GSE74104 II型睾丸生殖细胞肿瘤甲基化

包含II型睾丸生殖细胞肿瘤DNA甲基化数据,适合睾丸癌表观遗传亚型、起源分析和跨队列验证。 该数据集与睾丸癌高度相关,覆盖表格数据内容,可用于分类、特征筛选、算法评估和临床研究。

Gene Expression OmnibusGene Expression Omnibus
NCBI GEO
2016-01-01 更新
浏览 38
表格分类GPL135349606
GSE74104 Type II TGCT Methylation

基本信息

模态
表格
大小
0.793772482 GB
数据量
213
任务类型
分类
创建/更新时间
2016-01-01

资源简介

GSE74104 II型睾丸生殖细胞肿瘤甲基化

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Imprints and DPPA3 are bypassed during pluripotency- and differentiation-coupled methylation reprogramming in testicular germ cell tumors》。源站首次发布:Oct 16 201。

【数据内容】

源站原始描述:Malignant (type II) testicular germ cell tumors (TGCT) are considered tumors of embryonic germ cell ancestry that diverge morphologically as seminoma (SE), and nonseminomas (NS), the latter including embryonal carcinoma (EC), teratoma (TE), yolk sac tumor (YS) and choriocarcinoma. We have analyzed the genomes and epigenomes of pure histological forms of TGCT (n=130) and 128 matched adjacent normal testicular tissues for TGCT core and subtype-specific DNA methylome profiles and somatic copy numbe…

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个。

【主题与分类】

主题标签:Methylation profiling by genome tiling array、GPL13534、9606。

【适用方向】

结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。

【获取与许可】

源站页面:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE74104

【使用注意】

· 源站最后修改于 Mar 22 201,引用时请注意版本时效。

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源站:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE74104

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

包含II型睾丸生殖细胞肿瘤DNA甲基化数据,适合睾丸癌表观遗传亚型、起源分析和跨队列验证。

数据加载示例(表格/文本类)

import pandas as pd, glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))

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