TopAneu 2026 — 血管特异性颅内动脉瘤挑战 AI-Ready Wikipedia

多模态血管特异性颅内动脉瘤分类+分割挑战赛——52 类位置+三类型四 mask 标注、MCC+DSC/VS/HD95 mean rank 评估、TopCoW 家族第三代

来源 多中心 3D CTA/MRA(NIfTI,defaced,LPS+ 重定向)——52 类位置+3 类型+silver-standard 血管 mask 四套标注发布时间: 2026-09-25最后更新: 2026-09-25 阅读 40
TopAneu 2026 — 血管特异性颅内动脉瘤挑战 AI-Ready Wikipedia

信息速览

数据集名称TopAneu 2026 — 血管特异性颅内动脉瘤挑战 AI-Ready Wikipedia
数据类型人工标注,原始数据,影像数据
规模训练集 415 scans/408 患者;总量口径 ~850 scans(含 350+ 内部测试与赛后外部)
接入方式多中心 3D CTA/MRA(NIfTI,defaced,LPS+ 重定向)——52 类位置+3 类型+silver-standard 血管 mask 四套标注
AI 就绪度

INFOBOX:topaneu2026 速览

字段 值
数据集 TopAneu 2026 Training Data(多中心 CTA/MRA+四套标注)
全称 Multimodal Vessel-Specific Intracranial Aneurysm Classification and Segmentation
主办 TopCoW 家族三代团队——9 国 11 机构(CHUV/HUG/UZH/ZHAW/UMCU/Charité/DKFZ/武大中南医院/Mie Chuo/GIMRE/Medical Image Insights)
任务 Task 1:52 类血管位置 multi-label 分类;Task 2:体素级多类分割(位置类)——Task 2 自动双榜计分
模态 3D CTA+MRA(多模态多中心)
规模 训练 415 scans/408 患者(MRA 307+CTA 109);内部测试 350+;总量 ~850
标注 四 mask 并行:52 类位置+3 类型(囊状/夹层/梭形)+silver-standard 血管 mask+位置 JSON
可获取性 SwitchDrive 直链下载(无需注册)——直下型最高档之一
评估 每类 Precision/Recall/MCC(分类)+DSC/VS/HD95(分割)——mean rank 排名制
运行约束 Docker 提交——12 min/例、32 GB RAM、T4 16GB VRAM
学术出口 SWITCH+ 2026 workshop@MICCAI(Springer LNCS)+journal manuscript 计划(top-5 共著)
许可 Open use+attribution(opendata.swiss)——商用需许可——无发表禁运
时间线 2026-06-15 batch 1→07-31 全量→09-11~21 提交→09-27 MICCAI 决赛(进行时)
家族 TopCoW(两届)→TopBrain 2025/V2(rid 632)→TopAneu 2026——TA36 联动赛道
DAIMS ~7.9(挑战赛族最高分候选——文档/可获取性双 9)

TopAneu 2026:在血管树上给动脉瘤定位——解剖感知型动脉瘤分析的开题之作

§0 条目定位

  • 本条目是 TopCoW 家族第三弹(rid 632 TopBrain V2 的姊妹条目):TopCoW(两届,Willis 环血管变异分类)→TopBrain(48 类血管分割,NEJM AI)→TopAneu(动脉瘤位置分类+分割)——家族任务从"血管构型"到"血管树"再到"血管上的病灶"——三代谱系完整入档
  • 进行时条目(第四例):抓取时点距 MICCAI 决赛(2026-09-27)2 天——无宣奖结果、无 summary paper——条目以"赛程档案+数据资产+评估协议"为主体(对照 532 TopBrain V2 同款处理)
  • 条目身份:挑战赛型数据资产(第五类数据形态);分类+分割双任务族——检测/定位/形态定量三合一——"解剖感知型(anatomy-aware)"评估的代表作(评估按解剖位置进行)
  • AI-Ready 视角三大看点:①标注体系七条挑战赛型最富(四 mask 并行:52 类位置+3 类型+silver-standard 血管+JSON);②跨挑战赛模型资产复用首例(vessel_masks=TopBrain organizer model 预测——“上游赛事产出成为下游赛事数据组件”);③禁运光谱两极(明文无 embargo——对照 536 LEOPARD 最广禁运)

§1 "Top"家族消歧:一个前缀的三个挑战赛

  • 检索噪音场景:TopAneu/TopBrain/TopCoW 三名共享"Top"前缀+同家族+同平台——搜索引擎互相混入——家族内消歧(对照 535 OWL 跨域消歧/536 LEOPARD 医学域消歧——第三种消歧形态)
  • 三兄弟判别表:
维度 TopCoW TopBrain(rid 632) TopAneu(本条目)
全称展开 Top of the Carotid-Basilar TopBrain Segmentation Challenge Multimodal Vessel-Specific Intracranial Aneurysm…
对象 Willis 环血管构型变异 脑血管树(48 类) 动脉瘤(位置+形态)
任务 分类(构型枚举) 分割 分类+分割双任务
标签 血管构型类别 48 类血管 mask 52 类位置+3 类型 mask
届次 2023+2024 两届 2025 V1+2026 V2 2026(进行时)
  • 血统实锤(ZHAW 领英逐字):“building on previous experience with benchmarking challenges, including two editions of the TopCoW challenge”——Sven Hirsch/Ekaterina Golubeva/Norman Juchler/Vincent L’Allinec(ZHAW 系)跨三赛连续出战
  • 组织者网交叉:Bjoern Menze(UZH——TopBrain+TopAneu)/Klaus Maier-Hein(DKFZ——TopAneu organizers)/Guillaume Saliou+Patric Hagmann(CHUV——TopCoW+TopAneu)——家族组织者重叠度 50%+
  • URL 消歧细节:topaneu-26(短横线+两位年)vs topbrain2026(无横线+四位年)——同家族 URL 风格不一致——引用时精确到域名

§2 临床背景与立项对标(Zenodo 摘要逐字锚)

  • 流行病学底座:颅内动脉瘤全球人群患病率约 3%;多数无症状但破裂→蛛网膜下腔出血(SAH)——高死亡率+长期残疾——早期检出与精确表征是临床刚需
  • 临床决策三要素:治疗策略取决于大小(size)+形态(morphology)+位置(location)——三者都在影像上——AI 的机会面
  • 临床痛点两点(Zenodo 逐字):“small aneurysms are often missed”(小动脉瘤漏诊)+“there are currently no multiclass segmentation methods that classify aneurysms by their specific vessel location”(无血管位置特异的 multiclass 分割方法)——本条目填补的就是第二点
  • 直接对标(Zenodo 点名):RSNA@Kaggle 动脉瘤竞赛——13 个解剖位置分类——评价"excellent and impactful"但三项缺失:①类型覆盖(缺 fusiform/dissecting);②分割 mask;③解剖粒度——TopAneu=13 位置→52 位置+二值→三类型+无 mask→体素 mask 的三重升级
  • 位置即预后(评估设计的临床依据):“the vessel location of an aneurysm influences both its characteristics and potential severity”——位置影响特征与严重性——按位置评估=按临床意义评估
  • 数据采集口径:多中心常规临床(routine clinical practice)CTA+MRA——非专用研究协议——真实世界噪声保留(扫描仪/协议多样性)——外部验证设计的动机

§3 任务定义:双任务一体与双榜计分

  • Task 1 — Vessel-Specific Classification:输入 3D CTA/MRA→输出 52 个预定义血管位置的动脉瘤有无(multi-label)——检测+解剖定位——评估按位置类
  • Task 2 — Vessel-Specific Segmentation:输入同→输出体素级分割 mask 且每个动脉瘤体素携带其血管位置类(multi-class)——检测+分割+定位三合一;额外含大小分层分析(stratified size groups——档位未披露)
  • 双榜计分机制(七条挑战赛型首见):“Any submission to Task 2 will automatically be considered for the Task 1 leaderboard!”——Task 2 的 mask 按 class presence 转换为位置列表自动评 Task 1 指标——官方明文劝阻双提交(“please do not double-submit”)——除非有独立 tailormade 分类器
  • 任务的临床工作流映射:“from screening and localization to detailed morphological assessment”——Task 1=筛查与定位(高层面诊断输出)/Task 2=形态学定量(测量标准化+形状风险)
  • TP 定义的跨任务差异(评估协议关键细节):Task 1 的 TP=位置存在即真阳;Task 2 的 TP=预测 mask 与 GT mask 非零重叠即真阳——同一套 Precision/Recall/MCC 公式在两任务下的语义不同——复现者必读
  • 输出规格细节:
    • Task 1:JSON 列表(如 [34, 35])——注意与训练数据 location_jsons 格式不同(GC socket 兼容性设计——官方 README 两次 NOTE)——顺序无关
    • Task 2:3D MetaImage .mha——标签值域 0-52+8-bit unsigned integer——52 类的硬证据
  • 运行约束(容器工程):每例 12 分钟硬限(超时判 failed)/32 GB RAM(1 GB 系统保留)/NVIDIA T4 16 GB VRAM——轻量级约束(对照 autoPET V 等无显式披露型)——约束即设计信号:算法须在 T4 上 12 分钟内完成 3D 全颅推理
  • 任务谱系定位:分类族(TopCoW/RSNA)与分割族(TopBrain/INSTED)的合流——"两任务一体"是解剖感知评估的载体

§4 数据集:四 mask 并行与 52 类全表(标注体系之最)

  • 训练集口径:415 scans/408 unique patients——两批次:
    • batch 1(2026-06-15):98 例=40 MRA(center-2)+58 CTA(center-4)
    • batch 2(2026-07-31):+318=199 MRA(center-1)+47 CTA(center-2)+4 CTA(center-4)+68 MRA(center-5)
    • batch 加总 416 vs 页面"In total 415 scans"差 1——CHANGELOG 记录移除伪影/已治疗例——逐条对应缺失——口径存照
  • 模态拆分:MRA 307(199+40+68)+CTA 109(58+47+4)=416(同差 1)——多模态比例约 74:26
  • 中心表(5 中心:4 公开训练+1 测试预留):
Center 机构 国家 模态 患者数 备注
center-1 CHUV Lausanne 瑞士 MRA 199 训练主力
center-2 HUG Geneva 瑞士 CTA+MRA 87 双模态中心
center-3 UMC Utrecht 荷兰 — — 测试集预留不发布
center-4 Mie Chuo Medical Center 日本 CTA 54 7 例纵向扫描(count 后缀非时序)
center-5 INSTED+OpenNeuro 公开 MRA 68 32 例 INSTED(0xx 前缀,罕见位置富集)+36 例 OpenNeuro Lausanne TOF-MRA(4xx 前缀,ds003949)
  • 四 mask 并行标注体系(发布目录全录):
    • location_masks/:多类动脉瘤 mask——每体素=52 位置类之一
    • type_masks/:三类型 mask——saccular(囊状)/dissecting(夹层)/fusiform(梭形)——RSNA 对标的第一升级点
    • vessel_masks/:TopBrain organizer model 预测的血管分割——silver-standard——Zenodo 21959166 Docker 公开(含本地运行指南)——借 TopBrain 2025 summary(medRxiv 10.64898/2026.05.28.26354312)思路
    • location_jsons/:每例位置列表(与提交 JSON 格式不同——socket 兼容)
  • 52 类位置全表("50+"的精确值——五血管系):
    • 1.x 椎基底系(10 类→17 值):VA trunk/PICA trunk/VA-PICA junction/BA trunk(中线)/VA-BA junction(中线)/AICA trunk/BA-AICA junction/SCA trunk/BA-SCA junction/BA tip(中线)
    • 2.x PCA(2 类→4 值):P1P2/P3P4(左右)
    • 3.x ICA(7 类→14 值):infraclinoid C1-C5/C6-OA junction/C6-nonOA/C7-Pcom junction/C7-AChA junction/C7-nonBranch/C7-terminus(左右)——Bouthillier 分段命名
    • 4.x ACA(5 类→9 值):Acom complex(中线)/A1/A2/A3/distal ACA branches(左右)
    • 5.x MCA(4 类→8 值):M1 trunk/M1 early bifurcation/M1-M2 junction/distal M2M3(左右)
    • 合计 52 值——batch 2 新增 M1 early bifurcation(MCA 从 3 类扩为 4 类)——标签体系在使用中生长(CHANGELOG 记录)
  • 预处理链:原始 DICOM→NIfTI 转换→defacing(去面部)→LPS+ 重定向→脑区裁剪——四步标准化全部明示(可复现细节完备度样本)
  • CHANGELOG QC 透明:标注修正/defacing 改进/MCA 新类/伪影与已治疗例移除——主动缺陷与变更公示(CHIMERA v1 问题切片同款方法论)
  • 测试与验证设计:内部测试 350+ 私有例(含 center-3 UMCU)→决赛(09-27)→赛后新中心外部私有测试评估 top 方法(“rigorously assess robustness and generalizability across scanners, centers, and populations”)——External Validation Phase(OWL 同款第二例)——三段式(训练→内部测试→外部测试)
  • 总量口径自洽:415 训练+350+ 内部测试≈765+,加外部≈~850(主页)——口径三角闭合

§5 评估体系:MCC+VS 首入与 mean rank 制

  • Classification Metrics(Task 1+Task 2 共用,每类计算后跨类平均):
    • Precision=TP/(TP+FP);Recall=TP/(TP+FN)
    • MCC(Matthews 相关系数)=(TN·TP−FN·FP)/√((TP+FP)(TP+FN)(TN+FP)(TN+FN))——挑战赛族 MCC 首入——52 类长尾不平衡下 MCC 比 F1 更稳健(TN 显式参与)
    • TN 计数=“ground truth 实例数−TP−FN”——per-class 跨全样本累积
  • Segmentation Metrics(仅 Task 2,每类计算):
    • DSC(Dice Similarity Coefficient)=2|A∩B|/(|A|+|B|)
    • VS(Volumetric Similarity)=1−||A|−|B||/(|A|+|B|)——体积相似性首入挑战赛族——与 DSC 互补:DSC 对边界敏感、VS 对体积偏差敏感(动脉瘤体积=破裂风险参数——临床对齐)
    • HD95:双向表面距离 95 分位——TopBrain 四件套遗产
    • 跨 case 按 TP/FP/FN 数归一累积→跨类平均
  • Ranking:“Submissions are ranked in all individual metrics independently, the final ranking is computed as the mean rank of the individual metrics”——多指标独立排名+均值聚合——对照 531 LMC2(SSIM+PCC+rank 同构)/532 TopBrain(四件套)/536 LEOPARD(单指标 C-index)——排名制家族第三例
  • 评估代码全公开:GitHub eval/task1+eval/task2(README+main.py+测试用例)——本地复算命令 python3 main.py --base_path <dir>——评估透明度七条挑战赛型最高档(对照黑盒评估型)
  • 大小分层(Task 2 特有):stratified size groups——档位划分未披露——破裂风险的临床分层(<7mm/7-12mm/>12mm ISUIA 惯例?)——存照待决赛材料

§6 参与规则与提交工程(最严配额+外部数据双轨制)

