PRJDB18956：与生马肉相关的产志贺毒素大肠杆菌O26全基因组测序

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PRJDB18956：与生马肉相关的产志贺毒素大肠杆菌O26全基因组测序

PRJDB18956 是一项针对产志贺毒素大肠杆菌 O26 的全基因组测序数据集，该菌株与一起因食用生马肉引发的食物中毒病例相关。数据集收录了来自该病例患者、致病马肉以及相关多位点可变数目串联重复分析（MLVA）型的分离株，通过全基因组测序分析对此次食源性疾病事件中的菌株进行解析。数据集以基因组测序为主题标签，在分类上归入损伤、中毒及外因下的其他类别，来源为 NCBI 站点。整体而言，该数据集围绕单一食物中毒事件，将临床分离株与食品分离株及相关分子分型信息汇集在一起，为追溯致病来源和比较菌株关系提供了基因组层面的数据基础。

【数据集背景】

该数据集对应的背景是一起由食用生马肉引起的食物中毒病例。产志贺毒素大肠杆菌 O26 是此次事件中涉及的致病菌。为分析该病例相关菌株的特征及其与致病马肉之间的关系，研究者开展了全基因组测序分析。数据集即在这一事件背景下产生，聚焦于病例患者来源的分离株、 causative 马肉来源的分离株以及相关的 MLVA 型别，用于支撑对本次食物中毒事件的分子层面认识。

【数据内容】

数据集的内容为产志贺毒素大肠杆菌 O26 的全基因组测序数据，涵盖的分离株来源包括该病例的患者以及致病的马肉。此外，数据集还包含相关的多位点可变数目串联重复分析（MLVA）型信息。主题标签为 Genome sequencing，表明数据以基因组测序为核心。关于测序平台、文库构建方式、数据量、组装质量等具体技术参数，源站未提供。

【采集与来源】

数据来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。分离株采集自一起因食用生马肉导致食物中毒的病例，包括患者分离株与致病马肉分离株。源站描述表明，该数据集用于对此次事件相关的产志贺毒素大肠杆菌 O26 进行全基因组测序分析，并结合 MLVA 分型对相关菌株进行刻画。关于采样时间、地点、样本数量及具体采集流程，源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于食源性疾病暴发事件的分子溯源与菌株比较研究，可用于分析患者分离株与致病马肉分离株之间的基因组关系，并结合 MLVA 型别信息辅助判断菌株关联性。同时，也可作为产志贺毒素大肠杆菌 O26 全基因组测序数据的参考，用于相关血清型菌株的基因组特征研究。关于具体的分析流程、比对参考基因组及验证结论，源站未提供。

【使用方法】

使用者可依据数据集中的全基因组测序数据对患者与马肉来源的分离株进行基因组比较，并结合所附的 MLVA 型别信息开展分型层面的对照分析。关于数据下载方式、文件格式、组装与注释流程等操作细节，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集围绕单一食物中毒事件构建，样本来源限于该病例患者与致病马肉及相关 MLVA 型别。关于数据质量评估指标、测序深度、覆盖度及完整性等信息，源站未提供。使用时应结合事件背景理解数据的适用范围，不宜将其外推为更广泛人群或食品的流行病学代表。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式与许可条款，源站未提供。