健康小鼠主动脉中膜血管平滑肌细胞单细胞RNA测序数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE194173

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

血管平滑肌细胞（VSMC）亚群与血管疾病及损伤修复相关，已在健康血管和动脉粥样硬化特征中被描述。然而，与血管稳态相关的VSMC亚群是否存在于健康动脉中，以及它们在血管重塑中的性质和命运如何，仍不清楚。在此，我们利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）以无偏倚的方式检测VSMC的功能异质性，结果表明健康动脉中的VSMC亚群呈现转录组多样性，且各亚群内分化状态和发育存在显著异质性。值得注意的是，我们检测到一个独立的VSMC亚群，其高表达G蛋白信号调节因子5（Rgs5），与一般亚群相比上调了与抑制细胞增殖和细胞骨架构建相关的基因，且主要富集于降主动脉。此外，在新内膜形成、腹主动脉瘤和动脉粥样硬化的血管组织中，Rgs5+ VSMC的比例显著降低或几乎消失。

对Rgs5+ VSMC亚群的特定时空特征分析表明，该亚群与血管稳态相关。综上所述，我们的分析识别了健康动脉中VSMC亚群的稳态相关转录特征，这在一定程度上可能解释区域血管对动脉粥样硬化的抵抗力。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。