  • 提交通道:Docker 容器(GC 标准)——模板 repo Bangulli/TopAneu-26(task1/task2 templates:main.py 数据 IO+SimpleITK 对象+inference.py 用户代码;do_build/do_save/do_test_run 三脚本本地仿真 GC 运行)
  • 配额:sanity check 每天两次/最终测试全周期一次——七条挑战赛型最严终评配额(对照 autoPET V 双赛道多次/CHIMERA 159 提交总量)——“Only successful runs contribute to the submission limit”(失败不计数——工程友好)
  • 审核上榜:组织方验证后才公开到 leaderboard(“only submissions that we can verify”)——反作弊前置
  • 外部数据双轨制(七条挑战赛型最完备):允许+须透明披露+受邀进 challenge manuscript 时须补交"仅 TopAneu 数据"训练的对照模型(“for a more fair comparison in our challenge manuscript”)——披露+对照双义务——外部数据增益可测
  • 团队规则:单人单账户/一人一队/队内统一提交/特殊情况(拆队/多算法)须审批——匿名排除
  • 组织方成员:可参赛+可进论文与排行榜+无奖资格——七条挑战赛型标准条款
  • 奖金:全页面未披露——存照(对照 autoPET V €6,000 双赛道/LEOPARD 未披露/OWL 有但数额未披露)
  • 时间线(主页 Preliminary+漂移存照):06-15 batch 1→07-31 全量→08-01~09-21 Sanity Check→09-11~09-21 Submission phase→09-27 MICCAI Challenge event(全天);漂移存照:Ruisheng Su 领英 7 月帖"Submission deadline: 5 September 2026"vs 主页 09-21——提前预告与实际延期差 16 天(时间线口径漂移第三例——对照 534 autoPET V 三口径)

§7 出版政策:无禁运极与共著规则

  • 无禁运明文(participation 页逐字):“Participating teams may submit their results separately without any publication embargo”——七条挑战赛型唯一无禁运——与 536 LEOPARD(最广禁运:约束非参赛者+双钥匙)/535 OWL(双钥匙禁运)构成禁运光谱两极
  • journal manuscript 计划:挑战赛结果将总结发表——top-5 ranked teams per task(排除组织者)受邀共著——资格三件套:①问卷披露方法②共享 Docker 容器(复现验证)③Contact Form 身份信息——"验证换共著"的交易结构
  • 共著上限:每冠军队最多 3 co-authorships;更多作者须按 ICMJE authorship guidelines 申请——对照 536 LEOPARD 参赛队全员入署(约 50 人)——共著配额制 vs 全员入署制两种论文经济学的直接对照
  • top 队 email 联系时点:Sep 27 决赛之前——邀请前置于宣奖
  • SWITCH+ 2026 workshop manuscript(可选独立赛道):4-6 页 Springer LNCS——08-07 摘要截止/08-14 通知/08-17 camera-ready(只许更新性能结果,其他章节禁改)——“Submissions can include partial algorithm results”(部分结果可投)——进行时挑战赛的弹性出版设计
  • 学术出口盘点:LNCS proceedings(SWITCH+)+journal manuscript(计划)——出口第八型(LNCS workshop 型)——对照 536 LEOPARD MIDL short(已发表)的家谱位置

§8 组织团队:9 国 11 机构与 DKFZ 六人组

  • Zenodo 数据集摘要 29 位作者(Su, Ruisheng 一作;29 人含 et al.——全名单以 organizers 页为准)
  • 11 机构全名单(organizers 页逐字):
    • TU/e Eindhoven(荷兰):Lorenz Kuhn、Ruisheng Su——工程主力(GitHub repo Bangulli=Kuhn)
    • UZH(瑞士):Kaiyuan Yang、Ezequiel de la Rosa、Houjing Huang、Suprosanna Shit、Bjoern Menze——TopBrain organizer model 出品方(vessel_masks 的上游)
    • ZHAW(瑞士):Ekaterina Golubeva、Norman Juchler、Vincent L’Allinec、Sven Hirsch——TopCoW 血统+DTH-GEMINI 资助承接方
    • CHUV Lausanne(瑞士):Jonas Richiardi、Patric Hagmann、Guillaume Saliou——center-1 数据方+OpenNeuro 数据集作者
    • UMC Utrecht(荷兰):Jiaxin Zhang、Chantal M.W. Tax、Irene van der Schaaf——center-3 测试集预留方
    • Charité CLAIM(德国):Orhun Utku Aydin、Satoru Tanioka、Dietmar Frey
    • 武汉大学中南医院(中国):Yihui Ma——GC 七条挑战赛型首个中国大陆机构
    • Medical Image Insights(中国):Pengcheng Shi
    • HUG Geneva(瑞士):Philippe Bijlenga——领英召集人(临床神经外科)
    • GIMRE Ankara(土耳其):Oktay Algin(介入 MR)
    • DKFZ(德国):Stefan Denner、Andres Martinez Mora、Alexandra Ertl、Maximilian R. Rokuss、Yannick Kirchhoff、Klaus Maier-Hein——nnU-Net 团队六人集体入 organizers——分割方法论的重磅背书
  • 地理跨度:荷兰×2/瑞士×3/德国×2/中国×2/日本/土耳其——9 国 11 机构——七条挑战赛型地理跨度最大(对照 536 LEOPARD 四国/532 TopBrain 瑞士系)
  • 临床参与制:“Clinical experts are actively involved in defining annotation protocols, validating labels, and ensuring clinical relevance”——标注协议定义权在临床专家——52 类位置体系的临床权威来源(Saliou=神经放射学家)
  • 联系人(data 页):Ruisheng Su(TU/e)/Ekaterina Golubeva(ZHAW)/Kaiyuan Yang(UZH)/Lorenz Kuhn(TU/e)——四位青年研究者级联系人(对照 536 LEOPARD Faryna 执行制)

§9 库内定位

  • 任务谱系:分类族+分割族合流——"解剖感知型"评估(per-location 评估+大小分层)——分类/检测/文本/生成/分割/生存/可解释七族之外的新子形态候选
  • 评估体系第六形态:MCC(分类侧新指标)+VS(分割侧新指标)+mean rank 聚合——七条挑战赛型指标库扩充(对照:SSIM+PCC 531/四件套 532/C-index 533/AUC 双指标 534/五阶段漏斗 535/三级阶梯 536)
  • 跨挑战赛资产复用新形态:模型资产复用(TopBrain organizer model→TopAneu vessel_masks silver-standard)——对照数据复用(OWL←LEOPARD)与引用复用(CHIMERA←LEOPARD)——三种形态齐备成谱
  • 姊妹条目直连:rid 632 TopBrain V2——同家族+TA36 联动赛道+同 Swiss 数据治理(opendata.swiss)+组织者重叠——家族互链第二例(对照 468↔634 autoPET 系列)
  • DAIMS 预估 ~7.9:可获取性 9(SwitchDrive 直链+opendata.swiss+Zenodo 双发布)/文档 9(主页+data+participation+evaluation+organizers 五页全开+GitHub+Zenodo——七源最完备)/可复现 7(评估代码公开+TA36 Docker baseline+测试集隐藏+结果未出)/标注 8(四 mask 并行+52 类+3 类型+CHANGELOG 透明——弱监督挑战赛型标注之最)/伦理 7(ethics approval+匿名化+defacing 明示)——挑战赛族最高分候选(对照 536 LEOPARD 7.4/532 TopBrain ~7.6)

FAQ:30 问直答(正文 24+附录 BB 补遗 6)

Q1:TopAneu 2026 是什么挑战赛?
Multimodal Vessel-Specific Intracranial Aneurysm Classification and Segmentation——从 3D CTA/MRA 中检测颅内动脉瘤、按 52 个血管位置分类并做体素级分割。TopCoW 家族第三代。

Q2:它和 TopBrain 什么关系?
同家族姊妹挑战赛。TopAneu 的血管 silver-standard mask 由 TopBrain organizer model 生成;双方还开设了 TA36 联动赛道(一套血管分割模型可同时参加两个挑战赛)。

Q3:它和 TopCoW 什么关系?
组织团队直接承自 TopCoW 两届(ZHAW 领英原话 “two editions of the TopCoW challenge”)——从 Willis 环构型分类演进到动脉瘤分析。

Q4:两个任务分别是什么?
Task 1:52 类血管位置 multi-label 分类(筛查+定位);Task 2:体素级分割且每个动脉瘤带位置类标签(形态定量)。Task 2 提交自动计入 Task 1 排行榜。

Q5:52 类是怎么划分的?
五大血管系:椎基底系 10 类、PCA 2 类、ICA 7 类(Bouthillier 分段)、ACA 5 类、MCA 4 类——大多左右分侧,加 4 个中线类(BA trunk/VA-BA junction/BA tip/Acom complex)共 52 值。

Q6:数据规模多大?
训练集 415 scans/408 患者(MRA 307+CTA 109);内部测试 350+ 私有例;赛后还有新中心外部测试——主页总量口径 ~850 scans。

Q7:数据从哪些中心来?
center-1 CHUV(瑞士,MRA 199)、center-2 HUG(瑞士,双模态 87)、center-4 日本三重中央(CTA 54,含 7 例纵向)、center-5 公开集(INSTED 32+OpenNeuro 36);center-3 UMC Utrecht 预留测试。

Q8:动脉瘤分哪些类型?
三类:saccular(囊状)、dissecting(夹层)、fusiform(梭形)——type_masks 提供类型级 mask——RSNA@Kaggle 13 位置分类的三项升级之一。

Q9:数据怎么下载?要注册吗?
SwitchDrive 公开直链(drive.switch.ch),无需注册即可下载训练集——opendata.swiss 条款:Open use+须注明来源,商用需数据所有者许可。

Q10:vessel_masks 是人工标注吗?
不是——是 TopBrain organizer model(Zenodo 21959166 公开 Docker)预测的 silver-standard,思路来自 TopBrain 2025 summary(medRxiv)。真正的金标是位置/类型 mask(人工标注+临床专家验证协议)。

Q11:评估用什么指标?
分类侧:每类 Precision/Recall/MCC(Matthews 相关系数——挑战赛族首用);分割侧:每类 DSC/VS(体积相似性——首用)/HD95。最终排名=各指标独立排名的 mean rank。

Q12:Task 1 和 Task 2 的 TP 定义有何不同?
Task 1 位置存在即 TP;Task 2 要求预测 mask 与 GT 非零重叠。同一套公式、两种语义——复现者必读。

Q13:提交限制多严?
Sanity check 每天两次、最终测试全周期仅一次(失败运行不计数);组织方验证后才上榜——七条挑战赛型最严配额。

Q14:容器运行环境什么配置?
每例最长 12 分钟、32 GB RAM(1GB 系统保留)、NVIDIA T4 16GB VRAM——算法须在轻量 GPU 上完成 3D 全颅推理。

Q15:可以用外部数据吗?
可以,但必须透明披露;且受邀进 challenge manuscript 时须补交一个"仅 TopAneu 数据"训练的对照模型——披露+对照双义务。

Q16:有发表禁运吗?
没有——明文 “without any publication embargo”。与 LEOPARD(最广禁运)构成光谱两极。top-5 队伍受邀共著 challenge paper(每队最多 3 个 co-authorship,ICMJE 规则)。

Q17:有奖金吗?
全页面未披露——存照。激励结构主要靠 MICCAI 展示+LNCS proceedings+top-5 共著。

Q18:决赛什么时候?
2026-09-27 MICCAI 全天 challenge event。抓取时点(09-25)距决赛 2 天——结果未出,条目无成绩数字。

Q19:M1 early bifurcation 是什么?
batch 2(07-31)新增的 MCA 位置类——MCA 从 3 类扩为 4 类(M1 trunk/M1 early bifurcation/M1-M2 junction/distal M2M3)——标签体系在使用中生长的实证。

Q20:它对标 RSNA@Kaggle 那个比赛吗?
是的,Zenodo 摘要点名:RSNA 13 位置分类"excellent and impactful"但缺类型(fusiform/dissecting)、缺分割 mask、解剖粒度不够——TopAneu 是 52 位置+三类型+体素 mask 的三重升级。

Q21:数据预处理做了什么?
原始 DICOM→NIfTI 转换→defacing(去面部)→LPS+ 重定向→脑区裁剪——四步全部明示,文件名 topaneu_{center}{modality}。

Q22: organ­izers 里有哪些重量级人物?
Bjoern Menze(UZH)、Klaus Maier-Hein 及 DKFZ 同事六人(nnU-Net 团队)、Philippe Bijlenga(HUG 神经外科,领英召集人)、Guillaume Saliou(CHUV 神经放射)——9 国 11 机构。

Q23:结果会发在哪?
双出口:SWITCH+ 2026 workshop@MICCAI(Springer LNCS proceedings,4-6 页)+挑战赛 journal manuscript(计划中,top-5 队共著)。

Q24:为什么 DAIMS 给到 ~7.9?
文档 9(七源全开+评估代码公开)、可获取性 9(直链+双 Zenodo)、标注 8(四 mask 之最)——扣分在结果未出(可复现 7)与测试集隐藏。挑战赛族最高分候选。


事实清单:36 条存照

  1. 全称 Multimodal Vessel-Specific Intracranial Aneurysm Classification and Segmentation——TopCoW 家族第三代
  2. 官网 topaneu-26.grand-challenge.org(短横线+两位年——与 topbrain2026 URL 风格不一致)
  3. 状态:进行时——MICCAI 2026-09-27 决赛(抓取时点前 2 天)
  4. 双任务:Task 1 分类(multi-label 52 类)+Task 2 分割(multi-class 体素)
  5. Task 2 提交自动计入 Task 1 排行榜(mask-to-list 转换)——双榜计分首见
  6. Task 1 输出 JSON 位置列表;Task 2 输出 .mha 8-bit mask(0-52 值域)
  7. 提交 JSON 与训练 location_jsons 格式不同(GC socket 兼容——README 两次 NOTE)
  8. 运行约束:12 min/例+32GB RAM+T4 16GB VRAM
  9. 训练集 415 scans/408 患者——batch 1(06-15)98 例+batch 2(07-31)318 例
  10. batch 加总 416 vs 页面 415 差 1(CHANGELOG 移除例——口径存照)
  11. MRA 307+CTA 109——多模态比例约 74:26
  12. 中心:CHUV 199/HUG 87/日本三重 54(7 纵向)/公开集 68/UMCU 测试预留
  13. center-5=INSTED 32(0xx 罕见位置富集)+OpenNeuro ds003949 36 例(4xx)
  14. 四 mask 并行:location_masks(52 类)+type_masks(3 类型)+vessel_masks(silver-standard)+location_jsons
  15. 三类型:saccular/dissecting/fusiform——RSNA 升级点之一
  16. vessel_masks=TopBrain organizer model 预测(Zenodo 21959166 Docker+medRxiv TopBrain 2025 summary)——跨挑战赛模型资产复用首例
  17. 52 类五血管系:椎基底 10 类/PCA 2/ICA 7(Bouthillier 分段)/ACA 5/MCA 4——左右分侧+4 中线
  18. M1 early bifurcation=batch 2 新增(MCA 3→4 类)
  19. 预处理四步:NIfTI+defacing+LPS+ 重定向+脑区裁剪——全明示
  20. 内部测试 350+ 私有例(含 center-3 UMCU);赛后新中心外部测试(OWL 同款第二例)
  21. 评估:每类 Precision/Recall/MCC 首入+DSC/VS 首入/HD95——mean rank 聚合
  22. Task 1 TP=存在即真阳;Task 2 TP=非零重叠
  23. 评估代码 GitHub 全公开(eval/task1+task2+main.py 本地复算)
  24. 提交:Docker(模板 Bangulli/TopAneu-26)——sanity 每日两次/终测全周期一次
  25. 外部数据双轨制:披露+补交"仅 TopAneu"对照模型
  26. 无发表禁运(明文)——与 LEOPARD 构成光谱两极
  27. top-5 队/task 共著 journal paper——每队 ≤3 co-authorships(ICMJE)
  28. SWITCH+ 2026 workshop:4-6 页 LNCS——08-07/08-14/08-17 三节点——camera-ready 只许改性能
  29. 临床背景:患病率 3%全球人口——破裂→SAH 高死亡率——治疗取决于大小+形态+位置
  30. 对标 RSNA@Kaggle 13 位置——三重升级(类型+mask+粒度)
  31. 组织:9 国 11 机构——DKFZ 六人(含 Maier-Hein)+Bjoern Menze+Philippe Bijlenga——武大中南医院=GC 挑战赛条目首个中国大陆机构
  32. ZHAW 领英:“two editions of the TopCoW challenge”——血统实锤;DTH-GEMINI 资助
  33. 时间线漂移:Su 领英"deadline 5 September"vs 主页 09-11~21——16 天差存照
  34. 许可:Open use+attribution(opendata.swiss)——商用需许可
  35. TA36 联动:TopAneu 36 类血管 GT 并入 TopBrain v2 Zenodo(21972006)——“One model. Two challenges.”
  36. 奖金未披露;大小分层档位未披露;423 participants 未静态验证(动态页历史口径 400+)

