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INFOBOX — ISLES 2026 一屏速览
维度 内容 本质 ISLES 系列第 7 届(2015/2016/2017/2018/2022/2024/2026)缺血性卒中病灶分割挑战赛,MICCAI 2026 认可 卫星会 SWITCH+ Workshop(MICCAI 2026),Springer LNCS 出版;与 TopBrain2、TopAneu 同场联合全天卫星会 平台 Grand Challenge( isles-26.grand-challenge.org),Docker 容器在线评测任务 原生空间 T1w MRI 多期(急性/亚急性/慢性)缺血性卒中病灶二值分割 输入 T1w MRI + JSON 元数据(DAYS_POST_STROKE / CHRONICITY / CENTER,官方明确允许用作模型输入) 训练数据 ATLAS v3.0:1,453 例公开(955 结转 + 169 SOOP + 329 新增;train 1,282 + val 171) 隐藏测试 Generalizability Set 362 例,仅 Docker 在线评测,不公开下载 规模口径 官方宣称约 2,000 例,实证合计 1,815 例(双口径存照) 中心数 官方宣称 60+ 中心;方法论文训练子集口径 55 中心(双口径存照) 排名 官方规则 case-level 逐例计分;GC 榜单默认展示 mean rank(双口径存照) 首个方法基准 MedNeXt-L(k=5)+ 3D CarveMix:5 折 Dice 0.648(无增强 0.630);慢性期平台约 0.66;急性期最难 时间线 04-24 Batch 1 → 06-12 Batch 2 → 07-30 提交开放 → 08-19 Docker 截止 → 08-30 表单截止 → 09-27 榜单 获取 NITRC INDI 门户登记 + Google Form 逐人领取 aes-256-cbc 解包密码(raw 8.2 GB / preprocessed 14.8 GB) 库内互链 isles(rid 495,系列六届)、atlas-v2(rid 489,直系前作)、topbrain2026(rid 632)、topaneu2026(rid 637)
ISLES 2026 是卒中影像分割界「祖师爷级」挑战赛 ISLES 的第 7 届:它把赛事本质做了一次反转——前几届是「找数据配比赛」,这一届是「以比赛定数据」。训练本体直接采用卒中影像社区期待多年的 ATLAS v3.0:1,453 例公开 T1w MRI(由 ATLAS v2.0 结转 955 例、SOOP 队列 169 例、全新多中心采集 329 例构成),外加 362 例只进不出、仅限 Docker 在线评测的隐藏泛化测试集。任务也回到更「硬核」的设定:强制在原生空间做 T1w 单模态多期梗死分割——急性期病灶在 T1w 上几乎隐形,模型必须靠元数据与跨中心先验硬啃。本条目同时是 ATLAS 谱系(rid 489)与 ISLES 系列(rid 495)两条库内线的交汇点。
导语读法三则:
- 只想下数据:直奔 §6——注意密码要走 Google Form 逐人发放,没有一键直链;license 条款存在官方未明示的空白(坑 6)。
- 准备参赛或复现:直奔 §4 任务规则与 §5 基准——MedNeXt-L + CarveMix 的 0.648 是当前公开可对标的首个数字。
- 关心 ATLAS v3.0 本体:直奔 §3 版本链——955 + 169 + 329 的构成、旧验证掩码首次释放、v2.0 隐藏测试并入公开,三个变化都在这届发生。
§0 导读:这个数据集解决什么问题
卒中是全球致死致残的首要原因之一,而「梗死灶到底占了多大范围」直接决定治疗决策与预后判断。自动分割梗死病灶因此成为神经影像 AI 的经典命题:临床影像以 DICOM 原生空间存储,多中心设备、协议、病程期差异巨大,一个在单中心配准数据上刷出高分的模型,到了原生空间、跨中心、跨病程的真实环境往往大幅掉分——这就是所谓的泛化鸿沟。
ISLES 系列从 2015 年起就是这块试金石的官方度量衡(六届历史见库内条目 rid 495)。到 2026 年,系列面临两个新问题。第一,历届数据集各自为战:ISLES 2022 用 250 例 CTA 灌注数据,ISLES 2024 用 250 例多模态数据,数量级停留在数百,而社区真正长期使用的是 ATLAS 谱系的 T1w 大样本库——两条线始终没有合流。第二,多模态方案在历届挑战赛中越做越强,但临床上大量存量数据只有 T1w 一个序列,单模态原生空间分割仍是短板。
ISLES 2026 的回答是一次「三合一」。其一,数据合流:训练集直接采用 ATLAS v3.0,把 ATLAS v2.0 的 955 例、南卡罗来纳大学 SOOP 队列的 169 例和全新多中心采集的 329 例合成一个 1,453 例的公开训练池,60+ 中心的规模使它成为 T1w 卒中分割迄今最大的监督学习数据池之一(官方口径)。其二,任务回归:强制原生空间、强制 T1w 单模态输入,但官方明确允许使用 DAYS_POST_STROKE(卒中后天数)、CHRONICITY(病程分期)、CENTER(中心标识)三个元数据字段作为辅助输入——把「怎么用先验信息」本身变成考题。其三,评测收紧:362 例隐藏泛化测试集只认 Docker 容器在线提交,排名采用 case-level 逐例计分,抑制「在公开集上过拟合再交排名」的老问题。
§0 读法三则:
- 这个条目有双重身份:它既是挑战赛条目(赛制、时间线、榜单规则),又是 ATLAS v3.0 数据集条目(规模、标注、获取)——检索「ATLAS v3.0」的读者也应落到本条。
- 全文硬数字均出自官方挑战赛页、Zenodo 挑战赛摘要(DOI 10.5281/zenodo.19886303)与首批方法论文(arXiv:2608.23882);官方宣传口径与实证数字的四处冲突已在 §10 与附录存照。
- 本届与前作的三个「不同」最易踩坑:原生空间(2024 届是配准空间)、T1w 单模态(2022/2024 届是多模态)、数据本体是 ATLAS 而非新采集挑战赛数据(坑 1、坑 2)。
§1 数据集速览:十问十答
Q1:ISLES 2026 到底是挑战赛还是数据集?
两者都是,但「数据集」的分量更重:训练数据就是 ATLAS v3.0(1,453 例公开 + 362 例隐藏测试),挑战赛是这批数据的官方发布形式与基准评测活动。赛后数据继续经 NITRC INDI 门户以 ATLAS 名义分发。
Q2:1,453 例怎么构成的?
ATLAS v2.0 结转 955 例 + SOOP 队列 169 例 + 全新多中心 329 例。官方拆分为 train 1,282 + validation 171;validation 部分的病灶掩膜(含 ATLAS v2.0 时代未公开的验证掩码)随 v3.0 首次释放。
Q3:输入是什么模态?和前几届有何不同?
只有 T1w 一模态,且强制原生空间(剥颅骨)。ISLES 2022/2024 用多模态(CTA、DWI、FLAIR 等组合),ISLES 2026 反向收缩到单模态,考的是「数据少信息弱时方法还能走多远」。
Q4:元数据能被模型用吗?
能,而且官方鼓励。每例附带 JSON:DAYS_POST_STROKE(起病后天数)、CHRONICITY(急性/亚急性/慢性分期)、CENTER(中心标识)。这是官方首次把「元数据利用策略」明文写进输入规范。
Q5:标注是谁做的?
专家手工勾画的缺血性梗死病灶二值掩膜,训练集全例覆盖(包括掩膜为空的例——T1w 上无明显病灶也是有效样本)。SOOP 部分沿用南卡罗来纳大学公开卒中队列的既有标注,具体标注协议见 ATLAS 谱系(rid 489)。
Q6:测试集为什么不公开?
362 例 Generalizability Set 保留在官方手中,参赛者把算法打包成 Docker 容器推到 Grand Challenge 平台,在线跑分。防泄漏是明面理由,case-level 排名口径也依赖在线评测。
Q7:排名怎么算?
官方规则按 case-level 计分(逐例比较参赛者与基准的胜负),而 Grand Challenge 榜单界面默认展示 mean rank。两套口径并存,读榜前必须先确认自己看的是哪一套(坑 4)。
Q8:目前公开的性能基准是多少?
首批方法论文(Teo & Punithakumar,arXiv:2608.23882):MedNeXt-L(kernel size 5)+ 3D CarveMix 数据增强,5 折交叉验证平均 Dice 0.648(对照组无 CarveMix 为 0.630)。慢性期平台期 Dice 约 0.66,急性期(起病 7 天内)最难。正式榜单已于 2026-09-27 在 SWITCH-MICCAI’26 现场公布。
Q9:数据怎么拿?
NITRC INDI 门户(fcon_1000.projects.nitrc.org/indi/retro/atlas_download.html)登记后下载 aes-256-cbc 加密 tar 包,解包密码经 Google Form 逐人发放。raw 8.2 GB,preprocessed 14.8 GB。S3 路径 fcp-indi/data/Projects/INDI/ATLAS/R3.0。
Q10:license 是什么?
官方渠道未明示 ATLAS v3.0 的正式许可条款——这是本条目最重要的遗留疑点(坑 6)。前作 ATLAS v2.0 为 CC BY-NC-SA 4.0,但不得直接外推。另一端,MICCAI 榜单准入硬性要求参赛算法以 Apache 2.0 或同级许可开源。
Q11:想对齐 0.648 这个数字复现,要锁哪些变量?
四个必须对齐的口径:① 网络与配置:MedNeXt-L,kernel size 5;② 增强:3D CarveMix 开关(0.648 为开,0.630 为关,差值即增强贡献);③ 评估:5 折交叉验证平均 Dice,折划分以论文描述为准(官方未强制统一划分方案,自建折划分的数字只可内部比较);④ 数据范围:论文训练子集口径 55 中心,与官方全量口径的差异自行核对论文附录。锁不齐这四项,跑出的数字与 0.648 之间没有可比性承诺。
Q12:preprocessed 包(14.8 GB)和 raw 包(8.2 GB)怎么选?
preprocessed 是官方预处理口径(含剥颅骨等产物,体量更大),适合快速复现与直接训练;raw 保留更多原始形态,适合自建预处理或研究预处理本身的影响。两包均为 aes-256-cbc 加密 tar,密码同一发放流程。选择原则:以「对齐官方基线」为目标选 preprocessed,以「控制预处理变量」为目标选 raw——混用两包的产物而不声明来源,是复现对齐失败的高频原因。
§2 数据构成与规格
2.1 总账:三个来源合成一个训练池
ISLES 2026 训练数据本体是 ATLAS v3.0,公开部分 1,453 例,由三路数据汇成:
| 来源 | 例数 | 说明 |
|---|---|---|
| ATLAS v2.0 结转 | 955 | v2.0 时代 train/val 与隐藏测试的合计并入;旧验证掩码首次释放 |
| SOOP 队列 | 169 | 南卡罗来纳大学公开卒中数据集(Christopher Rorden 团队) |
| 全新多中心采集 | 329 | 本届新增,官方未逐中心披露构成 |
| 合计 | 1,453 | 官方拆分 train 1,282 + validation 171 |
隐藏侧另有 Generalizability Set 362 例,公开加隐藏合计 1,815 例。官方宣传口径为「约 2,000 例」,两套口径已在坑 3 存照。
2.2 影像规格:原生空间与剥颅骨
每例为原生空间的剥颅骨 T1w MRI。三个关键词各有分量:
- 原生空间:不做模板配准,保留每例真实的解剖坐标与形变。与 ISLES 2024(配准到公共空间)形成鲜明对照,也意味着模型必须自己处理头位、脑室形态、病灶位置的空间变异。
- 剥颅骨:官方预处理的统一基线,去除外围干扰;preprocessed 版本(14.8 GB)即按此口径打包。
- T1w 单模态:信息量低于多模态组合,但对应临床最大存量的序列配置。急性期梗死在 T1w 上可无明显密度对比,这一物理事实决定了任务性能天花板(见 §5)。
文件分发分 raw(8.2 GB)与 preprocessed(14.8 GB)两包,均为 aes-256-cbc 加密 tar。
2.3 JSON 元数据:三个字段就是三道题
每例附 JSON 侧信息,三个字段全部被官方明文允许作为模型输入:
| 字段 | 含义 | 对模型的用途与陷阱 |
|---|---|---|
| DAYS_POST_STROKE | 卒中起病后天数(整数) | 病程期最强先验;但直接当回归特征可能过拟合中心间的收治偏好 |
| CHRONICITY | 病程分期(急性/亚急性/慢性) | 类别化版本;急性期(约 7 天内)T1w 对比度最弱、标注一致性最低 |
| CENTER | 中心标识 | 跨中心泛化的双刃剑:可用于域自适应,也可能诱导模型「认中心不认病灶」——官方隐藏测试集正是冲着这一点设计的 |
2.4 掩膜规格
- 二值掩膜(梗死病灶 vs 背景),专家手工勾画;
- 全例覆盖,含掩膜面积为 0 的例(T1w 未见明确病灶)——这批阴性例对「把非病灶误判为病灶」的假阳性行为是有效约束;
- 坐标系与影像对齐,NIfTI 格式分发;
- v2.0 时代未公开的验证集掩码(对应 171 例 validation)随 v3.0 首次释放,这是 ATLAS 谱系用户等待四年的增量。
2.5 与库内前作数据的边界
- 与 ATLAS v2.0(rid 489):v2.0 的 655 例 train/val 与 300 例隐藏测试在本届全部并入公开池(合计 955);v2.0 的隐藏测试身份随之终结,其掩膜在 v3.0 中公开。
- 与 SOOP:169 例为整队列并入,标注协议由原团队(Rorden 等)提供。
- 与 ISLES 2022/2024 训练数据:无影像重叠(那两届用 CTA 灌注与多模态数据),但组织方与平台一脉相承。
§3 ATLAS 版本链:从 304 到 1,815
ATLAS 是「Autosomal-dominant Leukoencephalopathy」之外的另一个 ATLAS——Anatomical Tracings of Lesions After Stroke,卒中后病灶解剖勾画数据集。三代版本构成一条清晰的扩容线:
| 版本 | 年份 | 规模 | 关键事件 |
|---|---|---|---|
| ATLAS v1.0 | 2018 | 304 例 | 首发于 NITRC INDI,确立「T1w + 专家病灶掩膜」的规格 |
| ATLAS v2.0 | 2022 | 655 train/val + 300 隐藏测试 | 微基线重标注、跨版本质控;与 ISLES 2022 同期并行(rid 489 详述) |
| ATLAS v3.0 | 2026 | 1,453 公开 + 362 隐藏 = 1,815 | 借 ISLES 2026 发布:SOOP 169 并入、新增多中心 329、旧验证掩码公开 |
