急性下背痛发作期性别差异的血清蛋白质组分析

数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/sha256%3A1dd447057aa88c8d61a16a3efedb6dc69e5ed7c154b5248236f994b95a65f300

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

越来越多的证据表明，疼痛和损伤所涉及的生物学过程与系统超出了神经系统的范畴。驱动急性向慢性下背痛（LBP）转变的分子过程仍知之甚少。在此，我们探索了男性和女性参与者在急性LBP发作期间（N=59）的血清蛋白质组谱。我们比较了急性LBP阶段中，三个月时LBP已缓解的参与者与三个月时患有慢性或复发性LBP的参与者之间的差异蛋白表达。使用质谱法进行的全蛋白质组分析确认了216种蛋白质。通过观察倍数变化，蛋白质丰度变化中的性别差异显而易见。多变量数据分析确定了急性发作期间的21种血清蛋白，这些蛋白正确分类了93%的男性，以及23种血清蛋白正确分类了90%在三个月时仍有持续LBP的女性。急性LBP期间大多数差异表达的蛋白质为……样本制备：在基线评估时，通过肘正中静脉穿刺将外周静脉血抽取至血清管（BD，SST II Advance）中。

样本在室温下凝固30分钟后，通过离心（2500 rpm，15分钟）分离。将样本分装为50 μL等份，并立即储存于-80°C。解冻后，所有59名参与者的去标识化血清通过以下方法制备：将3 μL血清（57 μg μL⁻¹ ± 7 μg）在50 μL含50 mM AMBIC、2 M尿素、10 mM DTT的pH 8溶液中，于25°C下使用胰蛋白酶以1：100的酶与蛋白比例消化16小时。通过酸化终止消化。血清肽段根据制造商方案（PolyLC Inc，美国马里兰州）采用疏水相互作用色谱（HILIC）进行分级分离，附加参数为递减溶剂以逐步释放亲水性递增的肽段。制备了五个溶剂递减的级分（未结合级分、25%、50%、70%和100%的序列溶剂萃取

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。