术语表:30 条

术语 释义
TopAneu 2026 多模态血管特异性颅内动脉瘤分类+分割挑战赛(本条目)
颅内动脉瘤 脑血管壁局限性异常膨出——患病率约 3%,破裂致 SAH
SAH 蛛网膜下腔出血——动脉瘤破裂的最严重后果
CTA CT 血管造影——center-2/4 提供的模态
MRA MR 血管造影(TOF 常用)——center-1/5 提供的模态
vessel-specific 血管位置特异——每个动脉瘤绑定其载瘤血管位置类
52 类位置 五血管系(椎基底/PCA/ICA/ACA/MCA)左右分侧的位置枚举
Bouthillier 分段 ICA 七段解剖命名(C1-C7)——3.x 类的命名依据
saccular 囊状动脉瘤——最常见的类型(浆果样)
fusiform 梭形动脉瘤——血管全周扩张(RSNA 缺失类型之一)
dissecting 夹层动脉瘤——血管壁层间撕裂(RSNA 缺失类型之一)
silver-standard 银标——模型预测的高质量替代标注(vessel_masks)
TopBrain organizer model UZH 团队的血管分割模型——vessel_masks 的生成器
MCC Matthews 相关系数——含 TN 的类不平衡稳健指标(挑战赛首用)
DSC Dice 相似系数——分割重叠度标准指标
VS Volumetric Similarity 体积相似性——体积偏差敏感指标(挑战赛首用)
HD95 Hausdorff 距离 95 分位——表面距离尾部指标
mean rank 各指标独立排名取均值——多指标聚合排名制
双榜计分 Task 2 提交自动评 Task 1 指标——一次提交两榜
multi-label 多标签分类——52 个位置各自独立预测有无
multi-class segmentation 多类分割——每体素一个位置类标签
defacing 去面部——MRI/CT 匿名化的面部移除步骤
LPS+ Left-Posterior-Superior 坐标系——医学影像标准朝向
NIfTI 神经影像信息技术计划格式——.nii.gz 分析标准
MetaImage (.mha) 元图像格式——Task 2 提交的 mask 容器
INSTED 颅内动脉瘤+动脉狭窄检测分割挑战赛——center-5 来源之一
OpenNeuro ds003949 Lausanne TOF-MRA 动脉瘤队列——center-5 来源之二
TA36 TopAneu 36 类血管解剖集(34 动脉+2 infraclinoid)——TopBrain 联动赛道
SWITCH+ MICCAI 2026 workshop——LNCS proceedings 出口
DTH-GEMINI ZHAW 披露的资助项目

附录

附录 A:挑战赛档案卡(全字段速查)

字段 值
名称 TopAneu 2026 Challenge
全称 Multimodal Vessel-Specific Intracranial Aneurysm Classification and Segmentation
平台 topaneu-26.grand-challenge.org
挂靠 MICCAI 2026(09-27 全天 challenge event)+SWITCH+ 2026 workshop(LNCS)
家族 TopCoW(两届)→TopBrain(rid 632)→TopAneu——第三代
任务 Task 1 52 类位置 multi-label 分类+Task 2 体素级多类分割(双榜计分)
模态 3D CTA+MRA
训练集 415 scans/408 患者(5 中心含公开集)/NIfTI defaced
标注 四 mask:52 类位置+3 类型+silver-standard 血管+位置 JSON
测试集 内部 350+ 私有(UMCU)+赛后新中心外部
评估 每类 Prec/Rec/MCC+DSC/VS/HD95——mean rank
运行约束 12 min/例+32GB RAM+T4 16GB
配额 sanity 每日 2 次/终测全周期 1 次
学术出口 SWITCH+ LNCS+journal manuscript(top-5 共著)——无 embargo
许可 Open use+attribution(opendata.swiss)——商用需许可
组织 9 国 11 机构——DKFZ 六人+Menze+Bijlenga——29+ 作者
时间线 06-15 batch 1→07-31 全量→09-11~21 提交→09-27 决赛
DAIMS ~7.9(挑战赛族最高分候选)

附录 B:数据规格卡

项 规格
对象 3D 脑血管造影(CTA/MRA)——常规临床采集
文件格式 NIfTI .nii.gz
预处理 DICOM→NIfTI→defacing→LPS+ 重定向→脑区裁剪(四步明示)
命名 topaneu_{centerID}{modality};center-4 纵向加 count 后缀(非时序)
训练集体量 415 scans/408 患者——MRA 307+CTA 109
标注四套 location_masks(52 类体素)/type_masks(3 类体素)/vessel_masks(silver-standard)/location_jsons(例级列表)
映射文件 location_mapping.json+type_mapping.json+vessel_mapping.json
QC 文档 CHANGELOG.txt(修正/新增/移除全记录)+README+Terms_of_use
下载 SwitchDrive 直链(无需注册)
测试集 350+ 私有例内部+新中心外部(赛后)——均不公开
配套资产 TopAneu Vessel Docker(Zenodo 21959166)+TopBrain v2 TA36 GT(21972006)
模板仓库 github.com/Bangulli/TopAneu-26(templates+eval)

附录 C:评估体系细节(公式与聚合全录)

  • 分类三指标(Task 1+Task 2 共用,per-class→跨类平均):
    • Prec=TP/(TP+FP);Rec=TP/(TP+FN)
    • MCC=(TN·TP−FN·FP)/√((TP+FP)(TP+FN)(TN+FP)(TN+FN))
    • TN=GT 实例数−TP−FN(页面原文定义——注意这是"位置×样本"粒度的累积)
  • 分割三指标(Task 2,per-class):
    • DSC=2|A∩B|/(|A|+|B|)
    • VS=1−||A|−|B||/(|A|+|B|)
    • HD95=双向表面距离第 95 百分位
    • 跨 case 累积按 TP/FP/FN 归一——类频率加权隐含在归一化里
  • 聚合:所有指标跨类平均→各指标独立排名→mean rank 终排名
  • 为什么 MCC:52 类长尾(PICA/远端 MCA 稀有位置)下,Accuracy 被多数类淹没、F1 忽略 TN——MCC 用满混淆矩阵四格——稀有位置类都不惩罚过度预测——解剖感知评估的数学配套
  • 为什么 VS:动脉瘤体积是破裂风险与治疗决策参数——VS 只看体积差(不管边界形状)——与 DSC(形状重叠)正交互补——临床参数敏感型指标设计
  • HD95 的角色:TopBrain 四件套遗产——边界质量尾部检查——三个指标合成"位置对+体积准+边界精"的完整形态学评估
  • 与家族前作对照:TopCoW(构型正确率)→TopBrain(Dice 系四件套)→TopAneu(MCC+VS 加入)——家族指标库逐代扩容

附录 D:52 类位置全表(五血管系解剖档案)

系 类(左右分侧除注明) 值域
1.x 椎基底系 1.1 VA trunk;1.2 PICA trunk;1.3 VA-PICA junction;1.4 BA trunk(中线);1.5 VA-BA junction(中线);1.6 AICA trunk;1.7 BA-AICA junction;1.8 SCA trunk;1.9 BA-SCA junction;1.10 BA tip(中线) 1-17
2.x PCA 2.1 P1P2;2.2 P3P4 18-21
3.x ICA 3.1 infraclinoid C1-C5;3.2 C6-OA junction;3.3 C6-nonOA;3.4 C7-Pcom junction;3.5 C7-AChA junction;3.6 C7-nonBranch;3.7 C7-terminus 22-35
4.x ACA 4.1 Acom complex(中线);4.2 A1;4.3 A2;4.4 A3;4.5 Distal ACA branches 36-44
5.x MCA 5.1 M1 trunk;5.2 M1 early bifurcation;5.3 M1-M2 junction;5.4 Distal M2M3 45-52
  • 临床解读要点:
    • Acom complex(前交通动脉)与 Pcom(后交通)是动脉瘤最高发位置——52 类给它们独立编码(Acom 中线类+C7-Pcom junction 左右两类)
    • M1 early bifurcation(M1 早期分叉)batch 2 新增——MCA 分叉早期动脉瘤与主干动脉瘤的处理策略不同——临床粒度驱动标签迭代
    • ICA 采用 Bouthillier 七段——C6(床突上段视神经管段)再分 OA junction/nonOA——眼动脉起始处动脉瘤的特殊性
    • PICA/VA 系(1.x)是后循环夹层动脉瘤高发区——type_masks 的 dissecting 类与之呼应
  • 52 类 vs RSNA 13 类:粒度×4——每一类的临床含义(破裂风险/入路选择)不同——**“位置类=决策类”**的解剖感知哲学

附录 E:组织团队与人物网络(9 国 11 机构)

  • 青年执行层(四位联系人):Lorenz Kuhn+Ruisheng Su(TU/e——repo/数据工程)、Kaiyuan Yang(UZH——TopBrain 模型)、Ekaterina Golubeva(ZHAW——QC 与联系)——联系人=执行者的扁平结构
  • 方法学重炮:DKFZ 六人组(Denner/Martinez Mora/Ertl/Rokuss/Kirchhoff/Maier-Hein)——nnU-Net 团队集体入 organizers——分割方法论背书的最高规格(对照 532 TopBrain 时 DKFZ 尚未入局——家族组织网扩张)
  • 家族连续出战者:Sven Hirsch/Golubeva/Juchler/L’Allinec(ZHAW——TopCoW 两届+TopBrain+TopAneu);Menze(UZH);Saliou/Hagmann/Richiardi(CHUV——TopCoW 起点)
  • 临床权威:Philippe Bijlenga(HUG 神经外科——领英召集);Guillaume Saliou(CHUV 神经放射——OpenNeuro 数据集通讯);Oktay Algin(GIMRE 介入 MR)
  • 中国力量:Yihui Ma(武大中南医院)+Pengcheng Shi(Medical Image Insights)——GC 挑战赛条目首个中国大陆机构——七条挑战赛型组织地理版图补全东亚+中国
  • 测试集守护者:UMC Utrecht(Jiaxin Zhang/Chantal Tax/Irene van der Schaaf)——center-3 全量预留——数据方与测试方分离的利益冲突设计
  • 资助:DTH-GEMINI(ZHAW Digital Health Lab 承接)——瑞士数字健康国家项目线

附录 F:口径三重奏与漂移档案

口径 数字 信源 覆盖
data 页 415 scans/408 患者 topaneu-26 data 页 训练发布(精确)
batch 加总 98+318=416 data 页分批叙述 差 1——CHANGELOG 移除
Zenodo 300+ 新采集+200+ 公开重标注 Zenodo 19848807 摘要 训练侧模糊口径(500+)
主页 ~850 scans topaneu-26 主页 训练+350 内部测试+外部(总量)
deadline 09-05(领英)vs 09-11~21(主页) Su 领英 7 月帖 时间线漂移 16 天
  • 漂移形态学:①加总差 1(416 vs 415——移除例的批次归属);②精确 vs 模糊(415 vs 500+——摘要修辞);③部分 vs 总量(415 vs 850——测试侧隐藏);④时间线提前预告(09-05 vs 09-21——赛程调整未回溯更新宣传帖)
  • 处置:正文以 415(训练精确)/350+(内部测试,Zenodo 口径)/~850(总量,主页口径)三层呈现;deadline 以主页 09-21 为准+领英漂移存照——"精确层+模糊层+总量层"三明治引用法(附录 AI 规范的实施样本)

附录 G:可获取性光谱更新(七条挑战赛型横评)

条目 档位 载体 备注
531 LMC2 注册墙 GC Join+Google Docs 登录墙
532 TopBrain Zenodo 直下 Zenodo 五 DOI 小数据全开放
533 CHIMERA AWS Registry s3://chimera-challenge 无账户直下
534 autoPET V 三载体冗余 TCIA+Zenodo+FDAT 单点失效最低
535 OWL 注册墙(名义) GC Join→跳 LEOPARD AWS 旁路
536 LEOPARD AWS Registry s3://leopard-challenge Registry 最完备
537 TopAneu SwitchDrive 直链 drive.switch.ch 公开链接 无需注册+双 Zenodo 配套
  • TopAneu 档位判读:SwitchDrive 公开分享链接=点击即下(无账户无 CLI)——便利性最高;但单点(瑞士教育云)+无 Registry 元数据——"便利性 vs 制度化"的权衡——与 AWS Registry 型并列最高档不同维度
  • 配套冗余:Zenodo 19848807(数据集摘要)+21959166(vessel Docker)+21972006(TopBrain v2 TA36 GT)——三 Zenodo 记录环抱——核心资产(mask/Docker/GT)分别存档

附录 H:DAIMS 评分卡(~7.9——挑战赛族最高分候选)

维度 分 依据
可获取性 9 SwitchDrive 直链+opendata.swiss 条款明示+三 Zenodo 配套;扣分:单点托管
文档完备 9 五页全开(home/data/participation/evaluation/organizers)+GitHub 模板与评估代码+Zenodo 摘要——七源最完备;扣分:大小分层档位未披露
可复现 7 评估实现公开+TA36 Docker baseline+本地评估脚本;扣分:决赛结果未出+测试集隐藏+终榜未生成
标注 8 四 mask 并行+52 类+3 类型+CHANGELOG QC+临床专家验证协议;扣分:vessel mask 为 silver-standard(非人工金标)
伦理 7 "fully anonymized and collected under ethical approval"明示+defacing;扣分:IRB 编号未披露
加权 ~7.9 挑战赛族最高(对照 536 LEOPARD 7.4/532 TopBrain ~7.6/535 OWL 6.9)
  • 评分卡判读:"进行时"条目的可复现 7 是天花板(结果未出+测试隐藏是赛程固有)——决赛后有望升至 8+——DAIMS 是时间函数的实证
  • 标注 8 的来源:四 mask 并行+三类型(唯一)+52 类(最细)+QC 公示——但 vessel mask 非人工——"标注丰富度"与"标注金标度"分离的新刻度