三个对使用者的实际影响:
- 横向可扩容:v2.0 用户迁移到 v3.0 后,样本量近乎翻倍(955 → 1,453 公开),且拿到历来缺位的验证掩码,交叉验证设计不再需要「蹭」测试集。
- 纵向可衔接:在 v2.0 上发表的模型可直接在 v3.0 的 955 例结转子集上做同数据对照,剩余 498 例公开例作纯增量。
- 隐藏层仍存在:362 例 Generalizability Set 使 v3.0 延续「公开 + 隐藏」双层结构,任何论文若声称「在 ATLAS v3.0 全集上评测」而不说明 362 例的去向,都应引起警觉。
S3 分发路径 fcp-indi/data/Projects/INDI/ATLAS/R3.0 中的 R3.0 即 release 3.0;下载页同时列出 raw 与 preprocessed 两包体量(8.2 GB / 14.8 GB)。
§4 任务设计:规则、时间线与提交方式
4.1 任务一句话
给定原生空间剥颅骨 T1w MRI 与 JSON 元数据(DAYS_POST_STROKE / CHRONICITY / CENTER),输出逐体素二值梗死病灶分割掩膜;跨急性、亚急性、慢性三期,跨 60+ 中心(官方口径)。
4.2 时间线(2026 年)
| 日期 | 事件 |
|---|---|
| 04-24 | 训练数据 Batch 1 开放下载 |
| 06-12 | 训练数据 Batch 2 开放下载(完整 1,453 例就位) |
| 07-30 | 测试阶段提交开放(Docker 容器上线评测) |
| 08-19 23:59 CET | Docker 打包算法提交截止 |
| 08-30 | 算法描述表单提交截止 |
| 09-27 | SWITCH-MICCAI’26 现场公布正式榜单 |
两批发布(Batch 1/2)是下载节奏,不是 train/val 拆分——两者数字不同,混写是高频错误(坑 5)。
4.3 参赛与提交规则
- 实名门槛:Grand Challenge 平台实名账户参赛;
- 提交形态:算法打包为 Docker 容器推送平台,在线对隐藏集跑分;
- 排名口径:case-level 逐例计分(官方规则原文口径);GC 榜单界面默认显示 mean rank;
- MICCAI 榜单准入五条件:① 完成测试阶段提交;② 提交不少于 300 词的算法摘要;③ 提交 xlsx 结果表;④ 注册 SWITCH+ workshop;⑤ 参赛算法以 Apache 2.0 或同级许可开源。五条缺一即失去上正式榜单的资格。
4.4 与同场挑战的关系
SWITCH-MICCAI’26 是全天联合卫星会,三个挑战同场:ISLES 2026(本条目)、TopBrain2(rid 632)、TopAneu(rid 637)。三者任务不同(卒中梗死分割、脑肿瘤相关、动脉瘤相关),共享 workshop 场地、LNCS 出版通道与 MICCAI 2026 认可身份,检索时注意别把三者的数据规则互相串门(坑 8)。
4.5 Grand Challenge 评测流:容器如何变成名次
本届测试与排名依托 Grand Challenge(GC)平台的算法评测基础设施,流程可分解为六步:
- 实名注册:参赛者在 GC 平台以实名账户参赛(与库内 ISLES 2022/2024 同平台同机制);
- 容器打包:把「读入 T1w + JSON → 输出二值掩膜」的完整推理逻辑打包为 Docker 镜像——平台只认容器,不收散装脚本或权重文件;
- 推送评测:容器推送至平台后,由官方基础设施在隔离环境中对隐藏 Generalizability Set(362 例)执行推理;
- 在线计分:官方逐例计算 Dice 并按 case-level 口径计分(§5.1);
- 榜单展示:结果进入 GC 榜单页,默认展示口径为 mean rank(坑 4 的来源);
- 准入核验:MICCAI 正式榜单按五条件核验参赛者资格(§4.3),任一条件缺失则成绩不上正式榜。
这套机制对参赛者有三层实际含义。其一,推理环境即提交物:依赖库版本、预处理参数、后处理阈值全部封在容器里,赛后的可复现性由容器自身保证——这也是官方敢把开源(Apache 2.0 类)写成准入硬条件的技术底气。其二,没有本地测试集:362 例不可下载(Q20),任何对测试分布的猜测都无法本地验证,唯一合法的适应途径是让模型在公开 1,453 例上学得更稳,而非对平台行为做逆向工程。其三,评测即存档:容器评测记录天然构成参赛方法的完整档案,赛后 SWITCH+ LNCS 论文的实验陈述可与平台记录互证。
4.6 时间线与规则六问
问一:训练数据为什么分两批放?
04-24 放 Batch 1、06-12 放齐至 1,453 例。两批节奏给参赛者留出「先搭管线、后扩全量」的工程爬坡期;对数据侧,则对应 v3.0 组装与质控的收尾批次。注意批次只是发布节奏,与 train/validation(1,282/171)划分无关(坑 5)。
问二:为什么截止时间是 CET 时区?
Docker 提交截止为 08-19 23:59 CET(欧洲中部时间)。跨时区团队换算本地时间时注意夏令时口径,截止前留足容器构建与上传余量——容器推送失败重试的时间成本常被低估。
问三:07-30 前能碰隐藏集吗?
不能。测试提交 07-30 开放前,362 例隐藏集不开放任何形式的评测接触;此前所有性能证据只能来自公开训练池内部的交叉验证。
问四:08-19 与 08-30 两个截止日有什么区别?
08-19 截的是「物」——Docker 容器;08-30 截的是「文」——算法描述表单(含 ≥300 词摘要与 xlsx 结果表)。容器冻结后仍有一段窗口整理文档,但按 MICCAI 准入五条件,两者缺一都无缘正式榜单。
问五:09-27 之后赛事资产去哪?
榜单于 SWITCH-MICCAI’26 现场公布后,长期资产分三路沉淀:训练数据归 NITRC INDI 门户(以 ATLAS v3.0 名义持续分发);参赛方法归各队开源 repo(Apache 2.0 类许可为准入前提);论文归 Springer LNCS(SWITCH+ Workshop 论文集)。
问六:没赶上这届怎么办?
数据不关门:ATLAS v3.0 经 NITRC INDI 长期分发,与是否参赛解耦;基准可自建——公开池内部交叉验证(首批方法的 0.648 即 5 折口径)可与论文数字直接对标。下一届节奏按系列惯例为隔年(2028),触发维护点见附录 L。
§5 评估与基准
5.1 指标与排名:两套口径先分清
官方评估以 Dice 相似系数(DSC)为主指标,沿用 ISLES 系列一贯框架(分割重叠度对卒中病灶的适配性讨论见库内 rid 495)。需要警惕的是排名口径的双轨:
| 口径 | 出处 | 含义 | 使用场景 |
|---|---|---|---|
| case-level | 官方挑战赛规则 | 逐例比较各参赛方法与基准的胜负,按例计分 | 正式排名依据;对单例崩溃不敏感 |
| mean rank | Grand Challenge 榜单界面 | 各例排名取均值 | 平台默认展示;易被极端例拉动 |
两套口径不可直接换算:一个在 mean rank 上领先的方案可能在 case-level 落败(均匀的中等 vs 尖峰与崩塌并存),反之亦然。引用任何「第 X 名」之前先确认口径(坑 4)。
5.2 首个公开方法基准:MedNeXt-L + 3D CarveMix
首批见刊的方法论文来自 Teo & Punithakumar(arXiv:2608.23882,SWITCH+ Workshop 录用,Springer LNCS),在完整训练集上报告:
| 配置 | 5 折交叉验证平均 Dice |
|---|---|
| MedNeXt-L(kernel size 5),无 CarveMix | 0.630 |
| MedNeXt-L(k=5)+ 3D CarveMix 数据增强 | 0.648 |
三点解读:
- CarveMix 的贡献约 +0.018。CarveMix 是病灶级混合增强:把一例的病灶区域按标注边界「切下、形变、移植」到另一例,相当于对稀缺的病灶形态做组合爆炸。对二值病灶分割,这是比通用几何/灰度增强更对症的增强族。
- 病程期分层差异显著。慢性期(组织软化、病灶边界清晰)平台期 Dice 约 0.66;急性期(起病 7 天内,T1w 对比度弱)为全场最难段。单模态 T1w 的物理限制在这里直接兑现。
- 多中心口径。该论文训练子集覆盖 55 个中心(与官方「60+ 中心」的宣传口径差异见坑 3)。0.648 是跨中心、原生空间、单模态条件下的数字,不能与历届配准空间多模态的成绩直接对比。
5.3 性能天花板的结构性解释
0.648 这个数字乍看不高,但把它放进三个约束里看就合理了:
- 模态约束:T1w 对急性期细胞毒性水肿不敏感——这不是方法问题,是物理问题。同批影像若换成 DWI/FLAIR,性能预期显著抬升(历届多模态数据集的结论)。
- 空间约束:原生空间意味着模型同时承担「找病灶」与「适应空间变异」两件事,而配准空间版本把后者外包给了预处理。
- 评测约束:隐藏泛化测试集专挑分布外样本,公开集交叉验证的高分未必能平移到榜上——这是 362 例隐藏集存在的全部意义。
5.4 读基准的三条守则
- 只认在线评测的成绩:公开集上的自评 Dice 与隐藏集榜单成绩之间隔着分布差,两套数字必须分开引用。
- 别跨届横比:ISLES 2022(CTA 灌注多模态)、2024(多模态配准空间)、2026(T1w 单模态原生空间)任务难度不在同一标尺上。
- 追踪 case-level 与 mean rank 的分歧案例:两口径分歧大的参赛方案往往在「阴性例误报」或「急性期崩溃」上有结构性弱点,是方法学研究的富矿。
§6 获取与许可:两扇门与一处空白
6.1 资产清单与获取路径
| 资产 | 获取路径 | 门槛 |
|---|---|---|
| 训练数据(ATLAS v3.0,1,453 例公开) | NITRC INDI 门户 fcon_1000.projects.nitrc.org/indi/retro/atlas_download.html;S3 路径 fcp-indi/data/Projects/INDI/ATLAS/R3.0 | aes-256-cbc 加密 tar 包;解包密码经 Google Form 逐人发放(人工步骤) |
| 隐藏泛化测试(362 例) | 无下载;Grand Challenge 平台 Docker 容器在线评测 | 需平台实名账户与容器打包 |
| 参赛/榜单 | isles-26.grand-challenge.org | 实名账户 + 五条件(见 §4.3) |
| 论文与摘要 | Zenodo DOI 10.5281/zenodo.19886303;arXiv:2608.23882 | 公开直链 |
6.2 数据获取实操五步
- 在 NITRC 注册账户并访问 INDI 门户的 ATLAS 下载页;
- 选择 raw(8.2 GB)或 preprocessed(14.8 GB)包;
- 填写 Google Form(用途申报),等待逐人发放的解包密码——这一步含人工审批,不是即时的;
- 下载加密 tar 包,以收到的密码执行 aes-256-cbc 解密;
- 解包后核对 train/validation 拆分与 JSON 元数据完整性(掩膜为空的例是合法样本,勿当损坏文件剔除)。
6.3 许可条款现状
- 训练数据本体(ATLAS v3.0):正式许可条款未在官方渠道明示——NITRC 项目页面平台侧暂不可访问期间无法核对,Zenodo 挑战摘要亦未载明。前作 ATLAS v2.0 为 CC BY-NC-SA 4.0,可作为谱系旁证,但不得直接外推到 v3.0(坑 6)。
- 参赛算法:MICCAI 榜单准入硬性要求 Apache 2.0 或同级许可开源——意味着正式榜单上的每个方法理论上都可复现。
- 作品发表:SWITCH+ Workshop 论文经 Springer LNCS 出版,版权按 LNCS 惯例。
6.4 AI-Ready 评估要点
- 机读性:NIfTI + JSON 侧信息 + 全例掩膜,机器可读性优秀;
- 文档完备性:官方页 + Zenodo 摘要 + 方法论文三层文档,字段定义(DAYS_POST_STROKE 等)自解释;
- 可获取性扣分项:密码人工发放(非 API 化)、隐藏测试不可下载、license 条款未明示——三点在 DAIMS 评分(附录 B)中如实扣减;
- 防泄漏设计加分项:隐藏测试集 + Docker 在线评测是同规模数据集中少见的规范配置。
§7 生态与影响
7.1 ISLES 系列七届全景
| 届次 | 年份 | 数据特征 | 规模 | 库内锚点 |
|---|---|---|---|---|
| ISLES 2015 | 2015 | MR 多模态(配准空间) | 两子任务 64 + 50 例 | rid 495 |
| ISLES 2016 | 2016 | 同上体系 | 54 例 | rid 495 |
| ISLES 2017 | 2017 | 同上体系 | 75 例 | rid 495 |
| ISLES 2018 | 2018 | 同上体系 | 103 例 | rid 495 |
| ISLES 2022 | 2022 | CTA 灌注多模态 | 400 例 | rid 495 |
| ISLES 2024 | 2024 | 多模态配准空间 | 245 例 | rid 495 |
| ISLES 2026 | 2026 | T1w 单模态原生空间(ATLAS v3.0) | 1,453 公开 + 362 隐藏 | 本条目 |
七届演进的一条主线是「从赛到库」:2015-2018 届的赛后数据归于沉寂,2022 届起数据集本身成为遗产(ISLES’22 数据 6,000+ 下载),2026 届干脆把整个 ATLAS v3.0 作为赛事本体——赛事即发布仪式。
7.2 两条社区线的合流
卒中影像社区近十年并行着两条数据线:ISLES 挑战赛线(多模态、数百例、赛事驱动)与 ATLAS 静态库线(T1w、近千例、社区基础设施)。ISLES 2026 把两者合并:ATLAS v3.0 借挑战赛获得官方基准与隐藏测试集,ISLES 系列借 ATLAS 获得十倍于往届的训练规模。对使用者的含义:从此引用卒中 T1w 分割基准,一个条目(本条目)即可同时回答「数据在哪」与「基准多少」。
7.3 组织者网络
挑战赛摘要(Zenodo DOI 10.5281/zenodo.19886303)署名 13 位组织者,公开可锚定的包括:Jesus de la Rosa(ISLES 系列核心组织者)、David Menze、Oskar Deseoe、Benjamin Wiestler、Jan Kirschke、Bilal Yalcin、Mario Cabezas、Christopher Rorden(SOOP 数据团队,南卡罗来纳大学)、Michal Khan 等;官方页与公开渠道另见 Su Ruisheng(ATLAS v2.0 数据管线相关)、Schmitzer Lena、Wiest Roland 等名字与本届关联。逐人机构对应未完整锚定,不作臆测(坑 7)。团队构成呈现明显的跨机构协作特征:数据端(ATLAS/SOOP 谱系)、平台端(Grand Challenge)、赛事端(MICCAI/SWITCH+)各有所属。
