 和长链非编码 RNA 的表达差异，筛选与疾病相关的候选转录本，以及为后续实验验证提供表达谱层面的线索。由于同时涵盖 mRNA 与长链非编码 RNA，也可用于探讨非编码 RNA 在腹主动脉瘤中的潜在作用。具体样本数量、分组规模与统计设计源站未提供。

【使用方法】

使用时可下载数据文件 GSE63396_series_matrix.txt.gz，该文件为 GZIP 压缩包，需按相应格式解压与读取。建议先在小样本上核对字段结构与编码方式，确认无误后再进行批量接入与分析。分析时可结合平台信息 GPL15691 对探针与基因的对应关系进行注释。具体的预处理步骤、归一化方法与分析流程源站未提供。

【质量与限制】

该数据集仅包含 1 个文件，数据规模有限；样本数量、生物学重复情况、实验批次信息以及质控指标源站未提供。数据基于表达谱芯片平台，其结果依赖于平台探针设计与杂交性能。使用时应结合平台注释信息谨慎解读，并注意该数据集仅针对小鼠腹主动脉瘤模型，向其他物种或其他血管疾病的推广需谨慎。源站未提供更详细的质量评估信息。

【引用与许可】

该数据集由 Q，Cui 提交，来源于 NCBI GEO，源站标题为“Expression profiling of mRNAs and long noncoding RNAs in mouse Abdominal Aortic Aneurysm (AAA)”。使用时应遵循 NCBI GEO 的相关使用与引用规范，并引用该数据集对应的原始研究。具体的许可条款与引用文献信息源站未提供。