附录 I:引用规范与口径三明治法

  • 三明治引用法(本条目实践):精确层(415/408——可下载可数)+模糊层(350+ 内部测试——Zenodo 措辞)+总量层(~850——主页口径)——每层标注信源
  • 成绩引用的空窗处理:决赛前条目无成绩数字——引用规范只写协议(指标/配额/排名制)不写名次——**“协议可引、成绩待补”**的进行时条目引用纪律
  • deadline 引用:以主页(09-11~21)为准;领英宣传帖(09-05)作漂移存照不作事实——宣传材料的时效性降级原则
  • "50+“vs"52”:主页"50+“为约数——data 页 52 值表为精确——正文用 52+脚注"主页口径 50+”——约数与精确数并存时取精确+注明出处
  • 跨条目数字红线:TopBrain 48 类/TA36 36 类/TopAneu 52 类——三个数字三条谱系——严禁混用(48≠36≠52——TA36 是 TopAneu 的血管标注集不是 TopBrain 全集)

附录 J:MIL 之外的范式谱系(动脉瘤分割方法学地图)

  • 颅内动脉瘤分割方法学三代:
    • 第一代(2018-2021):2D/3D CNN 二值分割——/domain 专用小数据(AneuPy/ADAM 家族)——二值 mask 时代
    • 第二代(2022-2024):检测+分割两阶段/nnU-Net 系/注意力 3D UNet——ADAM 竞赛(MICCAI 2022)确立 benchmark——检测与分割分工
    • 第三代(2025-2026):位置感知/类型感知——RSNA@Kaggle(13 位置分类)→TopAneu(52 位置+3 类型分割)——解剖感知时代
  • 本条目的方法学信号:
    • silver-standard 血管 mask 作为辅助输入(“Optional auxiliary data (training only)”)——血管先验引导动脉瘤分割——空间解剖约束的工程化
    • T4 16GB+12min 约束——排斥巨型模型——轻量 3D 推理是隐形赛道门槛
    • nnU-Net 团队在 organizers——官方 baseline 大概率 nnU-Net 系(决赛材料待验)
  • 与 INSTED 的关系:INSTED(动脉瘤+狭窄双任务)贡献 32 例训练数据——挑战赛数据流入上游挑战赛的横向案例(对照 TopBrain→TopAneu 纵向模型流)
  • ADAM/INSTED/RSNA/TopAneu 四数据集对照:二值/双任务/13 位置分类/52 位置+3 类型——标注粒度的摩尔线

附录 K:跨挑战赛资产复用谱系(三形态定型)

  • 形态一:数据复用——OWL(rid 635)完全复用 LEOPARD(rid 636)508 例训练集——数据不动任务升级
  • 形态二:模型复用——TopAneu vessel_masks=TopBrain organizer model 预测——上游赛事的产出(模型)成为下游赛事的数据组件(silver-standard 标注)——本条目定型
  • 形态三:引用复用——CHIMERA(rid 633)官方推荐 LEOPARD 为预训练源——不迁移资产只建立方法学引用
  • 复用的治理差异:数据复用需许可传导(OWL 承 LEOPARD CC 条款);模型复用需 silver-standard 的质量声明(TopAneu README 明示"predicted by in-house model"——不冒充金标);引用复用最轻(无资产流动)
  • AI-Ready 评估启示:数据资产的"血统链"(provenance chain)应入档——TopAneu location_masks(人工金标)与 vessel_masks(模型银标)的金标/银标分离标注——标注质量的透明度新维度
  • 本库复用网络现状:636↔635(数据)+632→637(模型)+633←636(引用)——跨挑战赛复用图已有三边——挑战赛族的网络效应量化

附录 L:TA36 联动赛道机制解剖

  • 设计:TopAneu 的 36 类血管解剖(34 common artery+2 infraclinoid 新类)GT 并入 TopBrain v2 数据发布(Zenodo 21972006 labelsTr_topbrain_v2_topaneu36class);TopAneu Vessel Docker(21959166)作为 TA36 track 的官方 baseline
  • 评估:在 TopBrain 隐藏测试集(金标)上评 TA36 血管分割——与官方 Docker 对比
  • 双向引流逻辑:TopAneu 参赛者获得独立金标评估(“let us do the evaluation for you”);TopBrain 参赛者"might win both challenges"——一次建模两赛变现
  • 意外发现官方披露:“models trained on the TA36 annotations provided useful vessel anatomy for aneurysm localization, despite being trained on a non-aneurysm dataset. We have used this capability to help flag and resolve several cases of misclassified aneurysms in the TopAneu data”——血管分割模型反向帮 QC 动脉瘤标注——跨任务标注质检的罕见明文
  • 提交窗口对齐:TA36 提交关闭≈TopAneu deadline 后 1-2 天(buffer 设计)——家族赛程协同
  • 方法学判读:TA36=家族基础设施层(血管解剖公共件)——TopAneu=应用层(动脉瘤)——"公共件+应用赛"的分层架构——挑战赛系列化的新工程范式

附录 M:临床整合路径(动脉瘤筛查工作流里的位置感知 AI)

  • 现行临床路径:影像采集(CTA/MRA)→放射科医师阅片→动脉瘤检出+位置描述+大小测量→治疗决策(随访/介入/夹闭)——阅片疲劳→小动脉瘤漏诊(Zenodo 立项痛点)
  • TopAneu 模型的插入点:①检出+定位(Task 1——筛查报告草稿)②分割+测量(Task 2——体积/形态自动量化)——双任务对应报告两个章节
  • 位置类的决策价值:52 类位置直接映射治疗入路(血管内栓塞 vs 开颅夹闭)与随访策略——位置标签=临床语言的直接编码(非中间特征)
  • 大小分层的决策价值:破裂风险与大小强相关(ISUIA/PHASES 量表)——分层评估=按决策阈值检验性能
  • 部署三关(同 536 LEOPARD 框架):校准(检出置信度)→前瞻验证(外部测试已设计)→监管(SaMD 路径)——外部验证前置设计是本条目相对 LEOPARD 的治理进步
  • 与家族临床叙事连续性:TopCoW(血管构型→介入方案)→TopBrain(血管分割→测量基础)→TopAneu(病灶→筛查决策)——家族三代覆盖"血管-测量-决策"全链

附录 N:GC 核查模板 v1.7 实施记录(本条目执行细节)

  • 条款 14(前作锚反向校验):本条目引用 rid 632 TopBrain(TA36/Docker/medRxiv)——已核 TopBrain V2 页原文一致(36 类/2 infraclinoid/34 common/ECA 排除)✓
  • 条款 15(赛后论文追查):状态=进行时(未完赛)——summary paper 不存在——进行时例外条款:以 Zenodo 数据集摘要(19848807)为学术锚
  • 条款 16(禁运标注):明文无 embargo——禁运字段=“无”——禁运光谱两极确认(对照 536 双钥匙)
  • v1.7 新增试行条款 17(进行时条目协议优先):未完赛条目以"协议可引、成绩待补"纪律写作——评估协议/配额/时间线为主体的档案化——本条目为该条款首个实施样本
  • 核查轮数:五轮(主页→data→participation→evaluation(搜索路径命中)→Zenodo+GitHub+领英三源)——前作锚(TopBrain 在库)+模板成熟使轮数收敛
  • 模板 v1.0→v1.7 全程谱系:v1.0 跨源五查(531)→v1.5 前作锚分级+消歧(532)→v1.5+ 多义名实战(533)→v1.6 系列锚+三载体(534)→v1.6 完全体(535)→v1.7 补库反向锚+论文追查+禁运标注(536)→v1.7+进行时协议优先(537)

附录 O:与库内挑战赛条目联动矩阵

库内条目 联动点
rid 632 TopBrain V2 姊妹直连:TA36 联动赛道+organizer model 复用+同许可+同 Swiss 治理+Menze 交叉
rid 633 CHIMERA CHANGELOG QC 透明同款;多中心数据治理对照(Cohort A/B 批次效应 vs TopAneu 五中心)
rid 636 LEOPARD 禁运两极(无 embargo vs 双钥匙);青年执行层对照(四位联系人 vs Faryna 执行制)
rid 634 autoPET V 运行约束披露对照(T4 16GB 明示 vs 未披露);时间线漂移同款(三口径)
rid 635 OWL External Validation Phase 同款设计(赛后新中心外部测试);mil 提交双榜计分对照五阶段漏斗
rid 468 AutoPET 挑战赛系列化先例——TopCoW 家族是第二个系列化样本
  • 联动判读:TopAneu 上线后,库内"TopCoW 家族"成为第二个完整挑战赛系列档案(第一个是 autoPET 五届)——系列档案化能力的第二次验证

附录 P:SwitchDrive 与瑞士数据治理(opendata.swiss 条款细读)

  • SwitchDrive:瑞士高校联合云盘(SWITCH 学术网络运营)——公开分享链接=点击即下——教育云直下型(对照 AWS S3/ Zenodo/GC 注册墙)
  • opendata.swiss 条款(主页+data 页逐字):“Open use. Must provide the source. Use for commercial purposes requires permission from the data owner.”——三段式:开放使用+来源义务+商用许可——Attribution-NonCommercial 等效语义(无 CC 编号的自定义条款)
  • 与 TopBrain 同款条款——Swiss 数据治理家族模板(opendata.swiss 国家门户+Swiss 学术云托管+ethics approval 明示)——对照荷兰系(GC 平台+CC BY-NC-SA)
  • 术语文件:发布包内 Terms_of_use.txt 随数据分发——条款随包(下载即同意——“By downloading the data, you agree”)
  • 匿名化声明:“Data are fully anonymized and collected under ethical approval”+defacing 四步——瑞士系双层脱敏(临床流程+技术处理)
  • 治理启示:条款的可读性(自然语言三句)vs CC 法律文本(六页)——AI-Ready 的"许可可达性"维度——自然语言条款+明确商用路径(联系数据所有者)对工程团队更友好

附录 Q:页面极简型 vs 页面完备型核查档(TopAneu=完备型标杆)

  • 页面清单(TopAneu 五页全开+外部三源):
    • home(任务/背景/schedule/许可/注册)
    • data(415 全细节+52 类全表+目录结构+CHANGELOG+联系人)
    • participation(提交规格+双榜计分+运行约束+规则+publication policy)
    • evaluation(三指标公式+聚合制——公式直接上页面,罕见)
    • organizers(11 机构全名单)
    • GitHub(模板+评估实现+本地评估)
    • Zenodo(29 作者数据集摘要)×3
    • 领英×3(召集/发布/血统)
  • 对照极:536 LEOPARD(evaluation/rules 404——极简型——paper 补位);TopAneu=完备型标杆(evaluation 公式上页面——免查 paper)
  • 信源等级:一手官方七源+二手零依赖——七条挑战赛型唯一"全一手"条目
  • 核查经济学:完备型条目核查轮数最少(五轮收敛)+FACTS 最厚(11 节)——页面完备度与核查成本反比、与档案质量正比

附录 R:三口径漂移治理实例(415/500+/850 的三明治引用)

  • 正文引用模板:“训练集 415 scans/408 患者(data 页精确口径);Zenodo 摘要口径 300+ 新采集+200+ 公开重标注;主页总量 ~850 scans(含 350+ 内部测试与赛后外部)”——三层各注信源
  • 禁止事项:①用 ~850 冒充训练集规模;②用 500+ 与 415 并列造成矛盾外观;③batch 加总 416 与页面 415 并列不加注(差 1 需 CHANGELOG 解释)
  • 领英时间线的处理:09-05 deadline 是赛程调整前的预告——引用当前主页 09-11~21——**“以平台现状为准、宣传存档”**原则
  • 423 participants 处置:GC 动态页无静态数字——历史抓取口径 400+(时点存照)——正文写"参与规模未静态披露(GC 动态页)"——不引用不可验证数字纪律
  • 与 534 autoPET V 时间线三口径对照:两案例共同确立"时间线漂移"的标准处置(当前主页>历史帖>二手转述)

附录 S:二手信源与镜像生态(Kaggle 镜像案例)

  • Kaggle 镜像:devkumarbiswas/topanu-26dev——第三方搬运 batch 1 数据+主页文案——非官方镜像(未经组织方确认)
  • 镜像价值:数据可达性冗余(另一下载路径);镜像风险:批次滞后(仅 batch 1)/条款可能脱节/无 CHANGELOG 跟进
  • 本库处置:不引用 Kaggle 镜像为数据入口——只在附录存照其存在——官方直链唯一性原则(对照 536 LEOPARD 的 Paicon 新闻稿膨胀案例——二手源的引用纪律一脉相承)
  • 领英三帖的信源分级:Bijlenga(organizer 本人——一手)/ZHAW ICLS(机构账号——一手)/Su(organizer——一手但含过期 deadline)——一手账号≠一手时效——分级加时效双维

附录 T:复现代码骨架(Task 2 最小管线)

# TopAneu Task 2 最小骨架:nnU-Net 风格 3D 分割+52 类位置头
# 数据:SwitchDrive 直链下载 topaneu/(415 例 NIfTI)
# 输入:images/*.nii.gz(CTA/MRA 3D,defaced,LPS+)
# 输出:location_masks 同构 3D mask(0-52,uint8,.mha 提交)

import nibabel as nib
import numpy as np
import SimpleITK as sitk   # 模板用 SimpleITK——GC socket 对齐

def load_case(img_path):
    """模板 main.py 已 serve SimpleITK 对象——本地调试等价读取"""
    img = sitk.ReadImage(img_path)
    return sitk.GetArrayFromImage(img)  # (Z, Y, X)

# —— 训练侧:四 mask 联合监督 ——
# location_mask: (Z,Y,X) int——0=背景, 1..52=位置类
# type_mask:     同构——1=saccular 2=dissecting 3=fusiform
# vessel_mask:   silver-standard(TopBrain organizer model)——辅助先验
# 联合损失建议:
#   L = CE_location(pred, loc)          # 52 类位置主损失
#     + λ1 * CE_type(pred_type, typ)    # 类型辅助头(共享 encoder)
#     + λ2 * Dice_location              # 类不平衡对冲
# vessel_mask 用法:a) 通道拼接输入(解剖先验)
#                  b) ROI 裁剪(血管附近才预测动脉瘤——假阳抑制)

# —— 推理侧:12min/T4/16GB 约束下的工程要点 ——
# 1) 滑窗推理 stride<patch(nnU-Net 惯例)——T4 上 fp16
# 2) 全颅 3D 勿一次性进显存——patch 128^3 级
# 3) 输出 uint8 0-52 直接存 .mha(MetaImage):
mask = pred.argmax(0).astype(np.uint8)     # (Z,Y,X) 0-52
sitk.WriteImage(sitk.GetImageFromArray(mask), "topaneu_pred.mha")

# —— Task 1 免费获得:mask→list ——
locs = sorted(int(v) for v in np.unique(mask) if v != 0)
# json.dump(locs, f)——即 Task 1 提交格式(值域对齐 location_mapping.json)

# —— 本地评估(官方 eval 复算)——
# cd eval/task2 && python3 main.py --base_path ./my_eval/
#   (predictions/ 与 ground-truth/ 同父目录,文件名排序对齐)
# 输出 metrics.json:per-class DSC/VS/HD95 + 分类 Prec/Rec/MCC
  • 骨架要点:①location_mapping.json 的 1-52 值域是提交硬约束;②vessel_mask 双用法(先验输入/ROI 裁剪);③Task 1 从 Task 2 免费导出(双榜计分的代码级实现);④官方 eval 支持本地复算——提交前自评闭环

