结肠癌差异甲基化CpG位点数据集
该数据集包含来自TCGA结肠癌（COAD）项目的18,415个差异甲基化CpG位点的基因组学数据，数据模态为DNA甲基化芯片检测产生的表格数据，主要用于研究结肠癌中全基因组范围的DNA甲基化异常模式，探索表观遗传重编程在结肠癌发生发展中的作用机制，并为寻找潜在的生物标志物和治疗靶点提供数据支持。
创建时间2018-10-23
更新时间2018-10-23
原始链接
https://springernature.figshare.com/articles/Additional_file_6_of_The_DNMT1-associated_lincRNA_DACOR1_reprograms_genome-wide_DNA_methylation_in_colon_cancer/7238780/1
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资源简介
该数据集来源于TCGA（癌症基因组图谱）结肠腺癌（COAD）项目，包含通过HM450甲基化芯片检测获得的差异甲基化CpG位点数据。数据集具体记录了在匹配的结肠癌肿瘤组织与正常结肠组织样本之间鉴定出的差异甲基化CpG位点信息，数据以XLSX格式存储，包含18415个CpG位点的详细信息。该数据集的构建基于TCGA COAD队列的公开数据，通过比较分析肿瘤与正常组织的DNA甲基化谱而生成。其主要研究方向是探索结肠癌发生发展中的表观遗传学改变，特别是DNA甲基化重编程机制，可用于识别与结肠癌相关的甲基化生物标志物、研究基因表达调控以及开发潜在的诊断或治疗靶点。
提供机构：Saigopal Somasundaram
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