腹主动脉瘤发病机制相关转录组变化
该数据集来自 NCBI GEO,聚焦腹主动脉瘤发病机制相关的转录组变化。研究在低密度脂蛋白受体缺陷小鼠中建立 Angiotensin II 诱导的腹主动脉瘤模型,并对呈现不同严重程度的腹主动脉组织进行基因表达谱分析

基本信息
资源简介
腹主动脉瘤发病机制相关转录组变化
GSE285959 是一个聚焦腹主动脉瘤发病机制相关转录组变化的数据集,来源于 NCBI GEO(ncbi.nlm.nih.gov),归入心血管系统疾病 / 腹主动脉瘤分类。该研究在低密度脂蛋白受体缺陷小鼠中建立 Angiotensin II(Ang II)诱导的腹主动脉瘤模型,并对呈现不同严重程度的腹主动脉组织进行基因表达谱分析,旨在从转录组层面刻画与腹主动脉瘤发病相关的基因表达改变。数据集由 Yaozhong,Liu 提交,发布时间为 Jan 06 202,包含 1 个数据文件,主题标签涉及高通量测序表达谱分析、GPL24247 平台与 10090 物种编号,可为腹主动脉瘤机制研究与相关数据分析提供表达谱资源。
【数据集背景】
腹主动脉瘤是心血管系统疾病中的重要类型,其发病机制涉及血管壁结构重塑与基因表达调控的改变。该数据集围绕腹主动脉瘤发病机制这一主题,采用 Angiotensin II 诱导的低密度脂蛋白受体缺陷小鼠模型,对腹主动脉组织在疾病不同严重程度下的转录组变化进行观察,从而为理解疾病发生发展过程中的分子层面改变提供数据基础。数据集的源站标题为“Transcriptomic change related to abdominal aortic aneurysm pathogenesis”,与其研究主题一致。
【数据内容】
数据集包含 1 个文件,文件样例为 GSE285959_series_matrix.txt.gz,属于表达谱系列矩阵文件,采用 GZIP 压缩格式。主题标签显示其数据类型为高通量测序表达谱分析(Expression profiling by high throughput sequencing),涉及平台编号 GPL24247 与物种编号 10090。源站描述表明,研究分析了呈现不同严重程度的腹主动脉组织的基因表达谱,因此数据内容对应腹主动脉瘤模型下不同病变程度的组织转录组表达信息。关于矩阵文件中具体包含的样本数量、基因数量、分组细节与注释字段,源站未提供。
【采集与来源】
数据来源于 NCBI GEO,源站地址为 ncbi.nlm.nih.gov。研究采用低密度脂蛋白受体缺陷小鼠建立 Angiotensin II 诱导的腹主动脉瘤模型,并对腹主动脉组织进行基因表达谱分析。数据集作者为 Yaozhong,Liu,发布时间为 Jan 06 202。除上述信息外,关于样本采集的具体流程、测序平台运行细节、组织取材与严重程度分级标准等,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于与腹主动脉瘤发病机制相关的转录组分析,例如比较不同严重程度腹主动脉组织之间的基因表达差异、探索与疾病进展相关的表达模式,以及作为心血管系统疾病表达谱研究的参考数据。由于其主题标签指向高通量测序表达谱,也可用于表达谱数据的整合分析与方法验证。关于该数据集在其他具体研究场景中的适用性,源站未提供。
【使用方法】
使用时可下载数据文件 GSE285959_series_matrix.txt.gz,按 GZIP 压缩包格式进行读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入分析流程。关于文件内具体字段含义、数据处理步骤与分析参数,源站未提供。
【质量与限制】
数据集仅包含 1 个文件,文件样例为系列矩阵文件,关于样本重复数、测序深度、数据完整性评估与质量控制指标,源站未提供。该研究基于低密度脂蛋白受体缺陷小鼠的 Ang II 诱导模型,其结果向其他物种或人群的外推需谨慎。关于数据可能存在的批次效应、缺失值或其他技术限制,源站未提供。
【引用与许可】
数据集作者为 Yaozhong,Liu,来源站为 NCBI GEO。关于该数据集的正式引用格式、发表文献信息与使用许可条款,源站未提供。
下载信息
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暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
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公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE285959
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
在低密度脂蛋白受体缺陷小鼠中建立了血管紧张素II(Ang II)诱导的腹主动脉瘤模型,并对表现出不同严重程度的腹主动脉组织中的基因表达谱进行了分析。
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