附录 U:人名机构全表

人名 机构 角色
Ruisheng Su TU/e 一作/数据工程/联系人
Lorenz Kuhn TU/e repo(Bangulli)/联系人
Kaiyuan Yang UZH TopBrain 模型/联系人
Ekaterina Golubeva ZHAW QC/联系人
Sven Hirsch ZHAW TopCoW 血统/DTH-GEMINI
Norman Juchler ZHAW TopCoW 血统
Vincent L’Allinec ZHAW TopCoW 血统
Bjoern Menze UZH 掌门级/TopBrain+TopAneu
Ezequiel de la Rosa / Houjing Huang / Suprosanna Shit UZH 方法组
Jonas Richiardi / Patric Hagmann / Guillaume Saliou CHUV center-1 数据+OpenNeuro+临床
Jiaxin Zhang / Chantal M.W. Tax / Irene van der Schaaf UMC Utrecht center-3 测试预留
Orhun Utku Aydin / Satoru Tanioka / Dietmar Frey Charité CLAIM 方法组
Yihui Ma 武汉大学中南医院 中国临床协作
Pengcheng Shi Medical Image Insights 中国产业协作
Philippe Bijlenga HUG 神经外科/领英召集
Oktay Algin GIMRE Ankara 介入 MR
Stefan Denner / A. Martinez Mora / Alexandra Ertl / M.R. Rokuss / Y. Kirchhoff / Klaus Maier-Hein DKFZ 分割方法论六人组

附录 V:五血管系解剖教学卡(52 类的临床地图)

  • 椎基底系(1.x,17 值):VA(椎动脉)颅内段→PICA(小脑后下动脉)起始→BA(基底动脉)主干→SCA(小脑上动脉)→BA tip(基底动脉尖)——后循环动脉瘤夹层高发——dissecting 类型与 1.x 位置强关联
  • PCA(2.x,4 值):P1P2(环池段)/P3P4(四叠体段分界)——PCA 动脉瘤少见但位置深
  • ICA(3.x,14 值):Bouthillier 分段 C1-C7——infraclinoid(海绵窦内 C1-C5)动脉瘤罕破但体积大;C7-Pcom junction 是高发位(后交通动脉瘤——动眼神经麻痹体征)
  • ACA(4.x,9 值):Acom complex(前交通)=最高发位置——中线单类(不可左右)——A2-A3-远端分支递减
  • MCA(5.x,8 值):M1 主干/M1 early bifurcation(新增)/M1-M2 junction/远端 M2M3——MCA 分叉动脉瘤=第二高发——"early bifurcation"的独立成类反映手术入路差异
  • 中线四类(BA trunk/VA-BA junction/BA tip/Acom):无左右之分——52=49×2+4 的结构
  • 教学要点:52 类的每一类=不同破裂风险+不同入路+不同随访——“位置类即决策类”——这是 per-location 评估的临床正当性

附录 W:大小分层教学卡(rupture risk 的评估维度)

  • 临床量表锚点:PHASES 评分(Population/HTN/Age/Size/Earlier SAH/Site)——size 与 site 是影像可得的两项——TopAneu 的评估设计(per-location+size 分层)恰好覆盖两影像要素
  • ISUIA 惯例档位:<7mm(低危)/7-12mm/12-24mm/>24mm(高危)——TopAneu 分层档位未披露(可能对齐惯例——决赛材料待验)
  • VS 指标与大小分层的配合:小动脉瘤(<3mm)分割的体绝对误差容忍度应更小——VS 对小结构的体积偏差敏感——"小病灶评估难"的指标学配套
  • Task 1 无大小分层的原因:分类只有"有无"——大小信息在 Task 2 的分割体积里——两任务的评估不对称是任务本义
  • 与 LEOPARD TTR 对照:LEOPARD 评估"何时复发"(时间轴)、TopAneu 评估"多大多危险"(空间轴)——生存与形态两大预后轴——挑战赛族评估设计的两极

附录 X:API 提交格式细节卡(工程必读)

  • Task 1 JSON schema(repo Task1_output_json_schema.json):整数数组(如 [34, 35])——值域=location_mapping.json 的 1-52——顺序无关(官方建议升序可读)
  • Task 2 .mha 规格:3D MetaImage——uint8 0-52——与 location_masks 同构——spacing/metadata 建议保留输入头信息
  • socket 兼容陷阱:训练 location_jsons 与提交 JSON 格式不同(键名/嵌套差异)——模板 main.py 已处理——自写容器必读两次 NOTE
  • 失败判据:12 分钟超时即 failed(不计配额)——timeout 优先于正确性的工程排序——建议推理前先跑 sanity(每日 2 次免费)
  • 本地仿真三脚本:do_build(构建 topaneu-26-task[1/2]:latest)→do_test_run(–gpus all 仿真 GC 运行)→do_save(导出 tar.gz 上传)——本地通过再上传的零浪费流程
  • GPU 提示:T4 16GB=fp16 推理的舒适区;3D 全颅 fp32 滑窗在 12 分钟内危险——半开精度+滑窗 stride 调优是隐形竞赛

附录 Y:进行时条目更新预案(决赛后字段)

  • 触发事件:2026-09-27 MICCAI challenge event——宣奖+top 方法公开
  • 预案一:成绩回填——Task 1/Task 2 final leaderboard top 名次与 mean rank 数字——§5 评估体系节补"终评结果"小节——附录新增"成绩档案"
  • 预案二:baseline 对照——官方 Docker(TA36 baseline)在 final test 的成绩披露——J 附录"官方 baseline 大概率 nnU-Net 系"的验证
  • 预案三:外部验证跟踪——赛后新中心外部测试结果(top 方法稳健性)——External Validation Phase 完成后回填
  • 预案四:共著名单——top-5 队/task 邀请结果——journal manuscript 作者网更新
  • 预案五:DAIMS 重估——决赛+外部验证后可复现维度 7→8+——时间函数 DAIS 的首个前瞻记录(对照 536 LEOPARD 的 journal paper 预案同款机制)
  • 更新触发:production_tracker.md"下一发"栏挂监控任务——MICCAI 2026 结束后一周内复查

附录 Z:AI-Ready 检查单(分类+分割双任务型·10 项)

  1. 标签体系是否有官方映射文档——是(location_mapping.json+type_mapping.json+vessel_mapping.json)
  2. 类别数是否精确披露——是(52——含新增类记录)
  3. 类型/子结构标注是否独立成套——是(type_masks 三类型——七条挑战赛型唯一)
  4. 银标/金标是否分离声明——是(vessel_masks 明示"predicted by in-house model")
  5. 评估指标是否删失/不平衡稳健——是(MCC——52 类长尾配套)
  6. 评估代码是否公开可本地复算——是(GitHub eval+main.py)
  7. 运行约束是否明示——是(12min/32GB/T4 16GB——最透明)
  8. 外部数据政策是否有对照义务——是(双轨制——补交对照模型)
  9. 测试集是否有赛后外部验证设计——是(新中心外部——OWL 同款)
  10. 提交格式 schema 是否文档化——是(Task1_output_json_schema.json)
  • 检查单判读:10/10 全达标——七条挑战赛型首个满分检查单——双任务型条目的 AI-Ready 标杆(对照 536 LEOPARD 7/10)

附录 AA:与 RSNA@Kaggle 竞赛的升级对照(对标解剖)

维度 RSNA@Kaggle(2025) TopAneu 2026 升级幅度
位置类数 13 52 ×4
类型覆盖 仅 saccular 为主 saccular/dissecting/fusiform +2 类
分割 mask 无(分类为主) 体素级 52 类 mask 从无到有
模态 MRA 为主 CTA+MRA 双模态 +CTA
评估 位置分类 AUC 系 MCC+DSC/VS/HD95 per-location 形态学维度
数据规模 数千例(多期公开) 415 训练+350 测试 精而专
平台 Kaggle Grand Challenge 容器化评估
  • 对标判读:Zenodo 摘要的"opportunities for further enhancement"三点(类型/mask/粒度)逐条落地——"致敬式升级"的挑战赛迭代文本——点名为尊重、缺口为定位
  • RSNA 数据复用情况:TopAneu 未直接并入 RSNA 数据(center-5 用 INSTED+OpenNeuro)——对标不复用的路线选择(数据独立性优先)

附录 AB:四国数据治理与伦理档案

  • 五中心伦理口径:“fully anonymized and collected under ethical approval”(主页)——汇总声明(无逐中心 IRB 号——存照)
  • 技术脱敏四步:NIfTI 转换+defacing+LPS+ 重定向+脑区裁剪——defacing 对 MRA/CTA 的面部结构移除——可复现的匿名化(对照 530 VinDr 的 HIPAA 姿态+UID 重编码)
  • 纵向数据:center-4 七例纵向扫描——同患者多时点——纵向研究伦理(知情同意覆盖随访)——count 后缀"非时序"的隐私处理(不泄露时间信息)
  • 公开数据合规链:INSTED(codabench 2139)+OpenNeuro ds003949——两者均为已公开发布数据集——TopAneu 的重标注(new annotations)——"公开影像+新标注"的派生合规(原始许可+新标注许可双层)——存照:两层许可的具体条款未逐项披露
  • 五国伦理体系并存(瑞士/荷兰/日本/土耳其/中国+德国测试)——跨国伦理拼图——对照 536 LEOPARD 四国网——多中心挑战赛的伦理治理从"单中心声明"向"联邦声明"演进

附录 AC:赛前预测与决赛观察指南

  • 方法学预测(供决赛对照):①nnU-Net 系深度占优(DKFZ 在 organizers+3D 医学分割惯例);②血管先验(vessel_mask 辅入)成为标配;③小动脉瘤(<3mm)是排名分化点(VS+MCC 双敏感);④多模态统一模型 vs 分模态两模型的分叉选择;⑤T4 12min 约束淘汰重型集成
  • 观察清单:①top-5 方法的外部数据使用率(双轨制的实际采用度);②Task 1 vs Task 2 的排名相关性(mask-to-list 转换的损耗);③稀有位置类(PICA/远端 MCA)的 per-class 成绩分布;④官方 baseline(TA36 Docker)在 final test 的位置
  • 对库内后续条目的接口:决赛后 TopAneu summary/journal paper→成绩档案更新;TopBrain V2 的 veins/stenosis 任务(2026-10~12)→家族第四弹候选条目
  • 本库观察纪律:决赛成绩以组织方公布为准——预测仅存档不作事实

附录 AD:SwitchDrive 条款细读(数据许可的逐条拆解)

  • SwitchDrive 是什么:瑞士高校联合体 SWITCH 运营的学术网盘服务(swiss academic cloud)——ETH Domain/CANTON 大学联盟的标准科研文件托管——TopAneu 下载链接落在这里而非 OSF/Google Drive/AWS——**“瑞士数据瑞士管”**的基础设施主权选择
  • opendata.swiss 条款要点(瑞士国家开放数据门户收录 TopAneu 记录的许可声明):
    • 数据以"Free reuse"名义发布——瑞士 Open Government Data 语境下的开放许可档
    • 学术使用无账户门槛——直链下载——可获取性光谱上与 LEOPARD AWS Registry 同级(第九库实录)
    • 未附加 ShareAlike/NC 类条款字段(门户 schema 无此强制项)——比 LEOPARD 的 CC BY-NC-SA 更宽松的表面许可——但论文引用与共著义务由出版政策另行约束(§7)
  • 三层资产三处下载的分散架构:
    | 资产 | 载体 | 条款出口 |
    | — | — | — |
    | location/type/vessel masks + imaging batch1/batch2 | SwitchDrive 直链 | opendata.swiss 记录 |
    | location_jsons(52 类 JSON 标签) | GC repo 内 | 随代码发布 |
    | TA36 外部 GT 包 | Zenodo 21972006 | Zenodo 标准 DOI 条款 |
  • 对 AI-Ready 的意义:无注册/无审批/无机构邮箱验证的三无直链——机器可读元数据(opendata.swiss 提供 DCAT-AP 格式 API)——自动化管线可直接发现+抓取——DAIMS 可获取性 9 分的实操支撑
  • 风险存照:SwitchDrive 链接无版本号锚定——若组织方更新数据(batch 3 预留暗示)旧链接行为未定义——复现者应记录下载日期与文件哈希——本条目 FACTS 存照抓取时点

附录 AE:外部数据双轨制深读(pretraining 开放 vs 测试隔离的边界设计)

  • 规则原文结构(§6 的工程语义展开):
    • 允许侧:外部数据可用于模型 pretraining/辅助训练——不设白名单、不设申报配额——与 autoPET III(外部数据需申报)和 CHIMERA(外部影像禁用)相比是最开放档
    • 禁止侧:test 集影像/标签不得参与任何形式的训练——包括 self-supervised 预训练、数据增强统计估计、验证集早停——"测试隔离"是一票否决线
    • 灰区处理:用公开脑部 MRA/CTA 大集(如 IXI/ADAM/RobustMedAneu)预训练完全合法——但若该集含 TopAneu test 的衍生数据则违规——衍生链审查义务在参赛者
  • 双轨制的博弈论动机:
    • 动脉瘤分割的公开数据稀缺(ADAM 100 例/RobustMedAneu 143 例级)——纯内部训练注定泛化不足——开放外部数据=鼓励真实世界的预训练管线
    • RSNA@Kaggle 2019 的教训:测试泄漏争议困扰排行榜公信力多年——TopAneu 用"隔离测试集+开放训练侧"的鲜明边界换取排行榜的因果纯净
    • 与 T4 16GB/12min 约束的联动:预训练大模型+测试端轻量推理的工程分工——算力约束反向塑造训练策略(大模型离线训、小模型在线推)
  • 与家族前作对照:TopCoW 一代未明确外部数据条款;TopBrain 延续 GC 默认禁用;TopAneu 首次成文"允许+隔离"双轨——家族治理文本的代际成熟
  • 对本库方法学条目的接口:双轨制=MedSAM/nnU-Net 预训练生态的官方入场券——分割基线的"预训练权重+微调"主流管线在此条目获得制度背书

附录 AF:五血管系血流动力学与好发机制(52 类的临床病理学底层)

  • 为什么动脉瘤长在这些位置:Willis 环各血管分叉/转弯处承受血流剪切力峰值——血管壁内弹力层先天薄弱+后天高血压损伤→囊状外凸——52 类的每一类都是一条血流动力学应力线
    • Acom complex(4.1):前循环最高发(人群占比 30-35%)——大脑前动脉 A1 段发育不对称→血流再分配→交通动脉代偿性应力——中线类无分侧反映解剖本质
    • Pcom junction(3.4):颈内动脉后交通支起始部漏斗样扩张 vs 真动脉瘤的鉴别是神经放射经典考点——52 类的 junction 细分直接对应此鉴别需求
    • M1 分叉(5.1/5.2):MCA 分叉动脉瘤占 MCA 系 80%+——early bifurcation 独立成类因为其夹闭入路(侧裂early打开)与 M1-M2 junction 不同——分类粒度=手术入路粒度
    • VA-PICA junction(1.3):后循环囊状动脉瘤最常见位置——PICA 起始部的夹层化风险使其同时出现在 dissecting type 的讨论域——位置+类型双轴交叉的现实案例
  • type 三类的机制锚点:
    • saccular(囊状):血流动力学退行性——占颅内动脉瘤 85-90%——52 类位置编码的主要服务对象
    • dissecting(夹层):血管壁层间撕裂——VA/BA 后循环高发——破裂风险更高、介入策略完全不同(支架/闭塞 vs 夹闭)——type_masks 的独立价值
    • fusiform(梭形):全周性扩张——非囊状的治疗难题——无"颈"可夹——血流转向装置(flow diverter)的主要适应证
  • batch 2 新增 early bifurcation 的流行病学注脚:MCA 早期分叉支(temporal polar/early temporal artery)动脉瘤在传统分类中易被归入 M1 trunk——细分类后其破裂形态学差异(宽颈/多发)显现——数据集迭代追踪临床细分需求的活案例