7.4 SWITCH-MICCAI’26 卫星会矩阵
| 挑战 | 任务 | 库内条目 |
|---|---|---|
| ISLES 2026 | 卒中梗死分割(T1w 原生空间) | 本条目 |
| TopBrain2 | 脑部相关分割挑战 | rid 632 |
| TopAneu | 动脉瘤相关挑战 | rid 637 |
三者共享全天卫星会日程、LNCS 出版通道与 MICCAI 2026 认可身份;数据规则互不通用(坑 8)。
7.5 下游影响轨迹
- 数据存量:ISLES’22 与 ATLAS 各自累积 6,000+ 下载(库内 rid 495/489 记录),两者合并后 v3.0 的分发预期进一步集中到 NITRC INDI 单一门户;
- 方法存量:DeepISLES(ISLES 2022 获奖方案的集成研究,rid 495)确立的「多方案集成优于单方案」经验,在单模态场景是否依旧成立是 2026 届留下的开放问题;
- 首个方法:Teo & Punithakumar 的 MedNeXt-L + CarveMix 组合(0.648)已给出可复现起点(Apache 2.0 类开源为榜单准入条件,代码可得性有制度保障);
- 正式榜单:2026-09-27 已于 SWITCH-MICCAI’26 现场公布;本条目成稿时点未纳入逐名次数据(网络检索预算所限),榜单解读留给维护者按官方页更新。
7.6 方法集成遗产与本届的开放问题
ISLES 2022 的赛后研究 DeepISLES(库内 rid 495)给出过一个重要经验:把多个参赛方法集成,性能优于任何单一参赛方案——「群体智慧」在多模态灌注数据上成立。本届把这道题重新出了:
- 开放问题一:在 T1w 单模态、信息量受物理约束的场景,集成还能榨出多少增益?当单方法瓶颈来自「模态看不见病灶」(急性期)而非「方法各有所长」时,集成的边际收益预期收窄——这是 2026 届留给赛后研究的第一个检验点。
- 开放问题二:元数据注入策略会不会成为集成的新维度?DeepISLES 式集成当年集成的是「不同网络结构」;本届若按「用 CENTER 域自适应」与「不用 CENTER」两类策略集成,等价于在方法层面隐式建模中心异质性——官方把元数据写进输入规范客观上为这类研究递了梯子。
- 开放问题三:case-level 排名会不会改变方法设计取向?逐例计分奖励「没有明显短板」的稳定方案,惩罚「平均分高但个别例崩溃」的激进方案——正式榜单若出现两口径大分化的参赛者(§5.1),将为「稳定性优先设计」提供实证案例。
7.7 数据谱系用户的迁移指南小结
三类既有用户各自的迁移要点(细节表见附录 E):
ATLAS v1.0 用户(n=304 时代):直接跳到 v3.0,样本量翻近五倍;注意 v1.0→v2.0 有过微基线重标注与质控迭代,逐例 ID 对齐后再混用标注,勿默认「同一例两版掩膜相同」。
ATLAS v2.0 用户(rid 489):955 例全部结转,无数据损失;新增红利按序兑现——先是公开池扩容(+498 例),后是验证掩码首次释放(171 例 validation)。在 v2.0 上发表的模型可用 v3.0 的结转子集做同数据对照、用新增 498 例做纯增量评估,实验设计两步走。
ISLES 2022/2024 参赛者(rid 495):模态管线不能复用(CTP/多模态 → T1w 单模态,坑 1),空间假设不能复用(配准 → 原生,坑 2),但平台机制可复用(同 GC 实名 + Docker 评测流,§4.5)。历届积累的「跨中心稳健性」工程经验(如实例归一化、中心混淆防御)是本届语境下最有迁移价值的资产。
§8 方法学启示:四条可迁移的经验
8.1 单模态原生空间是刻意调高的难度
历届 ISLES 用多模态与配准空间不断抬高分母上的便利,2026 届反向操作:只给 T1w、只留原生空间。这等于把「预处理红利」全部没收,强迫方法直面临床存量的真实形态。迁移结论:当你的部署环境只有单序列且无法配准时,ISLES 2026 的榜单与公开基线比任何多模态成绩单都更接近你的真实上限。
8.2 元数据利用是被低估的得分点
DAYS_POST_STROKE / CHRONICITY / CENTER 三个字段被官方明文放进输入规范,这在本系列历史上是第一次。它把「是否以及如何使用先验」从工程习惯升级为公开考题:病程期先验决定你对「看不见的病灶」的怀疑阈值,中心先验则可能把模型带偏成「认中心不认病灶」。迁移结论:凡带结构化侧信息(起病时间、采集机构)的医学分割任务,侧信息的注入方式(条件化、域自适应、还是干脆不用)应作为独立消融维度。
8.3 「赛库合流」是可复制的数据集发布模式
ATLAS v3.0 不另开发布会,直接以挑战赛为发布仪式:赛事提供基准、隐藏测试与关注度,数据集提供规模与长期分发。前作证明赛事遗产会衰减(2015-2018 届数据归于沉寂),而静态库缺官方基准(ATLAS v2.0 长期只有跨版本对比)。迁移结论:中等规模社区数据集发布时,「挑战赛 + 成熟数据库本体」的合并形态在影响力与维护成本上优于两者单独运作。
8.4 隐藏测试集 + Docker 在线评测是防泄漏工程范式
362 例 Generalizability Set 只进不出,提交必须走 Grand Challenge 容器。这套机制把「榜单可信度」从自律问题变成基础设施问题,同时以 case-level 计分抑制平均分掩盖的单例崩溃。迁移结论:任何需要可信排行榜的数据集,容器化在线评测加分层排名口径是当前最完整的开源方案(Grand Challenge 平台可复用)。
§9 与库内条目的关系
9.1 家族图谱
卒中影像数据族谱(库内视角)
├── isles (rid 495):ISLES 系列 2015-2024 六届总览
│ └── isles-2026 (本条目):第 7 届,赛库合流分叉点
├── atlas-v2 (rid 489):ATLAS v2.0
│ └── ATLAS v3.0 = isles-2026 训练本体(955 例结转自 v2.0)
├── topbrain2026 (rid 632):SWITCH-MICCAI'26 同场挑战
├── topaneu2026 (rid 637):SWITCH-MICCAI'26 同场挑战
└── wmh-challenge (rid 501):脑白质高信号分割(T1w/FLAIR 脑病变谱系,弱关联)
9.2 互链强度与 relatedLink
frontmatter relatedLink 已收录四条强互链(isles/495、atlas-v2/489、topbrain2026/632、topaneu2026/637);wmh-challenge(501)作为 T1w/FLAIR 脑病变分割谱系的弱关联以正文互链呈现,不占 relatedLink 名额。本条目标签(医学影像/MRI/医学图像分割/脑影像/挑战赛数据集/评测基准)与上述条目均有交集,互链算法可正常计算相关度。
9.3 检索路径建议
- 从 isles (495) 进来的读者:495 讲「七届中的前六届 + 系列方法论」,本条目讲第 7 届的赛制细节与 ATLAS v3.0 数据本体——查历届成绩去 495,查本届数据获取与本版基准留在此条。
- 从 atlas-v2 (489) 进来的读者:489 的「隐藏测试 300 例」身份已终结——那些例在 v3.0 中公开并带掩码;迁移到 v3.0 时样本量翻倍的账见本条 §3。
- 从 topbrain2026/topaneu2026 (632/637) 进来的读者:三个挑战共享 workshop 不共享数据规则,请勿把本条的时间线与数据口径搬用过去(坑 8)。
9.4 若你是库内读者:三条最短路径
- 要数据:§6.2 五步获取流程 + relatedLink 中 atlas-v2 条目(了解 v2.0→v3.0 迁移账);
- 要复现基线:§5.2 的 MedNeXt-L + CarveMix 配置表 + MICCAI 榜单准入的开源强制条款(Apache 2.0);
- 要做综述/调研:§7.1 七届全景表 + rid 495 的系列脉络,两条合读即可覆盖 2015-2026 全跨度。
§10 避坑清单:八个已踩过或极易踩的坑
坑 1:把 ISLES 2026 当多模态任务
ISLES 2022(CTA 灌注)与 2024(多模态)的惯性让人默认 ISLES 都是多模态。2026 届只有 T1w 单模态——把往届的模态管线(CTP 配准、多序列拼接)照搬过来第一步就会失败。
坑 2:配准空间惯性
ISLES 2024 输出在配准空间,2026 届强制原生空间。评 ISLES 2024 成绩时可以「反配准回去再算 Dice」,2026 届没有这层缓冲——预处理策略里任何隐含的配准假设都要显式移除。
坑 3:双口径数字混用
四处并存的双口径:①规模「约 2,000 例」(官方宣传)vs 1,815 例(1453+362 实证);②中心数「60+」(官方)vs 55(方法论文训练子集口径);③发布批次 Batch 1/2 vs 训练划分 train 1,282/val 171;④「1,453 例」是公开训练集规模,不是数据集总规模(还有 362 隐藏)。引用任何数字先报口径。
坑 4:排名口径混用
官方规则 case-level 逐例计分,GC 榜单界面默认 mean rank。同一参赛者两口径名次可以差好几位。转述「第 X 名」必须注明口径,否则综述里会制造出两个「冠军」。
坑 5:发布批次当成数据划分
Batch 1(04-24)/ Batch 2(06-12)是官方两次放数据的节奏,与 train/validation(1,282/171)的划分无关。按「Batch 1 当训练、Batch 2 当验证」搭建的实验是错的。
坑 6:license 外推
ATLAS v2.0 是 CC BY-NC-SA 4.0,但 v3.0 的正式条款官方渠道未明示(NITRC 项目页平台侧暂不可访问、Zenodo 摘要未载明)。把「v2.0 是 CC BY-NC-SA 所以 v3.0 也是」写进论文或产品合规文档是本条目明确标注为不成立的外推。实际使用前以 NITRC 门户与下载页当时条款为准。
坑 7:组织者机构臆测
13 位组织者的逐人机构对应未在公开渠道完整锚定。同名混淆风险真实存在(如 Menze、Rorden 等高产作者跨团队出现),行文时只能写「公开可锚定的关联」,不可给未证实的人名配机构头衔。
坑 8:SWITCH 三挑战规则串门
SWITCH-MICCAI’26 全天卫星会下 ISLES 2026、TopBrain2(rid 632)、TopAneu(rid 637)同场但互不相干:数据、规则、时间线各自独立。把某一家的提交截止时间或数据规模套到另一家是检索污染的经典来源。
§11 总结
11.1 三句话总结
- ISLES 2026 是第 7 届 ISLES 挑战赛,把整个 ATLAS v3.0(1,453 例公开 T1w + 362 例隐藏泛化测试)作为赛事本体,完成卒中影像社区「赛」与「库」两条线的合流。
- 任务被刻意调难:原生空间、T1w 单模态、多病程期,首个公开基准(MedNeXt-L + CarveMix)5 折 Dice 0.648,慢性期约 0.66、急性期最难。
- 获取合规但非一键:NITRC INDI 登记 + Google Form 逐人密码;license 条款官方未明示是当前最大合规空白,引用时不得从 v2.0 外推。
11.2 适合谁
- 需要大规模跨中心 T1w 卒中分割数据训练域泛化/域自适应方法的团队;
- 计划参加 MICCAI 系挑战赛并需要可信榜单方法论的参赛者;
- 研究元数据利用(病程期/中心先验注入策略)与病灶级数据增强(CarveMix 族)的方法学者;
- 需要单模态真实形态(原生空间、无配准红利)做部署前评估的工程团队。
11.3 不适合谁
- 期望多模态(DWI/FLAIR/CTP)监督信号的研究——本条目数据只有 T1w;
- 需要逐例临床结局(mRS 等)标签的预后研究——本数据集不含结局变量;
- 要求一键 API 下载数据的自动化流水线——密码人工发放与许可空白构成流程性障碍;
- 以急性期为主要研究对象的团队——T1w 对急性梗死对比度弱,0.648 的期段分解明确提示急性期是短板,请评估是否等待多模态数据源。
11.4 30 秒决策卡
| 你的需求 | 建议 |
|---|---|
| 跨中心 T1w 分割训练池 | 用,v3.0 是当前最大公开选择 |
| 复现参赛基线 | 用,Apache 2.0 类开源有制度保障,起点 0.648 |
| 多模态研究 | 不用本条目数据;参照 rid 495 的 2022/2024 届 |
| 急性期临床辅助诊断研究 | 谨慎:T1w 单模态上限明显,先读 §5.3 |
| 商业产品合规评估 | 先解决 license 未明示问题(坑 6),勿凭 v2.0 外推 |
| 榜单方法论研究 | 用:case-level vs mean rank 双口径、隐藏集设计都是好素材 |
11.5 常见误用与纠正
| 误用 | 后果 | 纠正 |
|---|---|---|
| 把「约 2,000 例」写进论文数据节 | 与实证 1,815 冲突,审稿风险 | 写 1,815(1,453 公开 + 362 隐藏)或双口径并注(坑 3) |
| 按 Batch 1/2 切分实验 | 划分口径错,结果不可比 | 只认官方 train 1,282 / val 171(坑 5) |
| 剔除掩膜为空的「空标注」 | 训练分布偏移,假阳性上升 | 阴性例是合法样本,保留并单独报告(Q15) |
| 引用 ATLAS v3.0 时默认 CC BY-NC-SA | 合规误判(v2.0 条款外推) | v3.0 条款官方未明示,获取时以门户当时条款为准(坑 6) |
| 跨届直比 Dice 数字 | 任务难度不同,结论失真 | 声明模态/空间口径差异(§5.4、附录 H) |
11.6 条目定位声明
本条目在库内知识网络中的边界,三条分工声明:
- 与 isles(rid 495):495 承担系列史(2015-2024 六届的赛制、数据、成绩与方法论),本条目承担第 7 届(2026)的完整叙事与 ATLAS v3.0 数据本体。两者是「系列总览 + 当届专条」关系,非替代关系——检索历届成绩去 495,检索本届数据获取、赛制细节与本版基准留在本条。
- 与 atlas-v2(rid 489):489 承担 ATLAS v2.0 的完整档案(655+300 构成、微基线质控、CC BY-NC-SA 4.0 条款),本条目承接 v3.0(1,453+362)。v2.0 的隐藏测试身份在本条目内正式终结(并入公开池)。
- 与 topbrain2026(rid 632)/ topaneu2026(rid 637):同属 SWITCH-MICCAI’26 全天卫星会的并列表亲,共享 workshop 与出版通道,数据与规则互不通用(坑 8)。
本条目的 category_tags 六标签(医学影像/MRI/医学图像分割/脑影像/挑战赛数据集/评测基准)与上述四条互链条目均有交集,互链算法可正常计算相关度;relatedLink 收录四条强互链纯 URL,wmh-challenge(501)为弱关联以正文互链呈现。
FAQ(高频问答 30 问)
A. 基础认知
Q1:ISLES 2026 是什么?
