主动脉血管树(AVT)CTA 数据集与分割

该数据集包含 56 例 CTA 扫描,主要来自健康主动脉,覆盖主动脉弓及其分支,以及腹主动脉与髂动脉,并提供主动脉及其分支(主动脉血管树)的二值掩膜分割

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2023-05-30 更新
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图像图像分割Aortic Vessel TreesSegmentationsCTAAortaBranchesaortic dissectionabdominal aortic aneurysmground truthmasksdeep learningComputer VisionData Format
Aortic Vessel Tree (AVT) CTA Datasets and Segmentations

基本信息

模态
图像
大小
6.310671701 GB
任务类型
图像分割
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2023-05-30
版本
v1

资源简介

主动脉血管树(AVT)CTA 数据集与分割

Aortic Vessel Tree (AVT) CTA Datasets and Segmentations

该数据集包含 56 例 CTA 扫描,主要来自健康主动脉,覆盖主动脉弓及其分支,以及腹主动脉与髂动脉,并提供主动脉及其分支(主动脉血管树)的二值掩膜分割。集合中包含 1 例腹主动脉瘤(AAA)和 5 例主动脉夹层(AD)病例。数据可用于主动脉血管树的自动分割、深度学习模型训练与评估,以及心血管影像相关的计算机视觉研究(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。

【数据集背景】

配套论文《AVT: Multicenter aortic vessel tree CTA dataset collection with ground truth segmentation masks》发表于 Data in Brief(2022),DOI:10.1016/j.dib.2022.107801。项目资助方:CAMed (COMET K-Project 871132)。源站首次发布:2022-01-06。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):这些数据集包含 56 例 CTA 扫描,主要来自健康主动脉,覆盖主动脉弓及其分支,以及腹主动脉与髂动脉。此外,我们纳入了主动脉及其分支(主动脉血管树)的分割(掩膜),为二值掩膜图像。注意:该集合包含 1 例腹主动脉瘤(AAA)和 5 例主动脉夹层(AD)病例。-如果您在工作中使用这些数据集,请使用以下引用:L. Radl, et al. “Aortic Vessel Tree (AVT) CTA Datasets and Segmentations“. Figshare, 2021. L. Radl, Y. Jin, A. Pepe, J. Li, C. Gsaxner, F. Zhao, J. Egger. “AVT: Multicenter Aortic Vessel Tree CTA Dataset Collection with Ground Truth Segmentation Masks“. Data in Brief (DIB), Elsevier, 107801, 2022. 该集合部分基于其他公共数据集合,适用相应的许可。-这些数据集可以快速

【数据结构与技术规格】

文件数 4 个,合计 6.31 GB。数据集 DOI:10.6084/m9.figshare.14806362.v1。

【主题与分类】

源站学科分类:Computer vision、Data models, storage and indexing、Image processing、Knowledge representation and reasoning。主题标签:Aortic Vessel Trees、Segmentations、CTA、Aorta、Branches、aortic dissection、abdominal aortic aneurysm、ground truth、masks、deep learning。本站分类:心血管系统疾病/腹主动脉瘤。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Computer vision、Data models, storage and indexing、Image processing、Knowledge representation and reasoning。

【获取与许可】

源站页面:https://figshare.com/articles/dataset/Aortic_Vessel_Tree_AVT_CTA_Datasets_and_Segmentations/14806362

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Radl, Lukas; Jin, Yuan; Pepe, Antonio; Li, Jianning; Gsaxner, Christina; Zhao, Fen-hua; et al. (2022). Aortic Vessel Tree (AVT) CTA Datasets and Segmentations. figshare. Dataset

【使用注意】

· 源站最后修改于 2023-05-30,引用时请注意版本时效。

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使用方式

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源站:https://doi.org/10.6084/m9.figshare.14806362

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 6.31 GB。

数据说明

数据集包含56例CTA扫描,主要来自健康主动脉,涵盖主动脉弓及其分支,以及腹主动脉和髂动脉。此外,我们还提供了主动脉及其分支(主动脉血管树)的分割(掩膜),以二值掩膜图像形式呈现。注意:该数据集包含1例腹主动脉瘤(AAA)和5例主动脉夹层(AD)病例。-如果您在研究中使用了这些数据集,请使用以下引用:L. Radl, et al. “Aortic Vessel Tree (AVT) CTA Datasets and Segmentations“. Figshare, 2021. L. Radl, Y. Jin, A. Pepe, J. Li, C. Gsaxner, F. Zhao, J. Egger. “AVT: Multicenter Aortic Vessel Tree CTA Dataset Collection with Ground Truth Segmentation Masks“. Data in Brief (DIB), Elsevier, 107801, 2022. 该数据集部分基于其他公共数据集合构建,适用相应的许可协议。-可使用StudierFenster快速查看这些数据集:www.studierfenster.at AI-guided Therapies (AIT), Institute for Artificial Intelligence in Medicine (IKIM), University Hospital Essen (UKE), Germany

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

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