GSE275617:ATAC-Seq分析揭示VSMCs中Arid3a依赖的染色质可及性变化

该数据集来自NCBI GEO,聚焦心血管系统疾病中的腹主动脉瘤。研究利用ATAC-seq技术分析血管平滑肌细胞(VSMCs)中Arid3a依赖的染色质可及性变化,识别关键基因表达改变,并将Arid3a与肌动蛋白丝动态及腹主动脉瘤发病机制相关联

geo
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基因组分类GPL3429010090
GSE275617: ATAC-Seq Analysis Reveals Arid3a-Dependent Chromatin Accessibility Changes in VSMCs

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-18

资源简介

GSE275617:ATAC-Seq分析揭示VSMCs中Arid3a依赖的染色质可及性变化

ATAC-Seq Analysis Reveals Arid3a-Dependent Chromatin Accessibility Changes in VSMCs

该数据集来自NCBI GEO,聚焦心血管系统疾病中的腹主动脉瘤。研究利用ATAC-seq技术分析血管平滑肌细胞(VSMCs)中Arid3a依赖的染色质可及性变化,识别关键基因表达改变,并将Arid3a与肌动蛋白丝动态及腹主动脉瘤发病机制相关联。数据包含1个文件(GSE275617_series_matrix.txt.gz),属于基因组结合/占据谱分析类高通量测序数据,可用于研究Arid3a在VSMCs中的调控作用及腹主动脉瘤相关机制(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Aug 25 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):本研究利用ATAC-seq揭示Arid3a在VSMCs中的染色质可及性效应,识别关键基因表达变化,并将Arid3a与腹主动脉瘤(AAA)发病机制相关的肌动蛋白丝动态联系起来。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL34290、10090。本站分类:心血管系统疾病/腹主动脉瘤。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE275617

【使用注意】

· 源站最后修改于 Aug 30 202,引用时请注意版本时效。

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数据说明

This study leverages ATAC-seq to reveal Arid3a’s chromatin accessibility effects in VSMCs, identifying key gene expression changes and implicating Arid3a in actin filament dynamics linked to AAA pathogenesis.

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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