ISLES(Ischemic Stroke Lesion Segmentation)系列第 7 届挑战赛,MICCAI 2026 认可,挂靠 SWITCH+ Workshop(LNCS 出版),托管于 Grand Challenge 平台,任务为原生空间 T1w MRI 缺血性卒中病灶二值分割。
Q2:它和库内 isles 条目(rid 495)什么关系?
rid 495 覆盖 2015-2024 六届系列史与系列方法论;本条目是第 7 届的独立条目,两者互补,relatedLink 已互挂。
Q3:为什么 2024 之后隔了两年?
系列节奏为「隔年一届」(2018→2022→2024→2026),2026 届的差异化在于直接采用 ATLAS v3.0 作为训练本体。
Q4:ISLES 2026 与 ATLAS v3.0 是什么关系?
训练数据本体就是 ATLAS v3.0;挑战赛是 v3.0 的官方发布形式与基准评测活动。查 ATLAS v3.0 的读者也应使用本条目。
Q5:SOOP 是什么?
Stroke 项目的南卡罗来纳大学公开卒中队列(Christopher Rorden 团队维护),本届贡献 169 例并入训练池。
Q6:赛事还办吗?榜单出来了吗?
Docker 提交 2026-08-19 截止,正式榜单已于 2026-09-27 在 SWITCH-MICCAI’26 现场公布;数据在赛后经 NITRC INDI 门户长期分发。
B. 数据与获取
Q7:训练集有多少例?
公开 1,453 例(train 1,282 + validation 171),另有隐藏泛化测试 362 例,合计 1,815 例。官方宣传口径「约 2,000 例」——引用时注意口径(坑 3)。
Q8:1,453 例内部怎么构成?
ATLAS v2.0 结转 955 + SOOP 169 + 全新多中心 329。
Q9:多少个中心?
官方宣称 60+ 中心;首批方法论文的训练子集口径为 55 中心。差异可能来自子集范围,引用时注明口径。
Q10:数据什么格式?多大?
NIfTI(剥颅骨 T1w + 二值掩膜)+ JSON 元数据;aes-256-cbc 加密 tar 包,raw 8.2 GB、preprocessed 14.8 GB。
Q11:怎么下载?
NITRC INDI 门户(fcon_1000.projects.nitrc.org/indi/retro/atlas_download.html)→ Google Form 申报用途领密码 → 下载加密包 → aes-256-cbc 解密。S3 路径 fcp-indi/data/Projects/INDI/ATLAS/R3.0。
Q12:密码要等多久?
官方未承诺时限;流程含人工审批,规划实验时预留提前量,勿按即时下载设计排期。
Q13:ATLAS v3.0 的 license 是什么?
官方渠道未明示(NITRC 项目页平台侧暂不可访问、Zenodo 摘要未载明)——本条目最大遗留疑点。前作 v2.0 为 CC BY-NC-SA 4.0,不得外推(坑 6)。商用合规请以获取时门户条款为准。
Q14:v2.0 的隐藏测试 300 例去哪了?
并入 v3.0 公开池(955 = v2.0 全部 655 train/val + 300 test),旧验证集掩码亦随 v3.0 首次公开。
Q15:掩膜为空的例是坏数据吗?
不是。T1w 未见明确病灶的例是合法阴性样本,对约束假阳性有效,勿当损坏文件剔除。
C. 任务与评估
Q16:输入输出分别是什么?
输入:原生空间剥颅骨 T1w MRI + JSON(DAYS_POST_STROKE / CHRONICITY / CENTER);输出:逐体素二值梗死病灶掩膜。
Q17:元数据真的能喂给模型吗?
能,官方明文允许且这是本届的设计亮点——三个字段如何注入(条件化/域自适应/不用)本身就是方法消融点(§8.2)。
Q18:用什么指标?排名怎么算?
主指标 Dice。排名官方规则为 case-level 逐例计分,GC 榜单界面默认展示 mean rank——两口径不可互换(坑 4)。
Q19:急性期为什么最难?
起病 7 天内梗死组织在 T1w 上对比度弱,肉眼与模型都难分辨;首批方法论文的期段分解明确支持这一结论。
Q20:隐藏测试集为什么不给下载?
官方保留 362 例 Generalizability Set 只用于 Docker 在线评测,防公开集过拟合与测试分布泄漏;排名可信度是设计目标。
Q21:MICCAI 榜单准入要满足什么?
五条件:完成测试提交、≥300 词算法摘要、xlsx 结果表、workshop 注册、Apache 2.0 或同级开源。缺一即无缘正式榜单。
D. 基线与复现
Q22:有没有公开基线数字?
首批方法论文(arXiv:2608.23882):MedNeXt-L(k=5)+ 3D CarveMix,5 折平均 Dice 0.648(无 CarveMix 0.630);慢性期平台约 0.66。
Q23:CarveMix 是什么,为什么有效?
病灶级混合增强:按标注边界把病灶区域切下、形变、移植到另一例,对稀缺病灶形态做组合扩充;对二值病灶分割比对通用几何增强更对症。
Q24:MedNeXt 是什么?
面向医学分割的 ConvNeXt 风格 3D 网络(nnU-Net 生态近亲),kernel size 5 为其常用配置;参赛方案开源为榜单准入硬条件,正式榜单方法理论上均可复现。
Q25:0.648 高还是低?
在「T1w 单模态 + 原生空间 + 跨中心 + 含急性期」的四重约束下属合理区间;勿与历届多模态配准空间的分数横比(§5.4)。
Q26:正式榜单名次在哪查?
官方 GC 页与 SWITCH+ LNCS 论文集;本条目成稿时点未纳入逐名次数据(检索预算所限),维护者可按官方页更新。
E. 库内与生产
Q27:应该和哪些库内条目一起读?
强互链四条:isles(495,系列史)、atlas-v2(489,直系前作)、topbrain2026(632)、topaneu2026(637)(同场挑战);弱关联 wmh-challenge(501)。
Q28:从 atlas-v2 迁移到 v3.0 有什么注意点?
样本量 955 → 1,453 公开(近翻倍)+ 新获验证掩码;v2.0 隐藏测试身份终结;跨版本影像存在微调(见 rid 489 的版本迭代记录),混用两版掩膜前先对齐版本。
Q29:本条目的 data_tags 为什么这样标?
「人工标注」(专家手工掩膜)、「影像数据」(T1w MRI)、「原始数据」(原生空间未配准)三标签覆盖 AI-Ready 核心维度;patient_tags 标「成人」。
Q30:发现条目数字与官方页不一致怎么办?
先查 §10 坑 3 的双口径清单——四处「官方 vs 实证」差异均已存照;若为清单外的新差异,属维护触发点,请按条目尾注的维护通道反馈。
事实清单(硬事实 30 条)
| # | 事实 | 来源 |
|---|---|---|
| 1 | ISLES 2026 为系列第 7 届(2015/2016/2017/2018/2022/2024/2026) | 官方 GC 页 + rid 495 |
| 2 | 挑战赛托管 Grand Challenge 平台(isles-26.grand-challenge.org) | 官方页 |
| 3 | 挂靠 MICCAI 2026 SWITCH+ Workshop,LNCS 出版 | Zenodo 摘要 + arXiv 论文 |
| 4 | 与 TopBrain2(rid 632)、TopAneu(rid 637)同属全天联合卫星会 | 官方页 |
| 5 | 任务:原生空间 T1w MRI 多期梗死二值分割 | 官方页 |
| 6 | 输入含 JSON 元数据:DAYS_POST_STROKE / CHRONICITY / CENTER | 官方页 |
| 7 | 元数据被官方明文允许作为模型输入 | 官方页 |
| 8 | 训练数据本体为 ATLAS v3.0 | Zenodo 摘要 |
| 9 | 公开训练集 1,453 例 = 955 结转 + 169 SOOP + 329 新增 | Zenodo 摘要 |
| 10 | 官方拆分 train 1,282 + validation 171 | 官方页 |
| 11 | validation 掩膜(含 v2.0 时代验证掩码)首次释放 | 官方页 |
| 12 | 隐藏 Generalizability Set 362 例,仅 Docker 在线评测 | 官方页 |
| 13 | 公开 + 隐藏合计 1,815 例;官方宣传口径约 2,000 例 | 官方页(双口径) |
| 14 | 官方宣称 60+ 中心;方法论文训练子集口径 55 中心 | 官方页 vs arXiv:2608.23882 |
| 15 | 影像为原生空间、剥颅骨 T1w 单模态 | 官方页 |
| 16 | 掩膜为专家手工二值标注,全例覆盖含阴性例 | 官方页 + Zenodo 摘要 |
| 17 | 分发包 raw 8.2 GB / preprocessed 14.8 GB | NITRC INDI 下载页 |
| 18 | 加密方式 aes-256-cbc,密码经 Google Form 逐人发放 | NITRC INDI 下载页 |
| 19 | S3 分发路径 fcp-indi/data/Projects/INDI/ATLAS/R3.0 | NITRC INDI 下载页 |
| 20 | 时间线:Batch 1 于 04-24、Batch 2 于 06-12 开放 | 官方页 |
| 21 | 提交 07-30 开放;Docker 截止 08-19 23:59 CET;表单截止 08-30 | 官方页 |
| 22 | 正式榜单 2026-09-27 于 SWITCH-MICCAI’26 现场公布 | 官方页 |
| 23 | 排名官方规则 case-level;GC 榜单默认 mean rank | 官方规则 vs GC 界面 |
| 24 | MICCAI 榜单准入五条件(提交/摘要/xlsx/注册/开源) | 官方页 |
| 25 | 参赛算法开源要求 Apache 2.0 或同级 | 官方页 |
| 26 | 首批方法:MedNeXt-L(k=5)+ 3D CarveMix,5 折 Dice 0.648 vs 0.630 | arXiv:2608.23882 |
| 27 | 慢性期平台期 Dice 约 0.66;急性期(≤7 天)最难 | arXiv:2608.23882 |
| 28 | ATLAS 版本链:v1.0(2018,n=304)→ v2.0(2022,655+300)→ v3.0(1,453+362) | rid 489 + 本届官方页 |
| 29 | 挑战赛摘要 13 位作者,DOI 10.5281/zenodo.19886303(v2,2026-04-29 发布) | Zenodo |
| 30 | ATLAS v2.0 license 为 CC BY-NC-SA 4.0(旁证);v3.0 条款未明示 | rid 489 + 官方渠道核查 |
事实清单补充:流程与生态硬事实(31-45)
主表(1-30)覆盖数据与赛事核心事实,本补充表收录流程、平台与生态类次级硬事实:
| # | 事实 | 来源 |
|---|---|---|
| 31 | 参赛需 Grand Challenge 平台实名账户 | 官方页 |
| 32 | 测试提交唯一形态为 Docker 容器在线评测,不收散装脚本 | 官方页 + 平台机制 |
| 33 | 隐藏 362 例无任何下载通道,仅隔离环境推理 | 官方页(设计如此) |
| 34 | GC 榜单页为系列通用基础设施(ISLES 2022/2024 同平台) | rid 495 |
| 35 | 两批发布节奏为 04-24 与 06-12,间隔约七周 | 官方页 |
| 36 | Docker 截止到表单截止之间留有约 11 天文档窗口(08-19 → 08-30) | 官方页推算 |
| 37 | 提交开放(07-30)到 Docker 截止(08-19)为 20 天评测窗口 | 官方页推算 |
| 38 | 榜单公布(09-27)后训练数据以 ATLAS v3.0 名义长期分发 | 官方页 + NITRC INDI |
| 39 | ISLES’22 数据下载 6,000+ 次(系列遗产参照) | rid 495 |
| 40 | ATLAS v2.0 下载数同为 6,000+ 量级 | rid 489 |
| 41 | 13 位组织者署名于 Zenodo 挑战赛摘要(v2) | Zenodo DOI 10.5281/zenodo.19886303 |
| 42 | Christopher Rorden 以 SOOP 数据方身份参与(南卡罗来纳大学) | Zenodo 摘要 + SOOP 公开信息 |
| 43 | SWITCH+ Workshop 论文集为 Springer LNCS 系列 | arXiv:2608.23882 录用信息 |
| 44 | 首批方法论文录用 SWITCH+,即 LNCS 出版通道的直接证据 | arXiv:2608.23882 |
| 45 | 官方明确禁止性条款未见公开细目;准入门槛以五条件为公开全集 | 官方页(不臆测未公开规则) |
术语表(28 条)
- ISLES:Ischemic Stroke Lesion Segmentation,缺血性卒中病灶分割挑战赛系列,2015 年创办,MICCAI 认可,2026 年为第 7 届。
- ATLAS:Anatomical Tracings of Lesions After Stroke,卒中后病灶解剖勾画数据集,NITRC INDI 托管,v1.0(2018)→ v2.0(2022)→ v3.0(2026)三代。
- SOOP:南卡罗来纳大学(Christopher Rorden 团队)公开卒中队列数据集,本届向 ATLAS v3.0 贡献 169 例。
- T1w:T1 加权磁共振序列,脑组织结构对比的标准序列;对急性期梗死对比度弱是其物理局限。
- 原生空间(native space):影像按采集时的原始坐标存储,不做模板配准;保留真实解剖变异,也把空间适应负担交给模型。
- 剥颅骨(skull-stripped):官方预处理基线,去除颅骨与头皮等非脑组织。
- NIfTI:神经影像数据的标准文件格式(.nii/.nii.gz),本数据集影像与掩膜的载体。
- 二值掩膜:逐体素 0/1 标注(梗死病灶/背景),本数据集的监督信号形态。
- DSC / Dice:Dice 相似系数,分割预测与标注的重叠度量,本届官方主指标。
- case-level 排名:官方排名口径,逐例比较参赛方法与基准的胜负并按例计分。
- mean rank:Grand Challenge 榜单界面默认口径,各例排名取均值;与 case-level 不可互换。
- Grand Challenge(GC):荷兰 DIAG 团队运营的医学挑战赛平台,提供实名账户、容器评测与榜单。
- Docker 容器:本届唯一测试提交形态——算法打包为容器推送平台,在线对隐藏集跑分。
- Generalizability Set:本届 362 例隐藏泛化测试集,不公开下载,专测分布外泛化。
- DAYS_POST_STROKE:JSON 元数据字段,卒中起病至影像采集的天数,病程期最强先验。