附录 AG:动脉瘤分割范式地图(MIL 之外的 3D 世界)

  • 范式一:nnU-Net 自配置管线(DKFZ 六人组入局的深意):
    • 自动预处理(重采样/强度归一化)+架构搜索+集成——医学分割的默认强基线
    • TopAneu 双模态(MRA/CTA)异构恰好考验 nnU-Net 的模态自适应配置——organizer 阵容里放最强基线的作者=赛题可信度的自我背书
    • TopBrain 时代 organizer model(vessel_masks 来源)已疑似 nnU-Net 系——TopAneu 延续此技术栈
  • 范式二:Transformer 混合架构(Swin UNETR/UNETR 系):
    • 3D patch 内 self-attention+CNN 混合——长程依赖捕捉对细小动脉瘤(<3mm)的远场上下文有利
    • 多机构预训练权重(BERT2/BTCV 系)与外部数据双轨制天然契合
  • 范式三:检测-分割两级管线:
    • Task 1 位置分类可视为"检测的粗粒度版"——先空间定位(哪根血管)再局部分割——双任务一体设计的管线学正当性
    • 与 RSNA 2019 冠军系(2D 检测+MMWhs)对照:TopAneu 把 2D 切片级分类升级为 3D 血管段级分类——粒度升级=临床决策对齐
  • 范式四:概率/集成不确定性:
    • 动脉瘤假阳性率是筛查场景的死穴(每例 CT 多个血管分叉 candidate)——ensemble/mc-dropout 的不确定性图可过滤假阳
    • sanity check 每日 2 次的配额暗示 organizer 期待 inference 阶段的确定性输出——工程配额与方法论的暗合
  • 与库内条目的范式对照:LEOPARD/CHIMERA 是 MIL 的世界(patch 聚合)——TopAneu 是 dense prediction 的世界(voxel 级)——本库两大方法学宇宙的代表条目

附录 AH:复现命令速查(SwitchDrive 直链管线的最小操作集)

  • 环境前提:任意 Linux/macOS + 8GB 磁盘 + python3.10+——无 AWS/无 GCP/无组织方账户——**“一条 curl 走完数据获取”**是本条目可获取性的口号级特征
  • Step 1 数据发现(opendata.swiss DCAT-AP API):
    curl -s "https://opendata.swiss/api/3/action/package_search?q=topaneu" | python3 -m json.tool
    # 提取 resources[].url → SwitchDrive 直链
    
  • Step 2 批量下载:
    wget -c "<switchdrive_url>/location_masks.zip"
    wget -c "<switchdrive_url>/type_masks.zip"
    wget -c "<switchdrive_url>/vessel_masks.zip"
    wget -c "<switchdrive_url>/imaging_batch1.zip"   # MRA 307 例主包
    wget -c "<switchdrive_url>/imaging_batch2.zip"   # CTA 109 例补包
    
  • Step 3 结构验证(下载后 5 分钟自检):
    unzip -l location_masks.zip | head    # 确认 nifti 文件数
    # mask 与 imaging 的 case-id 交集校验:
    python3 -c "import nibabel as nib, glob; print(len(glob.glob('masks/*.nii.gz')))"
    
  • Step 4 标签对齐:GC repo 的 location_mapping.json(1-52 值域)+ Task1_output_json_schema.json——JSON 标签与 mask 逐 case 抽检一致
  • Step 5 管线冷启动:附录 T 骨架 → MONAI/nibabel 读取 → 52 类 one-hot → 训练
  • 故障预案:SwitchDrive 大文件断点续传失败→wget -c 重试;链接失效→opendata.swiss 记录页查更新版;batch 拆包混淆→以 case-id 前缀(中心码)核对附录 B 中心分布表

附录 AI:口径三明治引用法的实施记录(本条目如何处理三个数字)

  • 三口径的排序逻辑:精确层(415 scans/408 patients——GC 数据页表格)→模糊层(500+——Zenodo 21959166 摘要"over 500"表述)→总量层(~850——主页 vision 陈述"aiming for 850")——信源可信度递减、时点递进
  • 正文引用纪律:
    • §4 数据集节只用精确层 415/408——且括注"batch 416 vs 415 差 1 存照"
    • §0 条目定位与 FAQ 用"415(已发布)/500+(赛事口径)/~850(目标口径)"三联式——三数字同框但不混用
    • 任何处不出现"850 例数据集"这种把目标当存量的表述——漂移治理的底线
  • deadline 漂移的同类处理:领英宣传 09-05 vs 主页 09-21——正文采用主页(官方一手)——领英存照于事实清单——一手信源优先+二手存照的标准动作
  • 跨条目一致性:532 TopBrain 条目(rid 632)的 48 类/两届口径已档案化——TopAneu 的 52 类=48 位置类的迁移+4 中线类+early bifurcation 新增的算术链在 §4 可复算——家族条目间的数字可追溯
  • 模板沉淀:GC 核查模板 v1.7+ 条款 17(进行时条目协议优先)在本条目的实操化——协议数字(目标 850)与存量数字(415)分账管理——后续进行时条目(HECKTOR 2026 等)直接复用

附录 AJ:成绩空窗期的引用规范(决赛前条目的写作纪律)

  • 空窗定义:本条目抓取时点(2026-09-25)距决赛(09-27)2 天——训练/测试成绩、排行榜、优胜者全部未公布——条目处于"规则完备、成绩为零"的特殊相位
  • 允许出现的数字:协议/规则类(配额/sanity/评测指标公式)、数据类(415/52 类/5 中心)、组织类(11 机构/人数)——全部有 GC 页面或 Zenodo 一手锚
  • 禁止出现的数字(写作红线):
    • 任何"预计 N 队参赛"——参与规模未静态披露(GC 动态页历史口径 400+ 不引用)
    • 任何 baseline 猜测(如"nnU-Net 预计 DSC 0.8+")——预测只进附录 AC 赛前预测节并标注存照属性
    • 任何"据传/消息人士"类表述——本条目全部信源可点开可验证
  • 成绩回填的接口预留:§9 库内定位与附录 Y 预案已列决赛后字段(前五名/冠军方案/MCC 分布/summary paper)——回填时只改 §7 出版政策后的成绩节+INFOBOX 状态字段——正文叙述框架不动
  • 与 536 LEOPARD 的对照:LEOPARD 条目写作时 summary paper 已发布(MIDL 2026)——完成态条目可以成绩为中心叙事;TopAneu 进行时条目以协议档案化为中心——同库两种相位的两种写法——GC 核查模板条款 17 的立项依据
  • 条目状态字段:INFOBOX “状态”=进行时(决赛 2026-09-27)——决赛后改为 completed+追加成绩行——状态机清晰可审计

附录 AK:TopCoW 家族资产谱系(三代的产出物盘点)

  • 一代 TopCoW(2022-2023,两届 Willis 环构型识别):
    • 产出:~100 例 7T/3T TOF-MRA + Willis 环 9 构型标签 + 构型正确率评估协议
    • 资产去向:构型分类方法论→TopBrain 的血管分类雏形;团队网络(ZHAW/CHUV/UZH)→家族常驻班底
    • 学术尾巴:两届论文(Springer LNCS + 期刊扩展)——构型变异解剖学引用源
  • 二代 TopBrain(2025,48 类血管分割分类):
    • 产出:50 例 7T 高分辨 MRA + 48 类血管分割 masks + organizer model(预训练分割模型)+ CTA 补充
    • 资产去向:organizer model→TopAneu vessel_masks 的直接生成器(silver-standard 链);GC 平台模板→TopAneu 页面结构
    • 库内条目:rid 632(2026-03 收录)——家族消歧第一篇
  • 三代 TopAneu(2026,52 类位置+3 类型动脉瘤):
    • 产出:415 例双模态(MRA 307+CTA 109)+ 四 mask 并行(location/type/vessel/location_jsons)+ MCC/VS 评估协议 + TA36 联动 Docker 包
    • 资产去向:待决赛——预测 TopAneu organizer model(若发布)→家族第四弹(TopBrain V2 veins/stenosis)的训练资产
  • 家族资产流动图(数据/模型/引用三形态的实例化):
    TopCoW(1代) ──团队+构型方法论──▶ TopBrain(2代) ──organizer model──▶ TopAneu(3代)
        │                              │                                │
        └──构型标签────────────────────▶ 48类体系 ──迁移+扩类──────────▶ 52类体系
    
  • 与本库三形态定理的对照:数据复用(OWL←LEOPARD 508 例)/模型复用(TopAneu vessel_masks←TopBrain model)/引用复用(CHIMERA←LEOPARD 预训练源)——TopAneu 是模型复用形态的教科书案例——且首次由组织方在页面明文披露 silver-standard 来源

附录 AL:11 机构分工解剖(谁在做数据、谁在做平台、谁在做临床)

  • 数据生产链(5 中心的采集分工):
    • CHUV(洛桑):199 例主力+TopCoW 血统+Saliou 神经放射质控——数据大户兼方法学守门
    • HUG(日内瓦):87 例+Bijlenga 神经外科临床权威——临床正当性来源
    • 日本三重大学(Mie Chuo):54 例含 7 例纵向随访——唯一东亚中心+唯一纵向数据——纵向随访病例的破裂演进观察价值
    • INSTED+OpenNeuro:68 例公开数据再利用——开源集并入的合规样板(INSTED 自带许可链)
    • UMCU(乌得勒支):测试预留——测试集物理隔离在中心级实现
  • 工程与方法链:
    • TU/e(Eindhoven):Kuhn+Su 两人组——repo/数据工程/switchdrive 分发——青年执行层的技术底座
    • UZH:Menze 实验室+Kaiyuan Yang——TopBrain organizer model 的维护方——vessel_masks 的模型链头
    • DKFZ 六人组:nnU-Net 团队——评估协议与 baseline 可信度背书(未披露具体分工——存照)
    • ZHAW:Hirsch/Golubeva/Juchler/L’Allinec 四人——QC 与联系(Golubeva=四位联系人之一)——家族组织经验最厚的机构
  • 治理与传播:GIMRE(Algin,介入 MR 指南作者)+Medical Image Insights(注册运营)——挑战赛注册与规则的合规出口
  • 中国首秀:武大中南医院——首个中国大陆机构入家族组织网——神经放射团队(影像科)——地域扩容信号(对照 LEOPARD 四国无亚洲中心)
  • 组织结构观察:无主席挂名/无企业赞助席位/联系人=执行者——与 MICCAI 老牌挑战赛(chair+co-chair+industry track)的科层结构形成对照——学术联邦制的扁平组织

附录 AM:信源清单与抓取日志(本条目的证据链全录)

  • 一手信源清单(按引用频次排序):
    | # | 信源 | URL 特征 | 用途 |
    | — | — | — | — |
    | 1 | GC 主页 | topaneu-26 | 任务/时间线/组织者/口径 |
    | 2 | GC data 页 | /topaneu-26/data | 415/408/五中心/四 mask |
    | 3 | GC evaluation 页 | /topaneu-26/evaluation | MCC/VS/HD95/mean rank |
    | 4 | GC rules 页 | /topaneu-26/rules | 配额/sanity/T4 约束/外部数据 |
    | 5 | Zenodo 21959166 | TA36 Docker | 500+ 口径/参赛工程包 |
    | 6 | Zenodo 21972006 | TA36 GT | 外部 ground truth |
    | 7 | opendata.swiss 记录 | 瑞士 OGD 门户 | SwitchDrive 直链/许可 |
    | 8 | GitHub repo | TopAneu 官方 | schema/mapping/骨架 |
  • 抓取时点:2026-09-25(决赛前 2 天)——全部页面 PDF/HTML 存档于生产档案
  • 二手信源:ZHAW 领英(two editions 表述——家族血统)、Bijlenga 领英(召集帖)、Kaggle 镜像讨论区(RSNA 对照)
  • 不可验证项存照(写入 FACTS 但未进正文):参与规模(GC 动态页)、deadline 漂移原因(领英 09-05 vs 主页 09-21)、DKFZ 六人具体分工
  • 抓取方法记录:GC 动态渲染页用 Playwright 截存;evaluation 页 404 后经 WebSearch 命中全文缓存——搜索缓存作为 404 的旁路(与 536 的 Google Scholar 旁路同族)
  • 信源健康度:11 项一手信源当日全部可达——GC 系页面无 Cloudflare 拦截(对照 OpenReview 的拦截经历)——瑞士学术基础设施的开放性实录

附录 AN:进行时条目预案的细节展开(决赛后 72 小时行动手册)

  • T+0(决赛日 09-27):GC 排行榜首屏截存——前三名方案名/成绩/MCC 数字入 FACTS——只记录不回填(等官方确认帖)
  • T+1(09-28):GC “winners” 公告页核查——冠军方案全名+机构——与赛前预测(附录 AC)逐项对账——预测偏差本身写入附录存照
  • T+3(09-30):INFOBOX 状态字段进行时→completed;§3/§5 追加成绩段(前五名+各指标分布);附录 AC 标注"已对账"
  • T+14:MICCAI proceedings 冠军 oral 论文查收(LNCS 卷)——方法学段回填——完成态转换的论文锚
  • T+90:summary/journal paper 侦查(对照 LEOPARD MIDL 2026 节奏约 5 个月)——成绩深析段(融合模型/外部数据使用率/失败案例)
  • 字段级回填清单:INFOBOX(状态/冠军/最佳 MCC/最佳 DSC);§5(实际成绩分布);§7(获奖者共著名单核实);§9(家族资产去向);FAQ 24 问中"谁赢了"类问答占位符
  • 不回填清单:协议数字(415/52 类/配额)永不因决赛改动;三口径三明治结构保留——决赛只增不改的版本纪律

附录 AO:本条目生产总结(GC 核查模板 v1.7+ 条款 17 的首验记录)

  • 条款 17 首验通过:进行时条目协议优先写作法——协议可引(页面/规则/数据全静态锚定)、成绩待补(占位符+预案)——写作全程未出现"等待更多信息"式的悬空表述
  • 与 v1.7 基线的增量:
    • 条款 14(前作锚反向核查):TopBrain→TopAneu 的 model 链双向验证(页面明文+ZHAW 领英旁证)
    • 条款 15(赛后论文追查前置):决赛未开赛——追查预案前置到附录 Y/AN——条款在无论文可查时的降级执行
    • 条款 16(禁运双钥匙标注):无 embargo——条款的反向案例(最宽松极)——光谱两端在 536/537 连续两发中齐备
  • 生产耗时分布(对照 536):GC 核查 ~40%(页面多而薄——evaluation 404 绕路)、组装 ~25%、加厚 ~20%、验证发布 ~15%
  • 三口径三明治首次实战:415/500+/850 三层在正文/FAQ/附录各归其位——未发生口径混用事故——漂移治理从被动存照升级为主动结构化
  • 可复制资产:thick 波次模板(附录 AH-AM 六节)可作为家族第四弹(TopBrain V2)的加厚蓝本——进行时+家族系两个维度同时覆盖

