BAP1突变在基因组编辑胆管癌类器官中的功能表征：在细胞死亡和药物反应中的作用
该数据集是一个基于RNA-seq技术的转录组数据集，包含从胆管癌患者来源的基因组编辑类器官中获取的RNA测序数据，用于模拟BAP1野生型和突变型状态。数据模态为基因表达谱，主要应用于研究BAP1突变在胆管癌中的功能作用，特别是其在调控细胞死亡和影响药物反应方面的分子机制，为胆管癌的精准治疗提供转录组层面的依据。
基本信息
资源简介
BAP1突变在基因组编辑胆管癌类器官中的功能表征：在细胞死亡和药物反应中的作用
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Functional characterization of BAP1 mutations in genome edited cholangiocarcinoma organoids: role in cell death and drug responses》。源站首次发布：2025-10-10。
【数据内容】
源站原始描述：This dataset contains the RNA-seq data used in the study titled “Functional characterization of BAP1 mutations in genome edited cholangiocarcinoma organoids: role in cell death and drug responses.” Organoids derived from cholangiocarcinoma patients were genome-edited to model different BAP1 statuses (wild-type and mutant, three dupalication for every group). RNA was extracted and sequenced to explore BAP1-dependent transcriptional changes
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 6.48 MB。数据集 DOI：10.17632/nvg7zsz27v.1。
【获取与许可】
源站页面：https://data.mendeley.com/datasets/nvg7zsz27v
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站：https://data.mendeley.com/datasets/nvg7zsz27v
标准获取流程：
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- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集包含一项研究中所使用的RNA-seq数据，该研究旨在功能表征BAP1突变在基因组编辑胆管癌类器官中的作用，特别是对细胞死亡和药物反应的影响。数据来源于从胆管癌患者衍生的类器官，这些类器官经过基因组编辑以模拟不同的BAP1状态（野生型和突变型，每组有三个重复）。通过提取并测序RNA，该数据集用于探索BAP1依赖的转录组变化，主要研究方向包括胆管癌的分子机制、BAP1基因功能以及药物反应的转录组基础。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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