- CHRONICITY:JSON 元数据字段,病程分期(急性/亚急性/慢性)。
- CENTER:JSON 元数据字段,采集中心标识,域自适应素材与「认中心」风险并存。
- 急性期:约起病 7 天内,T1w 对比度最弱、全场最难分割的期段。
- 亚急性期:起病 7 天至数周,病灶对比逐步显现。
- 慢性期:数周以后,病灶边界清晰、软化灶形成,平台期 Dice 约 0.66。
- CarveMix:病灶级混合数据增强——按标注边界切下病灶、形变后移植到其他例,对病灶形态做组合扩充。
- MedNeXt:ConvNeXt 风格 3D 医学分割网络(nnU-Net 生态近亲),本届首批基线采用其 Large 配置(kernel size 5)。
- 5 折交叉验证:训练集分五份轮流做验证,报告均值;0.648/0.630 均为此口径。
- aes-256-cbc:数据分发包的对称加密方式,解包密码经 Google Form 逐人发放。
- NITRC / INDI:神经影像研究资源平台及其数据计划(fcon_1000 项目群),ATLAS 谱系的长期托管方。
- S3 路径:云端分发目录约定,本届数据位于 fcp-indi/data/Projects/INDI/ATLAS/R3.0。
- MICCAI:医学图像计算与计算机辅助介入领域旗舰会议,SWITCH+ 卫星会与 LNCS 出版通道的挂靠主体。
- 域泛化(domain generalization):模型对未见中心/协议/分布的适应能力,本届隐藏测试集的核心考察维度。
附录
附录 A:条目信息速查卡
| 字段 | 值 |
|---|---|
| 条目 slug | isles-2026 |
| 官方名称 | ISLES 2026(Ischemic Stroke Lesion Segmentation Challenge 2026) |
| 系列届次 | 第 7 届(2015-2024 六届见库内 rid 495) |
| 赛事归属 | MICCAI 2026 SWITCH+ Workshop(Springer LNCS) |
| 平台 | Grand Challenge:isles-26.grand-challenge.org |
| 数据本体 | ATLAS v3.0(NITRC INDI,S3:fcp-indi/data/Projects/INDI/ATLAS/R3.0) |
| 公开规模 | 1,453 例(train 1,282 + val 171;955+169+329) |
| 隐藏规模 | 362 例(Generalizability Set) |
| 模态 | T1w 单模态、原生空间、剥颅骨 |
| 标注 | 专家手工二值梗死掩膜(全例覆盖,含阴性例) |
| 元数据 | DAYS_POST_STROKE / CHRONICITY / CENTER(官方允许作模型输入) |
| 主指标 | Dice;排名 case-level(官方规则)vs mean rank(GC 界面) |
| 首个基准 | MedNeXt-L(k=5)+ 3D CarveMix:5 折 Dice 0.648(对照 0.630) |
| 获取 | NITRC INDI 门户 + Google Form 密码;raw 8.2 GB / preproc 14.8 GB |
| License | v3.0 未明示(遗留疑点);v2.0 旁证 CC BY-NC-SA 4.0;参赛算法 Apache 2.0 类 |
| 库内互链 | isles(495)、atlas-v2(489)、topbrain2026(632)、topaneu2026(637);弱链 wmh-challenge(501) |
| 成稿日期 | 2026-10-09(代理 agent-c-isles2026) |
附录 B:DAIMS 评估全表
DAIMS(Data Availability, Interoperability, Machine-readability, Sustainability——数据可得性、互操作、机读、可持续)逐维评分,供库内归一化对比:
| 维度 | 评分(满分 5) | 依据 |
|---|---|---|
| D1 公开可得性 | 4 | 1,453 例公开下载;扣 1 分:密码人工发放(Google Form 审批),非一键直链 |
| D2 隐藏资产透明度 | 3 | 362 例隐藏集规则公开(数量/用途明确),但样本本身不可下载复检 |
| I1 格式互操作 | 5 | NIfTI + JSON,神经影像社区通用栈,无私有格式 |
| I2 模态/元数据完整性 | 5 | 影像 + 掩膜 + 三字段元数据逐例齐备,字段自解释 |
| M1 机读标注 | 5 | 掩膜为标准 NIfTI 体素标注,可直接进训练管线 |
| M2 文档机读性 | 4 | 官方页 + Zenodo 摘要 + 论文三层文档;扣 1 分:完整数据字典未以单一机读文件提供 |
| S1 持久托管 | 4 | NITRC INDI 为长周期学术托管;S3 路径稳定;扣 1 分:单门户依赖 |
| S2 版本治理 | 5 | v1.0→v2.0→v3.0 版本链清晰,变更(结转/掩码释放)可追溯 |
| S3 许可明确性 | 2 | v3.0 正式条款官方未明示——本表最大扣分项 |
| S4 社区生态 | 5 | 系列七届 + 6,000+ 下载数据谱系 + LNCS 论文链 + 开源参赛强制 |
| 合计 | 42/50 | 特征结论:机读与生态满分级,可得性良好,许可明确性为唯一结构性短板 |
附录 C:数据获取决策树
你的身份是什么?
├── 只想用训练数据做研究
│ ├── 有 NITRC 账户?──否→ 注册(免费)
│ │ └─是→ 访问 INDI 门户 ATLAS 下载页
│ ├── 填 Google Form(用途申报)→ 等密码(人工审批,预留提前量)
│ ├── 选包:raw 8.2 GB(自己做预处理)/ preprocessed 14.8 GB(官方口径)
│ ├── 下载 aes-256-cbc 加密 tar → 用密码解密
│ └── 校验:train 1,282 / val 171 / JSON 三字段 / 阴性例保留
├── 想上 MICCAI 正式榜单
│ ├── GC 实名账户 → 读 §4.3 五条件
│ ├── 算法打包 Docker → 推送在线评测(07-30 开放,08-19 截止)
│ └── 摘要 ≥300 词 + xlsx 表 + workshop 注册 + Apache 2.0 开源
├── 只想引用数字
│ ├── 规模:写 1,815(1453+362)或注明「官方宣传约 2,000」
│ ├── 中心:写「官方 60+;方法论文子集口径 55」
│ └── 基线:0.648(MedNeXt-L + CarveMix,5 折 Dice)
└── 商业合规评估
└── 停:v3.0 license 未明示(坑 6),先取官方书面条款再决策
附录 D:双口径登记表
| # | 口径 A(官方宣传/界面) | 口径 B(规则/实证) | 处置建议 |
|---|---|---|---|
| 1 | 约 2,000 例 | 1,453 公开 + 362 隐藏 = 1,815 | 引用实证数,或写「约 2,000(实证 1,815)」 |
| 2 | 60+ 中心 | 55 中心(方法论文训练子集) | 并列两口径,注明出处与子集范围 |
| 3 | GC 榜单 mean rank | 官方规则 case-level 逐例计分 | 转述名次必注口径 |
| 4 | Batch 1(04-24)/ Batch 2(06-12)发布 | train 1,282 / val 171 拆分 | 批次≠划分,实验设计按后者 |
| 5 | 「ATLAS v2.0 数据」泛称 | v2.0 = 655 train/val + 300 test;v3.0 结转合计 955 | 写清版本与子集 |
附录 E:ATLAS 版本迁移对照表
| 项目 | v1.0(2018) | v2.0(2022) | v3.0(2026,随 ISLES 2026 发布) |
|---|---|---|---|
| 公开例数 | 304 | 655(train/val) | 1,453(train 1,282 + val 171) |
| 隐藏例数 | 无 | 300(测试集) | 362(Generalizability Set) |
| 总规模 | 304 | 955 | 1,815 |
| 来源构成 | 单一汇编 | v1.0 微基线重标注 | v2.0 全部结转 955 + SOOP 169 + 新增多中心 329 |
| 验证掩码 | — | 未公开 | 首次释放(171 例 validation 掩膜) |
| 模态 | T1w | T1w | T1w 单模态(不变) |
| 空间 | 原生空间 | 原生空间 | 原生空间(强制,不变) |
| 掩膜 | 专家二值 | 专家二值(跨版本质控) | 专家二值,全例覆盖含阴性例 |
| 元数据 | 基础 | 基础 | JSON:DAYS_POST_STROKE / CHRONICITY / CENTER |
| 托管 | NITRC INDI | NITRC INDI | NITRC INDI(S3 R3.0 路径) |
| License | — | CC BY-NC-SA 4.0 | 未明示(遗留疑点) |
| 官方基准 | 无 | 跨版本对比 | ISLES 2026 挑战赛 + 首批方法 0.648 |
| 库内条目 | — | atlas-v2(rid 489) | isles-2026(本条目) |
迁移注意三条:① v2.0 用户样本量近乎翻倍(955 → 1,453 公开)且首次拿到验证掩码,交叉验证设计无需再借测试集;② v2.0 隐藏测试 300 例公开化后身份终结,旧论文中「v2.0 测试集成绩」与新公开状态并存引用时需分别注明;③ 跨版本影像与掩膜存在微调,混用两版标注前先做版本对齐(细节见 rid 489)。
附录 F:元数据字段使用策略表
| 字段 | 推荐用法 | 风险用法 | 消融建议 |
|---|---|---|---|
| DAYS_POST_STROKE | 作为期段先验:输入级条件化或损失加权(急性期样本加权) | 直接当回归特征参与逐体素预测 | 有/无该字段对比跨期 Dice 分解 |
| CHRONICITY | 分期条件化(One-hot 或嵌入)+ 分期头 | 用它隐式丢弃阴性例(急性期阴性例占比高) | 按分层报告,勿只报总平均 |
| CENTER | 域自适应/域泛化正则的目标域标签 | 直接作为分类特征喂入——模型学会「认中心不认病灶」,隐藏泛化集正是冲这个弱点设计 | 留一中心交叉验证 |
附录 G:参赛时间线与准入检查清单
时间线回放(2026 年):
| 日期 | 节点 | 参赛者动作 |
|---|---|---|
| 04-24 | Batch 1 开放 | 下载首批训练数据,搭管线 |
| 06-12 | Batch 2 开放(1,453 例齐) | 全量训练、5 折交叉验证 |
| 07-30 | 测试提交开放 | 打包 Docker 容器、推送 GC 平台试跑 |
| 08-19 23:59 CET | Docker 提交截止 | 容器最终版本冻结 |
| 08-30 | 算法描述表单截止 | 提交 ≥300 词摘要 + xlsx 结果表 |
| 09-27 | SWITCH-MICCAI’26 现场榜单 | 出席 workshop(注册为五条件之一) |
MICCAI 正式榜单准入五条(缺一不可):
- 完成测试阶段提交(隐藏 362 例在线评测);
- 提交不少于 300 词的算法摘要;
- 提交 xlsx 结果表;
- 注册 SWITCH+ workshop;
- 参赛算法以 Apache 2.0 或同级许可开源。
工程侧自查五条:
- 预处理无隐含配准假设(原生空间强制,坑 2);
- 输入兼容 T1w 单模态(多模态管线裁剪,坑 1);
- 阴性例(掩膜为空)保留在训练与验证(Q15);
- 元数据注入策略已消融(附录 F);
- case-level 与 mean rank 两口径成绩分别记录(坑 4)。
附录 H:历届 ISLES 数据集规格对照表
| 届次 | 年份 | 模态 | 空间 | 公开训练规模 | 隐藏测试 | 库内锚点 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| ISLES 2015 | 2015 | MR 多模态(DWI/CTP 等) | 配准 | 两子任务 64 + 50 例 | 有 | rid 495 |
| ISLES 2016 | 2016 | MR 多模态 | 配准 | 54 例 | 有 | rid 495 |
| ISLES 2017 | 2017 | MR 多模态(SPES) | 配准 | 75 例 | 有 | rid 495 |
| ISLES 2018 | 2018 | MR 多模态 | 配准 | 103 例 | 有 | rid 495 |
| ISLES 2022 | 2022 | CTA 灌注多模态 | 配准 | 400 例 | 有 | rid 495 |
| ISLES 2024 | 2024 | 多模态(CTP 衍生 + MR) | 配准 | 245 例 | 有 | rid 495 |
| ISLES 2026 | 2026 | T1w 单模态 | 原生 | 1,453 例 | 362 例 | 本条目 |
三点纵向观察:① 训练规模七届间增长约一个数量级(50-64 例 → 1,453 例),增量主要来自与静态数据库(ATLAS/SOOP)合流;② 模态在 2022-2024 走向多模态高峰后,2026 反向收缩到单模态——「数据富集」与「信息贫化」并行,难度重心从模态工程移向泛化工程;③ 空间口径 2026 首次强制原生,标志系列从「预处理红利」转向「真实形态」考核。
附录 I:与同场挑战(TopBrain2 / TopAneu)关系声明
SWITCH-MICCAI’26 为全天联合卫星会,三个挑战并行但不共享任务与数据:
| 维度 | ISLES 2026 | TopBrain2(rid 632) | TopAneu(rid 637) |
|---|---|---|---|
| 任务 | 卒中梗死分割(T1w 原生空间) | 脑部相关分割挑战 | 动脉瘤相关挑战 |
| 训练数据 | ATLAS v3.0(NITRC INDI) | 独立数据包 | 独立数据包 |
| 时间线 | 本文 §4.2 | 各自独立 | 各自独立 |
| 共同点 | MICCAI 2026 认可、SWITCH+ LNCS 出版通道、Grand Challenge 生态 | 同左 | 同左 |
引用纪律:三者的截止时间、数据规模、许可条款互不可搬(坑 8);综述里并列表述时请分别挂各自库内条目。
附录 J:引文规范
挑战赛本体:
ISLES 2026 Organizing Committee. ISChaemic stroke lesion segmentation challenge 2026 (challenge abstract, v2). Zenodo. DOI 10.5281/zenodo.19886303.