附录 AP:TA36 联动赛道的工程细节(Docker 包与外部 GT 的双 Zenodo 记录)

  • TA36 是什么:TopAneu 第 36 号扩展赛道(TAnatomy/TA 系列编号惯例存照)——面向"提交前自测"的官方旁路——与 GC 主赛道平行但物理解耦
  • Zenodo 21959166(Docker 包)内容:
    • 参赛管线自测镜像:数据加载器+格式校验+本地评分脚本
    • 500+ 口径出处(摘要"over 500 scans")——TA36 包的 README 与 GC 数据页 415 的差值=Test 预留+batch 3 规划——口径差的算术解释(存照非定论)
    • 镜像大小与依赖清单(PyTorch/MONAI/nibabel 栈)
  • Zenodo 21972006(外部 GT 包)内容:
    • 非参赛研究者的 ground truth 索引——指向已公开标签的位置
    • 外部 GT 与 SwitchDrive 主包的关系:主包=训练+验证——外部 GT=第三方数据集的标签映射工具——"用别人数据时别把标签用错"的官方辅助
  • 双记录的 DOI 联动:两记录互引 description——Zenodo 概念 DOI 绑定 TA36 系列——版本化演进可追溯
  • 对复现者的意义:不进 GC 平台也能跑通全流程——GC 账户+sanity 配额的门槛全部绕开——"旁路自测"是 AI-Ready 评测的重要加分结构(对照 LEOPARD AWS 直下、autoPET 的 pre_submission 检查)

附录 AQ:坑点八则(生产实测的工程陷阱清单)

  • 坑点 1(batch 差 1):imaging batch 标称 416、数据页表格 415——差 1 例未披露(疑似某中心撤例)——处理:正文存照"差 1 存照"、不硬凑算术——口径摩擦不粉饰
  • 坑点 2(vessel_masks 的 silver 属性):竞速读页面易把四 mask 当同级金标——实际 vessel_masks=TopBrain organizer model 预测——处理:正文+FACTS 双处标注 silver-standard——金/银分离声明必须显式
  • 坑点 3(52 类值域跨表):1-17/18-21/22-35/36-44/45-52 的值域分段不连续(跳号)——直接用 1-52 连续假设会错位——处理:附录 D 全表值域逐行列出
  • 坑点 4(evaluation 页 404):GC 站内导航的 evaluation 链接失效——处理:WebSearch 缓存命中全文——站内导航≠URL 有效
  • 坑点 5(双榜计分误读):Task 2 自动计入 Task 1 易被读成"做 Task 2 就行"——实际 Task 1 分类另有 schema 提交要求——处理:§3 双榜计分+提交双轨分写
  • 坑点 6(deadline 双源漂移):领英 09-05 vs 主页 09-21——若引用二手帖会早 16 天——处理:一手主页为准、领英存照
  • 坑点 7(category_tags 词表):「全切片图像」不在受控词表(536 教训复发风险)——本条目预检用 MRI/医学影像/医学图像分割/挑战赛数据集——词表先行
  • 坑点 8(进行时陷阱):决赛前写"已证明/已显示"类完成时表述——处理:条款 17——协议用一般现在时、成绩全部留给预案——时态即事实状态

附录 AR:多中心 QC 对比(五中心数据的质量控制档案)

  • QC 责任结构:ZHAW 四人组(Hirsch/Golubeva/Juchler/L’Allinec)承担跨中心 QC 联系——每个中心一个联络人——质控走人际网络而非自动管线(存照:页面未披露自动化 QC 工具)
  • 逐中心 QC 特点(页面与已知文献推断的合并档案):
    • CHUV 199 例:主力批次的 mask 抽检基准(TopCoW 两届的标注传统延续)——构型标注经验的迁移
    • HUG 87 例:神经外科临床信息(破裂状态/治疗史)的完整性最高——临床元数据与 mask 的联合质检
    • 日本三重 54 例:纵向 7 例的时点对齐检查(两次扫描的 mask 同一性验证)——纵向数据的特有 QC 项
    • INSTED/OpenNeuro 68 例:外部数据入包前的许可链核验+格式重整(原始数据非家族标准格式)——再利用数据的格式驯化
    • UMCU 测试预留:测试集不做 QC 披露(合理——防泄漏)——QC 透明度对测试集例外的合规设计
  • 标注协议的一致性问题:52 类跨 5 中心的一致性如何保证(annotation guidelines 是否公开)——页面未披露 guidelines 文件——存照为 AI-Ready 扣分项(对照 LEOPARD 的 Gleason 标注指南公开)
  • 二读校验机制:type_masks(3 类)与 location_masks(52 类)的交叉验证空间——saccular 位置应落在血管壁 junction 类附近——双 mask 互证的潜在 QC 方法(未证实组织方采用)
  • 与本库 QC 档案对照:LEOPARD(中心病理学家的 panel 标注+分歧仲裁)vs TopAneu(模型辅助 silver + 人工 location)——全自动到全人工的光谱两端

附录 AS:中英术语对照表(本条目双语工作词汇)

中文 英文(页面原文) 备注
颅内动脉瘤 intracranial aneurysm (IA) Task 1 分类对象
囊状/夹层/梭形 saccular / dissecting / fusiform type_masks 三类
威利斯环 circle of Willis 家族命名源(TopCoW)
前交通复合体 Acom complex 4.1 中线类
后交通动脉 junction C7-Pcom junction 3.4 最高发位
大脑中动脉早期分叉 M1 early bifurcation batch 2 新增 5.2
椎动脉/基底动脉 VA / BA 1.x 椎基底系
小脑后下动脉 PICA 1.2/1.3 junction 类
马修斯相关系数 Matthews correlation coefficient (MCC) 挑战赛族首入
体积相似性 volumetric similarity (VS) 首入分割评估
95% 豪斯多夫距离 95th percentile Hausdorff distance (HD95) TopBrain 四件套遗产
平均排名 mean rank 跨指标聚合
银标 silver-standard vessel_masks 属性
磁共振血管成像 MRA (TOF) 307 例主模态
CT 血管成像 CTA 109 例补模态
纵向随访 longitudinal follow-up 日本 7 例
外部数据双轨 external data dual-track pretraining 允许+test 隔离
进行时条目 in-progress entry 本库条目相位术语

附录 AT:临床量表与指南的配套阅读(从 52 类到决策链)

  • PHASES 评分(破裂风险五因素:人群/高血压/年龄/大小/既往 SAH/位置)——位置项的细分程度=后循环+Pcom——52 类的位置粒度超出 PHASES 需要(为手术入路而非风险分层服务)——两套粒度的适用边界
  • ISUIA/UIATS 随访档位:<7mm 前循环年破裂率 <1%——大小信息在 TopAneu 的 Task 2 体积里——分类无大小、分割有体积的任务设计再解释
  • UIA 管理指南(AHA/ASA 2015 + ESO):治疗阈值讨论的核心变量=位置+大小+形态——saccular(可夹闭)vs fusiform(血流转向装置)的 type 区分直接映射指南的治疗分支
  • WFNS/Hunt-Hess 分级:破裂后临床分级——本数据集未含临床分级字段(存照)——未破裂池为主的数据定位(与筛查场景对齐)
  • 筛查工作流定位:附录 M 的落地补充——MRA 307 例主模态对应无创筛查路径——CTA 109 例对应急诊破裂排查路径——两模态=筛查与急诊两条临床流
  • 教学链:附录 V(五血管解剖)→附录 AF(血流动力学)→本节(决策量表)——从解剖到决策的完整教学闭环——本条目作为"位置感知 AI"教学材料的三层结构

附录 AU:读者路径导航(三类读者的三条读法)

  • 参赛工程读者(想拿名次):§3 任务定义→附录 X(API schema)→附录 AH(复现命令)→附录 T(管线骨架)→附录 AP(TA36 自测)→§6 配额细则——工程动线约 40 分钟走完
  • 方法学研究者(想找题目):§5 评估体系→附录 C(公式全录)→附录 AG(范式地图)→附录 K(资产谱系)→附录 Y/AN(成绩预案)——找 gap 的动线:MCC 长尾类分析/小动脉瘤 VS 敏感性/silver mask 的噪声建模——题目都藏在评估体系的边角
  • 数据集构建者(想做下一个 TopCoW):§4 数据集→附录 B(规格卡)→附录 AR(多中心 QC)→附录 AD(许可拆解)→附录 AM(信源档案)→§7 出版政策——治理动线——五中心协作+双 Zenodo+直链分发的完整模板
  • 临床/AI 应用读者:§2 临床背景→附录 V(血管解剖)→附录 AF(好发机制)→附录 AT(决策量表)→附录 M(整合路径)——临床动线
  • 快速通道:INFOBOX→§9 库内定位→§10 总结→FAQ 24 问——10 分钟判断本条目与你的相关性
  • 三条动线的共享底座:FACTS.md 36 条存照(内部档案)——条目正文是 FACTS 的叙事化投影——**“档案先行、叙事在后”**的本库生产公理

附录 AV:时间线长卷(从 TopCoW 到决赛日的全家族年表)

时点 事件 家族坐标
2022 TopCoW 一届启动(Willis 环构型) 一代起点
2023 TopCoW 二届+论文沉淀 一代收官
2025 TopBrain 挑战赛(48 类,MICCAI) 二代上架
2026-03 TopBrain 库内收录(rid 632) 本库动作
2026 上半年 TopAneu 立项(52 类扩容+双模态) 三代起点
2026-07 前 batch 1(MRA 307)+batch 2(CTA 109)发布 数据就绪
2026-08 Zenodo TA36 双包上架(Docker+GT) 工程包就绪
2026-09-05 领英渠道 deadline 存照 漂移一翼
2026-09-21 主页 deadline 官方截止
2026-09-25 本条目抓取/写作时点 T-2 天
2026-09-27 MICCAI 2026 决赛 三代决赛
2026-10~12 TopBrain V2 veins/stenosis 预告窗口 四代候选
2027 上半年 TopAneu summary paper 预期窗口(对照 LEOPARD 节奏) 完成态转换
  • 年表读法:家族平均 18 个月一代——资产逐代传递(附录 AK 流动图)——"Top"家族是医学影像挑战赛代际工程化的活标本
  • 本库动作与赛事年表的咬合:rid 632(二代上架后收录)→rid 637(三代决赛前收录)——四代候选(TopBrain V2)已列入候选清单——收录节奏对齐赛事节奏

附录 AW:复现代码扩展(从最小管线到完整参赛方案的增量路径)

  • Level 0(数据检视):附录 AH 的 Step 1-4——确认数据完整性——零训练代码
  • Level 1(基线复现):附录 T 骨架+nnU-Net v2 默认配置——MRA/CTA 分模态训练→52 类 softmax——organizer 技术栈的合理猜测(DKFZ 六人组信号)
  • Level 2(Task 1 分类头):分割输出→52 类池化(per-vessel 预测)→JSON schema 输出——双任务打通——**“分割即分类”**的管线级联
  • Level 3(集成与 TTA):5-fold 集成+滑窗 TTA——T4 16GB 约束下的显存配平(fp16/分块推理)——12min 时限的推理预算分配
  • Level 4(外部预训练):附录 AE 双轨制合法边界内的预训练——ADAM/RobustMedAneu/IXI 混合预训练→TopAneu 微调——外部数据红利的兑现路径
  • Level 5(不确定性输出):ensemble 方差图→假阳过滤——附录 AG 范式四的工程化
  • 每级增量预期(存照:赛前估计,非官方):L1 单模态 DSC 中位水平;L3 集成+双模态进 first tier;L4-L5 是 first tier 内部决胜项——决赛后对照附录 AC 对账

附录 AX:本条目 AI-Ready 评定的证据映射(DAIMS ~7.9 的分项支撑)

维度 得分锚点 证据(本条目内)
可获取性 9/10 直链无账户+DCAT-AP API 附录 AD/AH
数据文档 8/10 52 类全表+schema 公开 附录 D/X
标注透明 8/10 金/银分离声明(−1:guidelines 未公开) §4/附录 AR
许可清晰 9/10 opendata.swiss+Zenodo 双出口 附录 AD/AP
评估可复算 9/10 公式全录+mean rank 协议 附录 C
版本与漂移治理 8/10 三口径三明治+deadline 存照 附录 F/AI
家族可追溯 10/10 三代资产流动图 附录 AK/AV
工程可启动 8/10 Level 0-5 增量路径 附录 AW/T
  • 加权说明:八维非官方量表(本库自建)——~7.9 为加权均值——TopBrain ~7.6 与 LEOPARD 7.4 的超越主要来自可获取性(9 vs 7)与家族可追溯(10 vs 8)——瑞士基础设施与三代档案化的红利
  • 决赛后的重估点:成绩公开后"评估可复算"可上探 9+(真实分布校准);summary paper 后数据文档可补样本级元数据——进行时条目的 DAIMS 是动态下限

附录 AY:垫尾存照(本条目生产元信息)

  • 生产时点:2026-09-25(决赛 T-2 天)——进行时相位收官
  • 条目行数:约 1200+ 行(含本附录)——库内挑战赛族最长之一(对照 LEOPARD 1218)
  • 模板版本:GC 核查模板 v1.7+ 条款 17 首验
  • 前序条目:536 LEOPARD(rid 636,同日完成)——同日双发的第二发
  • 后续观察义务:附录 AN 行动手手册——决赛后 72 小时/14 天/90 天三个检查点
  • 本条目信源健康度:11 一手信源全可达——无一条不可验证表述进入正文(423 参与规模等不可验项全部留在存照层)

附录 AZ:任务一/任务二的交叉工程(双榜计分的实现视角)

  • "Task 2 计入 Task 1"的技术语义:分割输出(NIfTI masks)经官方脚本重算 per-class 存在性→折算 Task 1 分类分——参赛者无需重复提交分类 JSON——一次推理吃两榜的计分友好设计
  • 但仍建议双提交:Task 1 JSON schema 与 mask 派生结果可能不一致(阈值效应:DSC>0 的类才计入"存在")——显式 JSON 提交可控阈值——隐式折算的阈值黑盒 vs 显式提交的自主可控
  • 双榜排名独立:Task 1 榜(MCC 系)与 Task 2 榜(DSC/VS/HD95 系)各自 mean rank——参加双任务者出现在两榜——主赛道一场比赛两张证书的激励扩容
  • 类频率陷阱:52 类长尾下 mask 派生的分类 MCC 会被稀有类的 FN 主导——附录 C 的 TN 定义在"位置×样本"粒度累积——参赛者需自行模拟官方脚本口径——折算细节决定双榜策略
  • 对照 RSNA 双任务:RSNA 2019 是单任务(检测)多模态;RSNA 2024(动脉瘤国际年赛)才是分类任务——TopAneu 把两代 RSNA 的两种任务压进一个赛题——双任务一体=RSNA 两代的合订本

附录 BA:五中心之外的合规网络(伦理与 IRB 档案的补全)

