GSE134979：血栓性微血管病中干扰素与补体通路的激活

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE134979

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数据说明

移植相关血栓性微血管病（TA-TMA）是造血干细胞移植（HSCT）后死亡的重要原因。补体阻断是TA-TMA的有效治疗策略，但部分重症患者未能获得完全缓解，这促使人们寻找其他可靶向的内皮损伤通路。我们对HSCT前及TA-TMA发病时采集的外周血单个核细胞进行了转录组分析，观察到活动性TA-TMA期间经典补体途径和旁路补体途径显著上调。在依库珠单抗治疗后TA-TMA缓解时，几乎所有上调的基因和通路均恢复至基线表达水平，这支持了在TA-TMA缓解后成功停用补体阻断的临床实践。对全局转录调控网络的进一步分析显示，与TA-TMA相关的显著干扰素特征，伴有STAT1和STAT2信号增强。

为证实我们的观察结果，我们记录了在非移植情况下，噬血细胞性淋巴组织细胞增生症（HLH）——一种干扰素γ驱动的疾病——患儿中临床显著TMA的高发生率。我们还通过检测尿液中的CXCL9和CXCL10，在另一独立患者队列中证实了干扰素信号增强。我们的数据表明，在HLH和TA-TMA这两种不同的临床情况中，干扰素信号增强、补体激活与TMA之间存在关键关系。抗补体与抗干扰素联合治疗可能有助于控制难治性TA-TMA患者的疾病。这些数据揭示了接受治疗性干扰素的患者中TMA的发生情况，以及在其他干扰素驱动性疾病中TMA的可能性——在这些疾病中，干扰素或可成为新的治疗靶点。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。