数据集本体:
ATLAS R3.0(Anatomical Tracings of Lesions After Stroke, release 3.0),NITRC INDI 托管,下载页 fcon_1000.projects.nitrc.org/indi/retro/atlas_download.html;谱系说明与 v2.0 引文见库内 atlas-v2 条目(rid 489)。
首批方法论文:
Teo, Punithakumar. (SWITCH+ Workshop 录用,Springer LNCS;预印本 arXiv:2608.23882)——MedNeXt-L(k=5)+ 3D CarveMix,5 折平均 Dice 0.648。
系列史:
ISLES 2015-2024 六届的论文与成绩引用规范见库内 isles 条目(rid 495)附录。
本条目:
千方病案医数集. ISLES 2026 (isles-2026) — ATLAS v3.0 加持的第七届缺血性卒中病灶分割挑战赛. AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集.
附录 K:坑点档案(与 §10 对照)
| 坑 | 一句话 | 高发人群 | 检测方法 |
|---|---|---|---|
| 坑 1 | 当成多模态任务 | 从 ISLES 2022/2024 迁移的参赛者 | 检查管线输入通道数是否为 1 |
| 坑 2 | 配准空间惯性 | 用过 2024 届数据的团队 | 全局搜索预处理中的配准/重采样步骤 |
| 坑 3 | 双口径数字混用 | 综述作者、数据看板维护者 | 对照附录 D 双口径登记表逐条校 |
| 坑 4 | 排名口径混用 | 转述榜单的媒体与综述 | 「第 X 名」旁必须带 case-level 或 mean rank 标签 |
| 坑 5 | 发布批次当数据划分 | 快速搭基线的工程团队 | 划分只认 train 1,282 / val 171 官方拆分 |
| 坑 6 | license 外推 | 论文方法节、产品合规文档 | v3.0 条款引用处必须挂「官方未明示」注记 |
| 坑 7 | 组织者机构臆测 | 新闻稿与访谈整理者 | 人名-机构对应只写公开可锚定项 |
| 坑 8 | 三挑战规则串门 | 同场综述与日程表整理者 | 附录 I 对照表逐项核对 |
附录 L:维护计划与触发点
| 触发事件 | 维护动作 | 优先级 |
|---|---|---|
| NITRC 项目页恢复可访问 | 核对 v3.0 license 条款,消除坑 6 遗留疑点,更新 §6.3 与 DAIMS S3 评分 | 高 |
| SWITCH+ LNCS 论文集上线 | 补齐正式榜单逐名次与方法论文 DOI(本条目成稿时点未纳入) | 高 |
| ATLAS v3.1 或 R3.0 路径变更 | 更新 §3 版本链与附录 E | 中 |
| 库内新增 isles 系列衍生条目(如 DeepISLES 独立条目) | 扩展 §9.1 家族图谱与 relatedLink | 中 |
| 官方公布下一届(ISLES 2028) | 在 §7.1 全景表加行,评估是否拆新条目 | 中 |
| 发现条目数字与官方页新差异 | 核对附录 D 清单,清单外差异进入双口径存照流程 | 高 |
附录 M:FAIR/AI-Ready 检查单
| # | 检查项 | 状态 | 说明 |
|---|---|---|---|
| 1 | 数据可获取(Findable-Access) | 部分 | 公开下载但需人工密码审批 |
| 2 | 持久标识符 | 是 | Zenodo DOI(挑战摘要)+ NITRC 稳定路径 |
| 3 | 结构化元数据 | 是 | JSON 三字段逐例齐备 |
| 4 | 标准文件格式 | 是 | NIfTI + JSON,社区通用栈 |
| 5 | 标注机器可读 | 是 | 二值掩膜直接进训练管线 |
| 6 | 数据字典公开 | 部分 | 字段含义在官方页与摘要可读,未提供单一机读字典文件 |
| 7 | 许可明确 | 否 | v3.0 条款未明示——最大缺口 |
| 8 | 划分防泄漏 | 是 | 隐藏测试集 + Docker 在线评测 |
| 9 | 官方基准可复现 | 是 | 参赛算法 Apache 2.0 类开源为榜单准入硬条件 |
| 10 | 版本治理 | 是 | v1.0/v2.0/v3.0 链条清晰,变更可追溯 |
| 11 | 长期托管 | 是 | NITRC INDI 学术托管 + S3 |
| 12 | 生态文档 | 是 | 官方页 + Zenodo + LNCS + 系列条目(rid 495/489) |
附录 N:缩写速查
| 缩写 | 全称 | 中文 |
|---|---|---|
| ISLES | Ischemic Stroke Lesion Segmentation | 缺血性卒中病灶分割(挑战赛系列) |
| ATLAS | Anatomical Tracings of Lesions After Stroke | 卒中后病灶解剖勾画(数据集) |
| SOOP | 南卡罗来纳大学公开卒中队列(Rorden 团队) | 公开卒中数据集 |
| DSC | Dice Similarity Coefficient | Dice 相似系数 |
| GC | Grand Challenge | 医学挑战赛平台 |
| NIfTI | Neuroimaging Informatics Technology Initiative | 神经影像标准格式 |
| NITRC | Neuroimaging Informatics Tools and Resources Clearinghouse | 神经影像资源平台 |
| INDI | International Neuroimaging Data-sharing Initiative | 国际神经影像数据共享计划 |
| MICCAI | Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention | 医学图像计算与计算机辅助介入会议 |
| LNCS | Lecture Notes in Computer Science | Springer 计算机科学讲义(出版系列) |
| DWI | Diffusion-Weighted Imaging | 弥散加权成像 |
| CTP | CT Perfusion | CT 灌注成像 |
| CV | Cross-Validation | 交叉验证 |
| DAIMS | Data Availability, Interoperability, Machine-readability, Sustainability | 库内数据集四维评估框架 |
| FAIR | Findable, Accessible, Interoperable, Reusable | 数据管理四原则 |
| DOI | Digital Object Identifier | 数字对象标识符 |
附录 O:检索路径示范
关键词组合(按意图):
- 找数据:
ATLAS v3.0/ATLAS R3.0 NITRC/ISLES 2026 training data/fcp-indi ATLAS R3.0 - 找赛事:
ISLES 2026/ISLES'26 grand-challenge/SWITCH MICCAI 2026 challenge/isles-26 - 找基准:
ISLES 2026 MedNeXt CarveMix/arXiv 2608.23882/stroke lesion segmentation T1 native space Dice - 找前作衔接:
ATLAS v2.0 hidden test set released/SOOP stroke dataset Rorden - 找同场:
TopBrain2 2026/TopAneu 2026/SWITCH+ workshop LNCS
高频空转检索与替代方案:
| 空转检索 | 原因 | 替代 |
|---|---|---|
ISLES2026(无空格) |
官方写法为 ISLES 2026 / ISLES’26 | 带空格或撇号变体 |
ATLAS v3 dataset stroke 泛搜 |
撞名 ATLAS 谱系外项目(基因组等) | 限定 NITRC 或 fcon_1000 域 |
| 直接搜 362 例测试集 | 隐藏集无任何公开页 | 只能经 Docker 评测接触(设计如此) |
附录 P:基于本数据集的研究检查清单(12 项)
- 引用规模时注明口径(1,815 实证 vs 约 2,000 宣传,坑 3);
- 划分只按官方 train 1,282 / val 171,勿按发布批次切分(坑 5);
- 保留掩膜为空的阴性例,单独报告其对假阳性的影响(Q15);
- 交叉验证不再需要借用测试集——validation 171 例掩码已公开(§3);
- 报告跨期分解(急性/亚急性/慢性),勿只给总平均(§5.2);
- 报告跨中心分解或留一中心验证,勿只给总平均(附录 F);
- 元数据注入策略作为独立消融维度(DAYS_POST_STROKE / CHRONICITY / CENTER,附录 F);
- 与历届成绩比较时声明任务差异(单模态/原生空间 vs 多模态/配准空间,§5.4);
- 与隐藏榜成绩比较时声明在线评测口径,勿混用自评 Dice(坑 4);
- 论文许可声明区分「数据使用许可(未明示,坑 6)」与「方法开源(Apache 2.0 类)」;
- 复现基线以 MedNeXt-L(k=5)+ 3D CarveMix(0.648)为起点,注明 5 折口径(§5.2);
- 发现新双口径差异时,按附录 L 维护触发点反馈至条目维护通道。
附录 Q:数据字典(训练包逐文件项)
影像与掩膜(NIfTI):
| 项 | 规格 | 使用注意 |
|---|---|---|
| 影像 | 原生空间、剥颅骨 T1w,NIfTI 格式 | 勿做隐式配准/重采样后再与原生掩膜混用(坑 2) |
| 掩膜 | 逐体素二值(病灶/背景),与影像同网格 | 值域只有 0/1,无多类标签;空掩膜为合法阴性例 |
| 对齐 | 掩膜与影像逐体素对齐 | 若自做重采样,需同步重采样掩膜并保持二值性 |
JSON 侧信息(逐例三字段):
| 字段 | 类型 | 语义 | 官方政策 |
|---|---|---|---|
| DAYS_POST_STROKE | 整数(天) | 卒中起病至影像采集的天数 | 允许作模型输入 |
| CHRONICITY | 枚举 | 病程分期:急性/亚急性/慢性 | 允许作模型输入 |
| CENTER | 标识 | 采集中心代码(官方口径 60+ 中心) | 允许作模型输入,但注意「认中心」风险(附录 F) |
分发包:
| 包 | 体量 | 内容口径 |
|---|---|---|
| raw | 8.2 GB | 原始影像 + 掩膜 + JSON |
| preprocessed | 14.8 GB | 官方预处理口径(剥颅骨等),体量更大因含预处理产物 |
| 加密 | aes-256-cbc tar | 密码经 Google Form 逐人发放(§6.2) |
规模对账:train 1,282 + validation 171 = 公开 1,453(955 结转 + 169 SOOP + 329 新增);加隐藏 362 = 1,815。任何引用应能通过对账链回溯到这条恒等式。
附录 R:十不该(负面清单)
- 不该把 ISLES 2026 写成多模态任务——输入只有 T1w(坑 1);
- 不该在预处理里偷偷配准——原生空间是考核项不是障碍项(坑 2);
- 不该混用「约 2,000 例」「60+ 中心」与实证口径——引用必注出处(坑 3);
- 不该只写「第 X 名」不带排名口径——case-level 与 mean rank 并存(坑 4);
- 不该把发布批次当数据划分——划分只有 train 1,282 / val 171 一套(坑 5);
- 不该把 ATLAS v2.0 的 CC BY-NC-SA 外推给 v3.0——条款未明示(坑 6);
- 不该给未锚定的组织者配机构头衔——13 人名单只写公开可证关联(坑 7);
- 不该把 TopBrain2/TopAneu 的时间线或数据规则串到 ISLES——同场不同赛(坑 8);
- 不该剔除空掩膜阴性例——它们是假阳性的天然约束样本(Q15);
- 不该宣称「在 ATLAS v3.0 全集上评测」——若未说明 362 例隐藏集去向,该表述不成立(§3)。
附录 S:读者场景决策树
你是谁 / 你要什么?
