诺卡菌感染数据集

该数据集包含异基因造血干细胞移植后诺卡菌感染的临床病例数据,涵盖患者感染时间、病原体种类、感染部位及用药情况等多模态临床表格信息,主要用于研究移植后机会性感染的流行病学特征、预防策略效果以及诺卡菌病的临床管理,为感染性疾病防控提供实证依据。

DataONE
2020-08-26 更新
浏览 38
造血干细胞移植后感染诺卡氏菌病流行病学
Nocardia Infections

基本信息

大小
0.000003802 GB
创建/更新时间
2020-08-26

资源简介

诺卡菌感染数据集

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Nocardia Infections》。

【数据内容】

源站原始描述:Nocardial infections have been rare after allogeneic hematopoietic stem cell transplantation (HSCT). We report 10 recent cases of late-onset nocardiosis (median time of onset of 508 days after transplantation) primarily in patients on high doses of corticosteroids for graft-versus-host disease. All 10 patients had pulmonary infection caused by Nocardia species susceptible to trimethoprim-sulfamethoxazole (TMP-SMX). At time of diagnosis 8 of 10 patients were not receiving TMP-SMX for prophylaxis…

【获取与许可】

源站页面:https://search.dataone.org/view/sha256:fdadbfc14096579540eba8f69cda80d3526b7b66b3b886ab76c67025d68f0385

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源站:https://search.dataone.org/view/sha256:fdadbfc14096579540eba8f69cda80d3526b7b66b3b886ab76c67025d68f0385

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集记录了异基因造血干细胞移植(HSCT)后发生的诺卡菌感染病例。数据集包含10例晚发性诺卡菌病的临床数据,主要涉及接受高剂量皮质类固醇治疗移植物抗宿主病的患者。数据内容包括患者感染时间(移植后中位时间508天)、病原体种类(均为对甲氧苄啶-磺胺甲噁唑敏感的诺卡菌)、感染部位(均为肺部感染)以及预防用药情况。数据来源于美国加州大学洛杉矶分校(UCLA)的临床观察,通过对比2000-2011年与2012-2017年两个时期的病例发生率,揭示了预防用药方案改变(从甲氧苄啶-磺胺甲噁唑改为阿托伐醌)与诺卡菌病发病率上升的关联。该数据集主要用于研究移植后机会性感染的流行病学特征、预防策略效果评估以及诺卡菌病的临床管理。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

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