GSE63107：巨大戟醇甲基丁烯酸酯在未受累皮肤与光化性角化病皮肤中诱导强烈炎症与伤口愈合反应

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE63107

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

我们研究了光化性角化病(AK)皮肤与未经治疗(US)的匹配样本在ingenol mebutate凝胶治疗前后的转录组谱。我们发现AK具有独特的mRNA谱，可将其与未受累皮肤区分开来。特别是，许多与表皮发育和角质形成细胞分化相关的基因，如LCE3D、SPRR1A、PI3以及角蛋白家族中的若干基因，在AK0皮肤中高表达，而在US0中不表达，这与AK的角化过度特征相符。局部应用ingenol mebutate对基因表达谱产生了深远影响，有趣的是，US中受影响的基因远多于AK。富集分析显示，US和AK对ingenol mebutate治疗的主要反应均为炎症反应、对创伤的反应以及伤口愈合。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。