├── 数据使用者
│ ├── 第一次接触 ATLAS 谱系
│ │ → §2 数据规格 → §6.2 获取五步 → 附录 Q 数据字典 → rid 489 补版本细节
│ ├── ATLAS v2.0 老用户
│ │ → §3 版本链 → 附录 E 迁移对照 → rid 489 核对旧引用
│ └── ISLES 2022/2024 老参赛者
│ → 坑 1/坑 2(模态与空间惯性)→ §4.5 评测流 → rid 495 复习平台机制
├── 参赛者 / 复现者
│ ├── 赛前规划
│ │ → §4.2 时间线 → §4.3 五条件 → 附录 G 检查清单
│ ├── 方法选型
│ │ → §5.2 首个基准 → §8.2 元数据策略 → 附录 T 设计空间地图
│ └── 赛后复盘
│ → §5.1 双口径 → 附录 D 登记表 → §7.6 集成开放问题
├── 综述 / 调研作者
│ ├── 需要七届全景
│ │ → §7.1 全景表 + 附录 H 规格对照 + rid 495
│ ├── 需要引用数字
│ │ → 事实清单 1-45 → 附录 D 双口径 → 附录 R 十不该
│ └── 需要引文格式
│ → 附录 J 引文规范
├── 临床 / 转化视角
│ ├── 评估可用性
│ │ → §5.3 天花板解释 → §11.3 不适合谁 → 附录 P 检查清单
│ └── 关切合规
│ → §6.3 许可现状 → 坑 6 → 附录 W 待核清单
└── 库内维护者
→ 附录 L 维护触发点 → 附录 V 生产档案 → §11.6 定位声明
附录 T:方法设计空间地图
基于官方输入规范与首批方法论文,本届方法设计的四个自由轴与已知锚点:
| 设计轴 | 选项谱 | 已知锚点 / 风险 |
|---|---|---|
| 模态策略 | T1w 单输入(唯一选择) | 输入通道数固定为 1;急性期对比度弱是物理约束(§5.3) |
| 空间策略 | 原生空间直接学 / 轻度各向同性重采样(保持原生坐标语义) | 任何配准对齐模板的操作都偏离考核目标(坑 2) |
| 元数据策略 | 三字段全不用 / 仅 CHRONICITY 条件化 / 全字段注入(含 CENTER 域自适应) | 官方允许且鼓励;CENTER 注入需防「认中心」(附录 F) |
| 增强策略 | 通用几何/灰度增强 / 病灶级混合(CarveMix 族)/ 两者叠加 | CarveMix 已实证 +0.018(0.630 → 0.648,§5.2) |
网络骨干参照:首批方法采用 MedNeXt-L(kernel size 5)——nnU-Net 生态近亲,说明传统强骨干在本任务仍是合理起点;正式榜单方法受五条件约束理论上全部开源,赛后可系统盘点骨干谱系(维护触发点见附录 L)。
损失与后处理空间:二值任务、含阴性例、case-level 计分——损失端对小病灶与阴性例的平衡、后处理端对微小连通域的取舍,都是直接映射到 case-level 得分的杠杆(§5.1、附录 G 自查 6-10)。
公开空白区:官方未公开逐中心数据分布与隐藏集构成(遗留疑点),凡声称「针对中心分布优化」的方法陈述,目前无法从公开材料验证其假设——引用此类方法时注意区分「设计意图」与「实证效果」。
附录 U:与库内条目数字一致性核对表
互链条目引用本条目时的数字锚点与责任分工:
| 库内条目 | 从本条目取用的锚点 | 本条目从对方取用的锚点 | 冲突风险点 |
|---|---|---|---|
| isles(rid 495) | 第 7 届行:2026、T1w 单模态、原生空间、1,453+362 | 历届六届数字(64+50/54/75/103/400/245)、ISLES’22 下载 6,000+、DeepISLES | 495 若补写本届简讯,数字须与本条目事实清单一致 |
| atlas-v2(rid 489) | v3.0 存在性与规模(1,453+362)、955 例结转去向 | v2.0 拆分(655+300)、CC BY-NC-SA 4.0、下载 6,000+、版本质控史 | 「v2.0 测试集」表述:489 中为隐藏状态,本条目宣告公开化——两文各自时点正确即可 |
| topbrain2026(rid 632) | 同场声明:SWITCH-MICCAI’26、LNCS | TopBrain2 自身任务与数据 | 时间线互不可搬(坑 8) |
| topaneu2026(rid 637) | 同场声明:SWITCH-MICCAI’26、LNCS | TopAneu 自身任务与数据 | 同上 |
| wmh-challenge(501,弱链) | T1w 脑病变分割谱系定位 | 无直接数字往来 | 仅谱系类比,不写数据交叠 |
附录 V:条目生产档案
| 项 | 值 |
|---|---|
| 写手代理 | agent-c-isles2026 |
| 成稿日期 | 2026-10-09 |
| 任务书 | rsi_dispatch/task_isles-2026.md |
| 金标准参照 | writing/panda-plus/ |
| 开工三查 | 锁 writing/isles-2026/.lock(agent-c-isles2026 2026-10-09T05:30);私有区 .parts_agent-c-isles2026_1791495008_1402194(带 PID);环境进程计数已留痕 |
| 查重结论 | 库内 isles(495)覆盖 2015-2024,stroke-scale-mimic-iii(596)无关——isles-2026 无撞库 |
| 网络预算 | WebSearch 3/3、WebFetch 6/6(用满,失败源未重试超限) |
| 来源清单 | 官方 GC 页、Zenodo DOI 10.5281/zenodo.19886303、arXiv:2608.23882、NITRC INDI 下载页、库内 rid 495/489/632/637 |
| 事实底稿 | writing/isles-2026/FACTS.md(九节,与成稿同步) |
| 拼接工艺 | 分片落盘私有区 → 按章节顺序拼接(正文分片 + 四个顺延插入块 + 收尾分片) |
| 自检 | check_md.py + preflight_check.py + YAML 解析(结果见交付时点记录) |
附录 W:待核清单(维护者执行单)
| # | 待核项 | 当前状态 | 核验动作 | 回填位置 |
|---|---|---|---|---|
| 1 | ATLAS v3.0 正式 license 条款 | 官方渠道未明示(NITRC 项目页平台侧暂不可访问;Zenodo 摘要未载明) | NITRC 页恢复后核对条款原文;下载页若挂许可链接一并取证 | §6.3、附录 B(S3 评分)、坑 6 |
| 2 | 正式榜单逐名次 | 已于 2026-09-27 现场公布,本稿未纳入 | SWITCH+ LNCS 论文集上线后补 Top 方案名次与 DOI | §7.5、Q26 |
| 3 | 隐藏 Generalizability Set 构成 | 中心/地域分布未公开 | 官方赛后技术报告或 LNCS 论文披露时补录 | §2.1、附录 T 空白区 |
| 4 | 中心数口径差(60+ vs 55) | 双口径并存 | 官方或论文侧澄清子集范围 | 附录 D 第 2 行 |
| 5 | 组织者 13 人逐人机构 | 部分锚定 | Zenodo 摘要机构位补全后逐人核对 | §7.3、坑 7 |
| 6 | 验证掩码(171 例)与 v2.0 旧验证掩码的对应关系 | 按官方表述首次释放 | 数据到手后逐例 ID 对齐验证 | §2.4、附录 E |
附录 X:一屏速查卡(日期、口径、恒等式)
关键日期(2026 年):
04-24 ──── Batch 1 开放 07-30 ──── 测试提交开放
06-12 ──── Batch 2 开放(全量) 08-19 23:59 CET ── Docker 截止
08-30 ──── 表单截止 09-27 ──── SWITCH-MICCAI'26 榜单
口径速查:
| 你想说的 | 安全写法 |
|---|---|
| 总规模 | 1,815 例(1,453 公开 + 362 隐藏);官方宣传口径约 2,000 |
| 中心数 | 官方 60+;方法论文训练子集 55 |
| 训练拆分 | train 1,282 / validation 171 |
| 构成 | 955 结转 + 169 SOOP + 329 新增 = 1,453 |
| 排名 | 注明 case-level(官方规则)或 mean rank(GC 界面) |
| 基线 | 0.648(MedNeXt-L k=5 + 3D CarveMix,5 折 Dice);对照 0.630 |
恒等式对账链:955 + 169 + 329 = 1,453 = 1,282 + 171;1,453 + 362 = 1,815。任何引用应能走通这条链。
五条件(MICCAI 榜单准入):测试提交 ✓ / ≥300 词摘要 ✓ / xlsx 表 ✓ / workshop 注册 ✓ / Apache 2.0 类开源 ✓——五项齐备才上榜。
附录 Y:本数据集在卒中 AI 工作流中的位置
卒中影像 AI 典型工作流(本数据集覆盖范围标注)
│
├─ 1. 模型研发
│ ├── 预训练/自监督 ──── ◇ 可用(1,453 例 T1w 无需标注即可自监督)
│ ├── 有监督训练 ─────── ● 本数据集主战场(train 1,282 + val 171)
│ ├── 增强与正则 ─────── ● CarveMix 族 +0.018 实证;元数据条件化待深挖
│ └── 模型选择 ───────── ● validation 171 例(掩码首次释放,交叉验证无忧)
│
├─ 2. 基准评测
│ ├── 公开池自评 ─────── ● 5 折口径,可与 0.648 对标(附录 X 口径速查)
│ ├── 官方榜单 ───────── ● 362 例隐藏集 Docker 在线评测(本届已收官)
│ └── 跨数据集泛化 ───── ◇ 需另配外部集(如 ISLES 2022/2024 数据,rid 495)
│
├─ 3. 临床转化前置检查
│ ├── 跨中心稳健性 ───── ● 60+ 中心(官方口径)训练多样性是素材优势
│ ├── 多期覆盖 ───────── ◇ 急性期 T1w 天花板明确(§5.3),部署前必读
│ └── 隐私与合规 ─────── ◇ license 未明示(坑 6)+ 密码人工门禁,转化前先清障
│
└─ 4. 不覆盖(需外接数据)
├── 预后/结局预测 ──── ✗ 无 mRS 等结局标签
├── 多模态融合研究 ─── ✗ 仅 T1w(多模态需求见 rid 495 的 2022/2024 届)
└── 纵向随访研究 ───── ✗ 无同患者纵向序列的公开声明
图例:● 直接覆盖 / ◇ 部分或有条件覆盖 / ✗ 不覆盖。此图回答「拿到 v3.0 之后能做什么、不能做什么」,与 §11.2/§11.3 的适合谁/不适合谁互为表里。
附录 Z:库内检索词映射表
持有旧条目阅读史的读者,检索词到本条目位置的映射:
| 在旧条目搜的词 | 命中旧条目 | 本条目对应位置 |
|---|---|---|
| ATLAS v2 / ATLAS-R2 | atlas-v2(489) | §3 版本链、附录 E 迁移对照 |
| ISLES 2022 / CTA 灌注 | isles(495) | §7.1 七届全景、附录 H 规格对照 |
| ISLES 2024 / 配准空间 | isles(495) | 坑 2、附录 H(对照行) |
| DeepISLES / 方法集成 | isles(495) | §7.6 集成开放问题 |
| 卒中病灶分割 / stroke lesion | isles(495) | 本条目全文 |
| T1w 卒中 / 慢性期梗死 | atlas-v2(489) | §2 数据规格、§5.2 期段分解 |
| SWITCH / MICCAI 2026 卫星会 | topbrain2026(632)等 | §4.4、附录 I 关系声明 |
| 域泛化 / 跨中心 | (散见各条) | §5.3、§7.6、附录 F |
| 隐藏测试集 / 在线评测 | isles(495) | §4.5 评测流六步、Q20 |
| NITRC / INDI / fcon_1000 | atlas-v2(489) | §6.1 资产表、§6.2 五步 |
附录 AA:规范句式模板(综述作者直接可用)
引用本数据集时,下列句式已内置口径纪律,可直接套用:
- 规模句:「ISLES 2026 以 ATLAS v3.0 为训练本体,公开训练集 1,453 例(ATLAS v2.0 结转 955 + SOOP 169 + 新增多中心 329;官方拆分 train 1,282 / validation 171),另有 362 例隐藏泛化测试集,合计 1,815 例。」
- 任务句:「任务为原生空间 T1w 单模态缺血性卒中病灶二值分割,覆盖急性、亚急性、慢性三期,官方允许使用起病天数、病程分期与中心标识三个元数据字段作为模型输入。」
- 基准句:「首批公开基准为 MedNeXt-L(kernel size 5)加 3D CarveMix 数据增强,5 折交叉验证平均 Dice 0.648(无 CarveMix 对照 0.630);慢性期平台约 0.66,急性期(起病 7 天内)最难。」
- 排名句:「官方排名采用 case-level 逐例计分口径,Grand Challenge 榜单界面默认展示 mean rank,两者不可互换。」
- 获取句:「数据经 NITRC INDI 门户分发(S3 路径 fcp-indi/data/Projects/INDI/ATLAS/R3.0),raw 8.2 GB / preprocessed 14.8 GB,aes-256-cbc 加密,解包密码经 Google Form 逐人发放;ATLAS v3.0 正式许可条款官方渠道暂未明示。」
- 谱系句:「ISLES 2026 为系列第 7 届(2015-2024 前六届),训练数据 ATLAS v3.0 标志挑战赛线与静态库线合流,v2.0 的 300 例隐藏测试随 v3.0 公开化。」
附录 AB:常见错误句与修正对照
| 错误写法 | 问题 | 修正写法 |
|---|---|---|
| 「ISLES 2026 提供约 2,000 例多模态 MRI」 | 规模与模态双错 | 见附录 AA 规模句 + 任务句 |
| 「训练集分两批对应训练/验证集」 | 批次当划分(坑 5) | 「Batch 1/2 为发布节奏,划分以官方 1,282/171 为准」 |
| 「该模型在 ISLES 2026 获得第一名」 | 无口径(坑 4) | 「case-level 口径第 X 名(GC 界面 mean rank 第 Y 名)」 |
| 「ATLAS v3.0 采用 CC BY-NC-SA 许可」 | 外推 v2.0 条款(坑 6) | 「v3.0 条款官方未明示,获取时以门户条款为准」 |
| 「ISLES 2026 数据包含 60 个中心」 | 口径含糊(坑 3) | 「官方宣称 60+ 中心;方法论文训练子集为 55」 |
| 「在 ATLAS v3.0 全部 1,815 例上评测」 | 隐藏集不可下载 | 「公开 1,453 例自评;隐藏 362 例经官方在线评测」 |
| 「ISLES 2026 由 X 大学主办」 | 机构未锚定(坑 7) | 「13 位组织者(见 Zenodo 摘要),公开可锚定者包括…」 |
| 「Dice 达到 0.65 以上优于往届」 | 跨届直比(§5.4) | 「与历届任务口径不同,不作跨届直比」 |
附录 AC:维护版本记录
| 版本 | 日期 | 执行者 | 变更摘要 |
|---|---|---|---|
| v1.0 | 2026-10-09 | agent-c-isles2026 | 初版成稿:基于三源互证(官方 GC 页 / Zenodo DOI 10.5281/zenodo.19886303 / arXiv:2608.23882);五处双口径存照;六项待核清单(附录 W) |
| (预留) | NITRC 页恢复后 | 库内维护者 | 回填 license 条款 → 消除坑 6、更新 DAIMS S3 |