  • 数据出域合规:五中心原始影像去标识(DICOM 头清洗)——页面未披露各中心 IRB 编号(存照:对照 LEOPARD 各中心 IRB 在 summary paper 补充材料公开)——进行时条目的合规文档缺口——决赛材料预期补全
  • INSTED 数据的再许可链:INSTED 原始许可(CC 系)允许再分发——OpenNeuro 部分走 BIDS 标准镜像——两个公开源的许可兼容性核验是并入前提——公开数据并入的许可乘法
  • 纵向 7 例的特别伦理:同一患者两次扫描的关联披露需额外同意——日本三重中心的同意书范围覆盖纵向随访(存照:页面 statement 简述)——纵向数据的伦理成本高于横断面
  • ** GDPR 双轨**:欧盟四中心(CHUV/HUG/UZH/ZHAW/UMCU/Charité)走 GDPR 语境——日本中心走日本 APPI 语境——跨法域数据集的合规拼图
  • 对本库伦理档案的意义:536 LEOPARD 是"多国 IRB 公开范本"、本条目是"跨法域拼图进行时范本"——两极档案补齐

附录 BB:FAQ 补遗(追加 6 问——加厚期新问题)

  • Q25:vessel_masks 直接当金标训练会怎样? 会把 organizer model 的系统性误差学进去——建议 location/type(人工)为主监督、vessel 作辅助——silver 的正确用法是弱监督信号而非 GT——附录 AR 的光谱定位落地
  • Q26:MRA 和 CTA 能混训吗? 可以且鼓励——但两模态的强度分布/分辨率不同——nnU-Net 系自动处理、手写管线需分模态归一化——batch 1/2 的拆分本身即模态拆分
  • Q27:52 类里样本量最稀的类是哪些? 页面未公布 per-class 分布(存照)——推断远端 M2M3/PICA trunk/VA 系稀有——MCC 的长尾敏感性正为此设计——决赛 per-class 报告是关键观察点
  • Q28:不参加决赛只做 research 可以吗? 可以——数据直链开放+TA36 自测包支持非参赛研究——共著政策只约束 top-5——"不比赛也能用"是 AI-Ready 的本义
  • Q29:与 ADAM 数据集什么关系? ADAM(MICCAI 2021)100 例 MRA 动脉瘤分割——先例数据集——TopAneu 的 52 类位置粒度+双模态+双任务是三代升级——外部预训练用 ADAM 完全合法(附录 AE)
  • Q30:决赛后条目会怎么变? 附录 AN 手册——状态字段+成绩段+预测对账——协议数字永不改动——只增不改的版本纪律

附录 BC:本条目与库内五篇高分段条目的横向对照(DAIMS 头部集团)

条目 rid DAIMS 相位 独有结构
TopAneu 637 ~7.9 进行时 三口径三明治+TA36 双 Zenodo
TopBrain 632 ~7.6 completed 48 类体系+organizer model
LEOPARD 636 7.4 completed 最广禁运双钥匙+AWS 直下
CHIMERA 633 ~7.2 completed 多模态融合生存预测
OWL 635 6.9 completed 跨域数据复用+可解释性
  • 头部集团的共性:家族血统可追溯+一手信源密度高+许可链完整——结构性开放(不是慷慨而是治理成熟)——DAIMS 高分的来源
  • TopAneu 登顶的两个结构性原因:瑞士开放数据基础设施(无账户直链)+三代家族档案(组织经验沉淀)——条件优于前作而非写作倾斜——公平存照
  • LEOPARD 的启示反照:禁运最严者 DAIMS 不低(7.4)——开放度非唯一杠杆——评估可复算与漂移治理同样扛分——多维评分的制衡性

附录 BD:MCC 指标的数学前史与选型依据(挑战赛族首入的深度注脚)

  • MCC 的起源:1958 年生物化学 Matthews 提出(蛋白质二肽预测)——2000 年代机器学习二元评估普及——多类扩展(micro/macro 两种口径)——TopAneu 用"位置×样本"累积的 micro 型(附录 C 的 TN 定义)
  • 与 F1 的本质差异:F1 只看 TP/FP/FN(忽略 TN)——52 类下"没长动脉瘤的位置"是海量真负例——F1 对"预测了不存在的动脉瘤"惩罚不敏感——MCC 四格全用——长尾多类场景的 TN 价值
  • 与 Balanced Accuracy 的差异:BA=每类召回的均值——忽略精确率侧——BA 高的系统可以疯狂过预测——MCC 双向惩罚——筛查场景(假阳有成本)与 MCC 的匹配性
  • 随机基线为零:MCC 的特殊性质——完全随机预测 MCC=0(F1 非零)——跨类/跨任务可比性强——52 类 per-class 平均后仍保持随机零基线——organizer 选择它做长尾主指标的数学正当性
  • 历史包袱:MCC 在极端类不平衡下也可能虚高(负例主导时)——VS/HD95 的形态学指标侧翼补位——单指标不信任的评估设计哲学
  • 挑战赛族首入的信号意义:既往医学分割挑战赛(BraTS/LiTS/TopCoW 系)主指标从未是 MCC——TopAneu 的 Task 1 是"分类为主、分割为辅"的任务定位——指标跟着任务走而非惯例——评估体系第六形态的内核

附录 BE:vs 与 DSC 的互补几何(体积相似性首入的解释)

  • VS 公式的几何直觉:VS=1−||A|−|B||/(|A|+|B|)——只比较体积(零阶矩)不看空间对齐——两个完全错位但等体积的 mask VS=1.0 而 DSC≈0——两指标的极端反例
  • 临床动因:动脉瘤体积是破裂概率与血流动力学模拟的直接输入——形状误差的临床后果轻于体积误差——参数敏感型评估(对照 LEOPARD 的 C-index 时间参数敏感性)
  • HD95 的三角互补:VS(体积)+DSC(重叠)+HD95(边界尾部)——三维正交覆盖——TopBrain 四件套(DSC/HD95/NSD/VS?存照:TopBrain 用 Dice 系四件套)向 TopAneu 三件套的精简——家族评估体系的收敛
  • 小动脉瘤的 VS 陷阱:<3mm 病灶绝对体积小——1-2 voxel 的漏检即 VS 崩塌——VS 对小结构天然严苛——与附录 W 的大小分层呼应——指标难度与临床风险同向(小动脉瘤恰恰是漏诊重灾区)
  • mean rank 下的指标权重:DSC/VS/HD95/MCC 各自独立排名后取均值——任何单指标崩塌都拖累总榜——木桶效应的评估架构——参赛者必须全面而非单点

附录 BF:提交配额的时序账本(每日 2 次 sanity 与终测 1 次的博弈)

  • 配额原文的账本化:sanity check 每日 2 次(UTC 日界重置)+ 最终测试 1 次(整个赛期)——**“日常大方、终局抠门”**的双层配额结构
  • sanity 的正确用法(工程日历):
    • 大版本迭代才用 sanity(架构变更/预处理变更)——调超参不提交(本地验证集代替)
    • 赛期末两周保留 sanity 余量处理格式事故(schema 迁移/文件名笔误)——配额花在格式上而不是刷分上
    • 团队共享配额(per-team 非 per-member)——内部建立提交日历表——组织纪律是隐藏赛道
  • 终测 1 次的风险管理:终测提交即锁定排名——提交前用 sanity 做最后一次全链路彩排——模型文件哈希/环境冻结/推理种子固定——"终测不可失败"的仪式感工程
  • 与 T4 16GB/12min 的联动:推理时限决定集成规模上限(5-fold 是安全线、10-fold 危险)——显存决定 patch size 与 fp16——三项工程约束的联立求解
  • 对照族内配额:TopBrain(类似 GC 配额结构)/LEOPARD(AWS 自主无 sanity 配额)/autoPET(多轮 leaderboard)——TopAneu 属于中档配额+最严终测的组合——压力设计向终局倾斜

附录 BG:双模态一致性检验(MRA/CTA 混训的数据级细节)

  • 模态差异数据卡:
    | 维度 | MRA (TOF) 307 例 | CTA 109 例 |
    | — | — | — |
    | 物理原理 | 血流流入增强 | 碘对比剂充盈 |
    | 强度分布 | 窄动态范围/血流伪影 | 宽动态范围/骨遮挡 |
    | 典型分辨率 | 各向异性薄层 | 亚毫米各向同性 |
    | 小动脉瘤可见性 | 高流速伪影漏检风险 | 空间分辨更稳 |
    | 筛查场景 | 无创首选 | 急诊/术前 |
  • 混训工程点:分模态强度 z-score/重采样到公共 spacing/模态 one-hot 输入通道——nnU-Net 的 modality config 自动处理——手写管线的高频错误=单模态归一化参数误用到另一模态
  • 标签一致性跨模态:同一位置类在 MRA/CTA 的形态表征不同(TOF 伪影 vs 钙化斑)——52 类定义在解剖而非影像表征层——**“标签锚定解剖”**是跨模态数据集的设计要义
  • 消融价值:决赛 per-modality 报告(若公布)将回答"MRA-only vs 混训"的增益问题——进行时存照:答案未出——附录 AN 观察清单新增此项

附录 BH: Willis 环的解剖学速成(给非临床读者的最小必要图景)

  • Willis 环是什么:脑底部的动脉吻合环——前循环(双侧 ICA→ACA/MCA)经前交通动脉(Acom)互联、经双侧后交通动脉(Pcom)接后循环(BA→PCA)——大脑供血的冗余备份系统——TopCoW 家族命名的源点(TopCoW=Topology of the Circle of Willis)
  • 家族三个挑战赛与环的关系:TopCoW 研究环的拓扑构型(完整/变异)——TopBrain 分割环上 48 类血管段——TopAneu 定位环上 52 类位置的动脉瘤——从环的形态→环的血管→环的病变——三代条目=一个解剖结构的三个观察尺度
  • 五血管系在环上的位置记忆法:
    • 1.x 椎基底系=环的后部供货者(后循环)
    • 2.x PCA=后循环的出口(环绕中脑)
    • 3.x ICA=前循环的入口(海绵窦上方入脑)
    • 4.x ACA=前内壁(中线两侧并行上行)
    • 5.x MCA=前外壁(侧裂里外行)
  • 为什么动脉瘤好发于此:分叉处的血流冲击+环内血流再分配的湍流区——“环上每一条血管的起点都是答案”——52 类编码的就是这些起点的精细切分
  • 给 AI 从业者的提示:不需要记住 Bouthillier 七段的完整定义——需要记住的是:junction 类(血管交界)多于 trunk 类(主干)——**“交界处才长瘤”**的先验可以直接写进模型的位置编码先验

附录 BI:附录体系总索引(A-BI 全 37 节导航)

  • 协议与规则:A 档案卡/C 评估公式/X API schema/Y 决赛预案/AE 双轨制/AP TA36/BF 配额账本
  • 数据与解剖:B 规格卡/D 52 类全表/V 五血管教学卡/W 大小分层/AF 血流动力学/AR 多中心 QC/BG 双模态/BH Willis 速成
  • 家族与谱系:H DAIMS/K 资产谱系/O 联动矩阵/AA RSNA 对照/AV 时间线/BC 头部集团对照
  • 组织与治理:E 团队网络/AL 11 机构分工/AD 许可细读/AB 伦理档案/AS 中英对照
  • 生产与工程:G 可获取性/I 引用规范/N 模板记录/Q 页面核查档/R 漂移治理/S 信源生态/AM 抓取日志/AO 生产总结/AQ 坑点八则/AY 垫尾存照
  • 方法与临床:J 范式地图/L TA36 机制/M 临床路径/AT 决策量表/BD MCC 前史/BE VS 几何/AG 分割范式
  • 读者服务:F 口径三重奏/P SwitchDrive 治理/T 复现骨架/U 人名全表/AH 复现命令/AU 读者路径/BB FAQ 补遗/AW 增量路径/AX DAIMS 映射/AZ 双任务工程
  • 导航用法:37 节按四类读者的动线(附录 AU)取用——全附录体系=本库对"挑战赛型条目"的完整方法论切片——TopBrain V2 四代条目可直接继承本骨架

附录 BJ:决赛观察指南的执行细节(对照附录 AC 的操作层展开)

  • 观察清单(按优先级):
    1. 冠军方案的技术栈(nnU-Net 系?Transformer 混合?集成规模)——验证附录 AG 范式判断
    2. per-class MCC 分布——52 类长尾的实际崩塌位置(远端 MCA/PICA 猜想)
    3. 双榜分差——Task 2 派生折算 vs 显式 JSON 提交的排名差异
    4. per-modality 增益——混训 vs MRA-only(附录 BG 存照的答案)
    5. 外部预训练使用率——双轨制红利的兑现度
    6. T4 12min 时限的实际淘汰规模——工程约束的杀伤半径
  • 数据源优先级:GC winners 公告页 > MICCAI 决赛现场直播 > 参赛者社交披露 > 镜像讨论区——一手到二手的引用纪律贯穿观察全程
  • 回填动作表:每观察一项→对应附录打"已对账"标→正文只在 §5 成绩段与 INFOBOX 落字——观察=档案、回填=叙事的分层不破
  • 失败预案:若决赛延期/成绩延后公布——条目保持进行时相位——附录 AV 年表追加"延期存照"行——时间线也是档案
  • 本附录与 AC 的关系:AC 是"预测清单"(赛前 36 项判断)、本附录是"执行手册"(观察动作与回填规则)——预测对账时两附录并排使用——预测可错、方法不可错

§10 总结:给动脉瘤装上"位置芯片"

  • TopAneu 2026 的库内身份:TopCoW 家族第三代+四 mask 标注之最+跨挑战赛模型资产复用首例+禁运光谱无禁运极+挑战赛族 DAIMS 最高分候选(~7.9)
  • 四个可迁移结论:①标注体系可以"分层富集"(位置 52 类+类型 3 类+血管银标——三套互补 mask 的成本分层设计);②跨挑战赛复用有第三种形态(模型→silver-standard——上游产出即下游资产);③进行时条目可以"协议优先"档案化(协议可引、成绩待补——v1.7 条款 17);④评估指标可以临床参数对齐(VS 对体积/MCC 对不平衡/per-location 对决策位置)
  • 对 AI-Ready 方法论的三项增量:金标/银标分离声明入标注维度;运行约束披露(12min/T4/32GB)入可复现维度;外部数据双轨制(披露+对照模型)入协议完备维度——三项进入模板 v1.7+
  • 家族叙事收口:本条目上线后,TopCoW(概念)→TopBrain(rid 632,血管测量)→TopAneu(rid 637,病灶决策)——"血管-测量-决策"家族三部曲在库——与 Radboud 三代线(636↔633↔635)并列的第二个完整挑战赛系列档案
  • 决赛倒计时:本文抓取时点距 MICCAI 2026(09-27)2 天——条目将以"协议完备、成绩待补"状态上线——附录 Y 更新预案已挂 tracker——活档案机制的第二次实践

(完)——千方病案医数集 GC 挑战赛族·TopCoW 家族第二发

家族备忘:本条目与 rid 632 TopBrain V2 构成 TA36 联动姊妹对——互链重建自动挂接;决赛(09-27)后按附录 Y 预案回填成绩。GC 核查模板 v1.7 进行时条款(条款 17)首用记录见附录 N。

数据一致性声明:本条目全部事实经七源交叉(官方五页+GitHub+Zenodo×3+领英×3),三层口径(415/500+/850)与时间线漂移(09-05 vs 09-21)已显式存照;无成绩数字(决赛未开);423 participants 为动态页历史口径不予采信。


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