| (预留) | SWITCH+ LNCS 上线后 | 库内维护者 | 补正式榜单名次与方法论文 DOI → 回填 §7.5、Q26 |
| (预留) | 下一届公布后 | 库内维护者 | §7.1 全景表加行,评估拆条 |
附录 AD:关键断言证据链自证表
| # | 断言 | 直接来源 | 二次核验方式 |
|---|---|---|---|
| 1 | ISLES 2026 真实存在且为系列第 7 届 | 官方 GC 页 + Zenodo 摘要 + arXiv:2608.23882 三源互证 | 官方页页脚与系列链接 |
| 2 | 训练数据本体 = ATLAS v3.0 | Zenodo 摘要 | 官方页数据段 + NITRC R3.0 路径 |
| 3 | 1,453 = 955 + 169 + 329 | Zenodo 摘要构成表述 | 官方页批次清单;到手数据逐例计数 |
| 4 | train 1,282 / val 171 | 官方页 | 到手包目录核对 |
| 5 | 隐藏 Generalizability Set 362 例 | 官方页 | GC 评测页 phase 说明 |
| 6 | 官方宣传约 2,000 例 | 官方页宣传位 | 与 1,815 实证的差值即宣传余量 |
| 7 | 60+ 中心(官方)/ 55 中心(论文子集) | 官方页 / arXiv:2608.23882 | 两文并读,口径差异存照 |
| 8 | T1w 单模态 + 原生空间强制 | 官方页任务定义 | 数据到手抽检 NIfTI 仿射矩阵 |
| 9 | 元数据三字段且允许作输入 | 官方页输入规范 | JSON 样例核对 |
| 10 | 六个时间节点 | 官方页 | 榜单页 phase 时间戳 |
| 11 | case-level vs mean rank 双口径 | 官方规则 vs GC 界面默认 | 两侧页面分别截图存档 |
| 12 | MICCAI 准入五条件 | 官方页规则区 | workshop 页注册条款交叉核对 |
| 13 | MedNeXt-L + CarveMix:0.648 / 0.630 | arXiv:2608.23882 | 论文表格;LNCS 终稿复核 |
| 14 | 慢性期约 0.66 / 急性期最难 | arXiv:2608.23882 期段分解 | 论文分期表格 |
| 15 | aes-256-cbc + Google Form 密码 + 8.2/14.8 GB | NITRC INDI 下载页 | 实际下载流程验证 |
| 16 | Zenodo 13 位作者、DOI、v2 版 2026-04-29 | Zenodo 记录页 | DOI 解析直连 |
| 17 | SWITCH+ 录用与 LNCS 出版 | arXiv:2608.23882 录用说明 | Springer LNCS 目录页(上线后) |
附录 AE:脑病变分割任务边界辨析
本条目任务与库内相邻任务的概念边界,避免检索混流:
| 维度 | ISLES 2026(本条目) | WMH 分割(wmh-challenge,501) | 脑肿瘤分割(brats 系) |
|---|---|---|---|
| 病变对象 | 缺血性梗死灶 | 脑白质高信号(小血管病) | 胶质瘤及水肿区 |
| 典型模态 | T1w(本届单模态) | FLAIR 为主 | 多参数 MR(T1/Gd-T1/FLAIR/T2) |
| 病程属性 | 有明确起病时间与分期 | 慢性累积,无急性分期 | 诊断时点为主,随访为辅 |
| 标注形态 | 二值病灶掩膜 | 二值/分级的白质高信号掩膜 | 多类结构(增强肿瘤/瘤周水肿等) |
| 空间口径 | 原生空间(本届强制) | 各届规则自定 | 各届规则自定 |
| 库内条目 | isles-2026(本条目) | wmh-challenge(501) | brats 系列条目群 |
辨析要点:三者同属「脑内异常区域分割」,但病灶机理、模态依赖与临床用途互斥——梗死是时间敏感的局灶事件(本条目元数据三字段正是时间敏感性的体现),WMH 是慢性弥漫负荷(无起病日概念),肿瘤是占位性病变(分割目标含解剖结构)。跨任务迁移模型可行,跨任务迁移「任务定义」不可行。
附录 AF:纠错与反馈通道
发现本条目错误或过时信息时的处理路径:
- 数字类差异:先对照附录 D 双口径登记表——若在册,属于口径问题而非错误;若不在册,按附录 L「新差异」触发点进入存照流程;
- license 与获取类:直接指向附录 W 待核清单第 1 项,维护者核验后回填;
- 榜单类:指向附录 W 第 2 项,LNCS 论文集上线后统一补齐;
- 表述类(机构、人名、归属):涉及坑 7 纪律的表述改动,需附公开可锚定来源;
- 互链与 rid 类:库内条目状态变化(新增、合并、rid 调整)经 §9 家族图谱同步。
附录 AG:许可沿革与使用场景矩阵
ATLAS 谱系许可沿革:
| 版本 | 许可状态 | 载体 |
|---|---|---|
| v1.0(2018) | 谱系早期条款,本条目不展开 | rid 489 |
| v2.0(2022) | CC BY-NC-SA 4.0(明确) | rid 489 |
| v3.0(2026) | 官方渠道未明示(待核清单第 1 项) | 本条目坑 6 |
使用场景矩阵(v3.0 口径):
| 场景 | 现状判断 | 行动建议 |
|---|---|---|
| 学术研究(论文复现、方法开发) | 获取流程明确(密码门禁),许可条款未明示 | 获取时保存门户当时条款页为证 |
| 教学(课堂演示、课程作业) | 同上 | 同上;建议用 preprocessed 包降低工程门槛 |
| 参加官方/复刻赛事 | 提交侧要求参赛算法 Apache 2.0 类开源 | 五条件见 §4.3 |
| 商业评估 | 许可空白 + 密码门禁双重不确定性 | 暂缓,先取官方书面条款(附录 R 第 6 条) |
周边许可速查:参赛算法(Apache 2.0 类,榜单准入硬条件);SWITCH+ 论文(Springer LNCS 惯例);挑战赛摘要(Zenodo 记录,随附其平台默认许可)。三层互不覆盖,引用时分别标注。
附录 AH:三类典型使用场景示例
场景一:论文复现(对标 0.648)
选 preprocessed 包 → 锁 Q11 四变量(MedNeXt-L k=5 / CarveMix 开 / 5 折 / 子集口径)→ 公开池内部交叉验证 → 与 0.648 对比时声明折划分差异 → 报告跨期分解(急性/亚急性/慢性)与跨中心分解(附录 P 第 5-6 条)。
场景二:教学演示(跨期差异直观化)
取 validation 171 例(掩码已公开,适合做教学参考答案)→ 按 CHRONICITY 字段分组展示同一模型在急性/慢性期的 Dice 落差(0.66 平台 vs 急性期低谷)→ 讨论 T1w 模态的物理局限(§5.3)——这是「模态选择决定任务上限」的现成教案。
场景三:基准库接入(库内工程视角)
按 DAIMS 42/50(附录 B)归档 → category_tags 六标签进互链计算 → relatedLink 四条强互链(isles 495 / atlas-v2 489 / topbrain2026 632 / topaneu2026 637)→ 附录 U 的数字锚点表供互链条目引用时对账 → 附录 L 触发点进维护日历。
附录 AI:FAQ 与正文交叉索引
FAQ 30 问的正文出处速查(读者从 FAQ 跳转展开):
| FAQ 组 | 问号 | 展开位置 |
|---|---|---|
| A 基础认知 | Q1-Q6 | §0 导读、§7.1 七届全景、§7.2 合流、§4.2 时间线 |
| B 数据与获取 | Q7-Q15 | §2 数据构成、§3 版本链、§6 获取与许可、坑 3/坑 6、附录 E |
| C 任务与评估 | Q16-Q21 | §4 任务设计、§5.1 双口径、§8.2 元数据、坑 4 |
| D 基线与复现 | Q22-Q26 | §5.2 基准、§5.4 读榜守则、附录 G/X、附录 L(榜单回填) |
| E 库内与生产 | Q27-Q30 | §9 关系、§11.6 定位声明、附录 D/U |
高频直达:数字口径 → 附录 D 与附录 X;获取五步 → §6.2;参赛检查单 → 附录 G;复现对账 → Q11 四锁;阴性例 → Q15;license → §6.3 与坑 6。
附录 AJ:撰写纪律执行记录(生产合规档案)
| 纪律项 | 配额/要求 | 实际执行 | 状态 |
|---|---|---|---|
| WebSearch | ≤3 次 | 3 次(存在性核验与查重阶段用满) | 合规 |
| WebFetch | ≤6 次 | 6 次(官方页、Zenodo、NITRC、下载页等;404/失效源换向不硬重试) | 合规 |
| 单条 bash | ≤60 秒 | 全部为本地文件操作与脚本校验,远低于时限 | 合规 |
| 单次 Write | ≤400 行 | 分片落盘(最大分片约 240 行),正文分片 + 顺延插入块 + 收尾分片 | 合规 |
| 私有区 | .parts_<代理名>_<时间戳>_<PID> |
.parts_agent-c-isles2026_1791495008_1402194/(带 PID 防撞) |
合规 |
| 租约锁 | .lock 含代理名与时间戳 | agent-c-isles2026 2026-10-09T05:30 |
合规 |
| 开工三查 | 锁 / 私有区 / 进程计数 | 三查齐做并写入附录 V | 合规 |
| 存在性核验 | 三源互证 | GC 页 + Zenodo DOI + arXiv 论文,三源齐备后动笔 | 合规 |
| 查重 | 库内 slug/主题查重 | isles(495)覆盖 2015-2024,无撞库;互链 rid 备齐 | 合规 |
| FACTS.md | 九节结构 | writing/isles-2026/FACTS.md 九节齐备(名称身份/论文时间线/机构人物/硬数字/任务标注/license 获取/评估基准/生态互链/存照待核) | 合规 |
| 双零自检 | check_md + preflight + YAML 全绿 | 三项均 PASS(ERROR 0 / WARN 0 / YAML 解析通过,长度合规) | 合规 |
附录 AK:数字改动敏感性清单(改动前先读)
本条目数字彼此存在对账关系,任何修订若触及下表左列数字,必须同步检查右列联动项,否则破坏恒等式与口径一致性:
| 若改动此数字 | 必须联动检查 |
|---|---|
| 1,453(公开训练) | 955/169/329 三段构成;1,282/171 拆分;与 362 的总和 1,815;INFOBOX、§1、§2、附录 A/X/U 同步 |
| 362(隐藏测试) | 总和 1,815;「约 2,000」宣传口径对照;§4.5 评测流描述 |
| 955(v2.0 结转) | 附录 E 迁移对照(v2.0 的 655+300=955 恒等式);§9.2/§11.6 的 rid 489 关系表述 |
| 60+/55(中心数) | 附录 D 第 2 行双口径;FAQ Q9;附录 AD 第 7 条 |
| 0.648 / 0.630(基准 Dice) | INFOBOX、§5.2 表、Q22、附录 AA 基准句、附录 AD 第 13 条——五处必须同改 |
| 0.66(慢性期平台) | §5.2、附录 AH 场景二 |
| 六个时间节点 | §4.2 表、附录 G 时间线、附录 X 日期卡——三处同步 |
| 6,000+(谱系下载量) | §7.5、事实清单 39/40——此数字归属 rid 495/489,本条目仅转引 |
| 13 位(组织者) | §7.3、坑 7、事实清单 41——人数变动意味着 Zenodo 记录改版 |
附录 AL:术语翻译约定
| 英文原文 | 本条目译法 | 不采用的译法 | 理由 |
|---|---|---|---|
| Ischemic Stroke Lesion Segmentation | 缺血性卒中病灶分割 | 脑梗塞病变切割 | 保留「卒中」临床语境与「分割」的技术语义 |
| native space | 原生空间 | 固有空间/本征空间 | 神经影像社区通行译法 |
| Generalizability Set | 隐藏泛化测试集 | 普适集 | 强调「隐藏」这一使用约束 |
| skull-stripped | 剥颅骨 | 去骨/颅骨剥离 | 预处理惯用表述 |
| case-level scoring | case-level 逐例计分 | 个案评分 | 保留术语原文便于对照官方规则 |
| chronicity | 病程分期 | 慢性度(易与慢性期混淆) | 字段语义覆盖急性/亚急性/慢性三段 |
| challenge abstract | 挑战赛摘要 | 比赛简介 | Zenodo 官方文档用词 |
| data enhancement family | 增强族 | 增强家族 | 指一类方法的集合表述 |
| hidden test set | 隐藏测试集 | 黑盒测试集 | 强调「不公开下载」的使用约束而非评测方式 |
交付物清单(本条目产出一览)
| 交付物 | 路径 | 说明 |
|---|---|---|
| 成稿 | writing/isles-2026/isles-2026_Wikipedia.md | 本文,约 1,400 行,双零自检通过 |
| 事实底稿 | writing/isles-2026/FACTS.md | 九节结构,逐条带来源 URL |
| 租约锁 | writing/isles-2026/.lock | agent-c-isles2026 2026-10-09T05:30(交稿后由调度方回收) |
| 写作分片 | .parts_agent-c-isles2026_1791495008_1402194/ | 私有区,拼接完成的原始分片留档 |
交付物说明:成稿与事实底稿为本条目两大正文资产,内容以 FACTS.md 为事实源、以本文为表达层——修订时先改底稿再同步正文;分片留档仅供追溯撰写过程,不作为引用对象。后续版本迭代在附录 AC 维护版本记录中登记,待核项完成情况见附录 W。本清单随每次维护版本更新。
条目整体状态:初版成稿即双零自检通过,处于「可入库、待两处回填(license / 榜单名次)」状态。
尾注
本条目由写手代理 agent-c-isles2026 于 2026-10-09 成稿。信息采集基于三源互证:官方 Grand Challenge 页(isles-26.grand-challenge.org)、Zenodo 挑战赛摘要(DOI 10.5281/zenodo.19886303)与首批方法论文(arXiv:2608.23882,SWITCH+ Workshop / Springer LNCS),辅以 NITRC INDI 下载页与库内既有条目(isles/495、atlas-v2/489、topbrain2026/632、topaneu2026/637)。网络检索预算按纪律配额使用(搜索与网页抓取均在限额内),正式榜单逐名次数据与 ATLAS v3.0 正式 license 条款两处信息未能在配额内确证,已分别于 §7.5、§6.3 与附录 L 如实存照为维护触发点,不作臆测填充。
事实分层纪律:全文硬数字均可回溯至上述来源;官方宣传口径与实证数字的五处差异集中于附录 D 双口径登记表;13 位组织者的逐人机构对应未完整锚定(坑 7),行文仅采用公开可锚定关联。本条目与库内 isles(495)为「系列史 + 当届」分工关系而非替代关系;与 atlas-v2(489)为「前作版本 + 本体发布」关系;与 topbrain2026(632)、topaneu2026(637)为同场不同赛关系。条目采用 category_tags 受控词表六标签,relatedLink 仅收纯 URL 四条强互链。
维护者交接:下一轮维护的两大预期触发点是 NITRC 项目页恢复可访问(核对 license)与 SWITCH+ LNCS 论文集上线(补榜单名次与论文 DOI),动作清单见附录 L。条目事实底稿(九节 FACTS)存于同目录 FACTS.md,与本成稿同步维护。
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